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Construction of RNA Interference Vector Against Tobacco Mosaic Virus, Potato Virus M and Cucumber Mosaic Virus and Transformation in Pepino (Solanum muricatum Ait.)

TMV、PVM和CMV干扰载体构建及对人参果遗传转化



全 文 :核 农 学 报  2014,28(1):0044 ~ 0051
Journal of Nuclear Agricultural Sciences
收稿日期:2013⁃01⁃21  接受日期:2013⁃03⁃28
基金项目:甘肃省科技支撑计划(1011NKCA077 )
作者简介:高宜峰,男,主要从事作物遗传育种研究。 E⁃mail:354689937@ qq. com
通讯作者:张金文,男,教授,主要从事生物技术在作物育种中应用研究。 E⁃mail:jwzhang305@ 163. com
文章编号:1000⁃8551(2014)01⁃0044⁃08
TMV、PVM和 CMV干扰载体构建及对人参果遗传转化
高宜峰1,2,3   张菲菲3   张金文1,2,3   陆艳梅1,2,3   魏桂民1,2,3   马廷蕊1,2,3
( 1 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室,甘肃 兰州  730070;2 甘肃省干旱生境作物学
重点实验室,甘肃 兰州  730070;3 甘肃农业大学农学院,甘肃 兰州  730070)
摘  要:人参果是以营养器官繁殖为主的多年生草本植物,连年种植易造成多种病毒病积累。 为了寻求
一种能同时抵御多种病毒病的方法,本试验以危害人参果的 3 种主要病毒为研究对象,根据 GenBank中
烟草花叶病毒(TMV)P126 基因、马铃薯 M病毒(PVM)CP 基因和黄瓜花叶病毒(CMV)2b 蛋白基因序
列,利用 E⁃RNAi 网站提供的分析软件,筛选出含有较多有效小干扰 RNA[ siRNA,19 nt]的长 dsRNA
(Long dsRNA)片段作为 RNAi的靶序列。 用重叠延伸 PCR方法将三个靶标片段融合在一起,构建了一
种具有内含子( intro)的反向重复结构和嵌合基因的植物 RNAi 表达载体 pCEIHFR。 将 pCEIHFR 通过
冻融法导入农杆菌 LBA4404 并转化人参果,经过草甘膦筛选和 PCR检测,确认其中的 24 株为转基因阳
性植株。
关键词:烟草花叶病毒;马铃薯 M病毒;黄瓜花叶病毒;ihpRNA;转基因人参果
DOI:10:11869 / j. issn. 100⁃8551. 2014. 01. 0044
    人参果(Solanum muricatum Ait. )系茄科直立半木
质化、高度杂合体的多年生草本植物,从栽培品种的果
实中获取的种子不能繁殖纯种,较少用于生产,通常采
用扦插或者体外微繁技术繁殖。 人参果果肉清香多
汁,低糖、低脂肪,富含硒和钼等多种微量元素,老少皆
宜食用。 人参果的成熟期比其他已知的茄科植物(如
茄子、辣椒和西红柿等)更长,在我国北方多以温室栽
培为主,植株能够连续生长结实近 10 年。 然而,不规
范的无性繁殖及连年高温高湿的栽培环境使田间病毒
病的发生流行日趋严重。
调查研究发现,甘肃省河西走廊的人参果种植区
域出现了大面积病害,表现为植株矮化、节间变短;叶
片皱缩、呈黄绿相嵌的斑驳状;果实僵化、畸形,品质退
化且产量大幅下降。 发病严重的区域植株大面积死
亡,农户经济损失惨重,严重影响人参果产业的发展。
根据其症状初步判断为病毒病感染;酶联免疫吸附实
验和分子生物学检测结果进一步表明该地区人参果植
株主要感染了烟草花叶病毒(TMV)、马铃薯 M 病毒
(PVM)以及黄瓜花叶病毒(CMV)。
RNA 干扰 ( RNAi)是指生物体内的双链 RNA
(dsRNA)在 mRNA 水平上靶基因表达关闭或沉默的
过程[1]。 已有的研究表明,将不同植物病毒的有效核
酸(cDNA)片段拼接成嵌合基因,构建成具有特殊结
构的植物 RNA干扰表达载体转化植物,可以获得同时
抗多种病毒病的转基因植株[2 - 4]。 研究表明,靶标片
段的来源[5 - 6]以及载体的插入片段结构[7 - 10] 影响
RNAi效率。 本试验综合考虑前人研究成果,构建了优
化插入结构的 RNAi 植物表达载体,通过转化人参果
验证,获得了 24 株转基因阳性植株,为后续病毒侵染
实验及获得抗病毒人参果植株奠定了基础。
1  材料和方法
1􀆰 1  材料
人参果感病植株采自甘肃省河西走廊感病区的塑
料大棚。 大肠杆菌 E. coli DH5a和 E. coli K12、中间载
体质粒 pHANIBAL 和表达载体质粒 pCEPSPS 均由本
实验室保存(其中 pCEPSPS 载体是将 pCMBIA1300 载
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  12 期 TMV、PVM和 CMV干扰载体构建及对人参果遗传转化
体中的潮霉素抗性基因(hyg)替换为草甘膦抗性基因
(epsps)的衍生载体)。 RNA 提取试剂盒、小量 DNA
胶回收试剂盒、 高保真 DNA 聚合酶 ( Pfu DNA
Polymerase)及平末端片段 3′端加碱基 A 反应液购自
天根生化科技(北京)有限公司。 Taq DNA 聚合酶、克
隆载体 pMD19 - T、标准 DNA 分子量 Marker、限制性
内切酶、T4 DNA Ligase购自 TaKaRa(大连)有限公司,
其他试剂均为进口或国产分析纯。 PCR 引物合成及
DNA序列测定由生工生物(上海)有限公司完成。
1􀆰 2  方法
1􀆰 2􀆰 1  靶标片段的克隆
1􀆰 2􀆰 1􀆰 1  靶标片段的选择及引物设计  以 GenBank 中
TMV P126 基因 [GI:371786069]、PVM CP 基因 [GI:
361071296]以及 CMV 2b 蛋白基因[GI:83282715]为基
础片段筛选最佳靶标片段,由于后期构建载体需要,分
别将这三个蛋白基因中 XhoⅠ、KpnⅠ、ClaⅠ、XbaⅠ、SacⅠ和
PstⅠ六种酶切位点剔除后的片段输入 RNAi设计网站 E⁃
RNAi,为了控制靶标片段融合后的总长度,在网站中限
定这三个蛋白基因的靶标片段长度范围分别为 200 bp、
300 bp和 250 bp,其它参数为网站默认。 将筛选出的最
佳靶标片段扩增区域(最佳靶标片段信息见表 1)分别
命名为 T、P、C,并分别放入生物学软件 Oligo6􀆰 0 优化引
物,使退火温度相差 2 度以便于融合,并在各引物的 5′
端加上合适的酶切位点以便于酶切链接。 靶标片段的
扩增及融合基因的构建所用到的引物见表 2,送生工生
物(上海)有限公司合成。
表 1  E⁃RNAi 网站给出靶标片段的各项参数
Table 1  The parameters of the target fragment in the E⁃RNAi website gives
靶标基因
Target gene
靶标片段
长度
Product
length / bp
siRNA
总数
siRNAs,19 nt
中靶 siRNA数
On⁃target
“脱靶”
siRNA数
Off⁃target
无目标
siRNA数
No⁃target
有效
siRNA数
Efficient
siRNAs
有效 siRNA
平均分
Avg efficiency
score
低复杂度
区域数
LowComplex
Regions
CAN
重复数
CAN
TMV P126 187 169 0 0 169 167 52􀆰 28 0 0
PVM CP 292 274 0 0 274 261 49􀆰 88 0 0
CMV 2b 234 216 0 0 216 208 52􀆰 21 0 0
    注:综合考虑网站给出的 siRNAs 数、Efficient siRNAs 数和 Avg efficiency score,选择最佳靶标片段。
Note: Selecting the best target fragment through comprehensive considering the overall number of siRNAs and efficient siRNAs and the average efficiency
score of Efficient siRNAs.
表 2  构建载体用到的引物
Table 2  Specific primers for the construction of vector
引物名称
Primers name
引物序列
Primers sequence
产物(代号)
Product(Code)
酶切位点
Restriction sites
T5 - 1
T3 - 1
5′CCG CTCGAG GGAAGTATCATGTGGCCCATT3′
5′CCGTCCACAAGAACAACCTT3′
TMV P126
靶标片段(T)
XhoⅠ

P5 - 1
P3 - 1
5′AAATATGCGCCCAGATCCTAC3′
5′CTTCTTCAGCACAGCCAAGACG3′
PVM CP
靶标片段(P)


C5 - 1
C3 - 1
5′AAGGTCTCACAAGAAGAATCGAC3′
5′GG GGTACC TTACCAGCGAACCAATCTGTATC3′
CMV 2b
靶标片段(C)

KpnⅠ
P5 -1
P3 - 2
5′AAATATGCGCCCAGATCCTAC3′
5′TCTTCTTGTGAGACCTTCTTCTTCAGCACAGCCAAGAC3′
P片段 + C片段
5′端 17 bp碱基(M)


P5 - 1
C3 - 1
5′AAATATGCGCCCAGATCCTAC3′
5′GG GGTACC TTACCAGCGAACCAATCTGTATC3′
融合基因(PC) 无
KpnⅠ
T5 -1
T3 - 2
5′CCG CTCGAG GGAAGTATCATGTGGCCCATT3′
5′GATCTGGGCGCATATTTCCGTCCACAAGAACAACCTT3′
XhoⅠ

T5 - 1
C3 - 1
5′CCG CTCGAG GGAAGTATCATGTGGCCCATT3′
5′GG GGTACC TTACCAGCGAACCAATCTGTATC3′
正向插入片段(F) XhoⅠ
KpnⅠ
T5 -2
C3 - 2
5′GC TCTAGA GGAAGTATCATGTGGCCCATT3′
5′CC ATCGAT TTACCAGCGAACCAATCTGT3′
反向插入片段(R) XbaⅠ
ClaⅠ
    注:下划线代表酶切位点和保护碱基,粗体代表重叠的 17 bp碱基。
Note: The underline representatives restriction sites and protection bases, the bold type representatives overlapping 17 bp nucleotide.
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核  农  学  报 27 卷
1􀆰 2􀆰 1􀆰 2  人参果病叶总 RNA的提取  用天根生化科
技(北京)有限公司的总 RNA 提取试剂盒(目录号:
DP419)提取感病人参果叶片的总 RNA,并用天根生化
科技(北京)有限公司的 cDNA 第一链合成试剂盒(目
录号:KR104)将总 RNA 反转录成 cDNA 备用。 操作
步骤除了在反转录时加入 Random 和 oligo(dT) 15引物
各 1 μL外,其它严格按照试剂盒附带的说明书进行操
作。
1􀆰 2􀆰 1􀆰 3  靶标片段 T、P、C的扩增  以表 2 所示 T5 -
1 / T3 - 1、P5 - 1 / P3 - 1 和 C5 - 1 / C3 - 1 序列为上 /下
游引物,以 cDNA 第一链为模板,摸索出最佳的 PCR
扩增体系为:5 μL 10 × PCR Buffer(Mg2 + Plus),4 μL
dNTP Mixture(各 2􀆰 5 mmol·L - 1),上 /下游引物(各 10
pmol·μL - 1 )各 1 μL,0􀆰 25 μL TaKaRa Taq (5 U·
μL - 1),0􀆰 1 μg ~ 1 μg 模板,加灭菌蒸馏水至 50 μL。
PCR反应条件为:94℃预变性 3 min;94℃ 30 s,退火温
度分别为 55􀆰 9℃ / 56􀆰 6℃ / 55􀆰 5℃ 30 s,72℃ 1 min,30
个循环数;72℃延伸 5 min;16℃保存。 取 5 μL PCR产
物进行琼脂糖凝胶电泳检测,分别回收目的条带连接
pMD19 - T载体并送生工生物(上海)有限公司测序。
1􀆰 2􀆰 2  靶标片段 T、P、C 的融合以及反向插入片段 R
的合成  采用重叠延伸 PCR 技术( splicing⁃by⁃overlap
extension PCR,SOE⁃PCR),首先构建融合基因 PC,然
后再构建正向插入片段 F。
以 P5 - 1 / P3 - 2 为上 /下游引物,以靶标片段 P
为模版,合成 3‘端与靶标片段 C 5’端重叠 17 bp 碱基
的片段 M;以 T5 - 1 / T3 - 2 为上 /下游引物,靶标片段
T为模板,合成 3’端与片段 M 5’端重叠 17 bp 碱基的
片段 N。
1􀆰 2􀆰 2􀆰 1  靶标片段 P、C融合  以片段 M和靶标片段
C为模板,两步 PCR法构建融合基因 PC。 第一步反应
体系为:2􀆰 5 μL 10 × PCR Buffer ( Mg2 + Plus),2 μL
dNTP Mixture (各 2􀆰 5 mmol·L - 1 ),0􀆰 5 μL Pfu DNA
Polymerase(2􀆰 5 U·μL - 1),加灭菌蒸馏水至 25 μL。 第
一步反应条件为:94℃ 3 min; 94℃ 30 sec,57℃ 30 s,
72℃ 1 min,10 cycles;72℃ 5 min;16℃保存。 第二步
反应体系为:在第一步反应产物内,补充加入以下试
剂:2􀆰 5 μL 10 × PCR Buffer (Mg2 + Plus),2 μL dNTP
Mixture(各 2􀆰 5 mmol·L - 1),P5 - 1(10 pmol·μL - 1)和
C3 - 1 (10 pmol·μL - 1 )各 1 μL;0􀆰 5 μL Pfu DNA
Polymerase(2􀆰 5 U·μL - 1);加灭菌蒸馏水至 50 μL。 第
二步反应条件为:94℃ 3 min;94℃ 30 sec,57℃ 30 s,
72℃ 1 min,20 cycles;72℃ 5 min;16℃保存。 取 5 μL
PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,回收目标片段。
1􀆰 2􀆰 2􀆰 2  靶标片段 T、PC 融合   以靶标片段 T 和融
合基因 PC为模板,两步 PCR法构建正向插入片段 F:
方法参照靶标片段 P、C的融合,只是将第一步反应体
系的模板改为 N和 PC,第一步反应条件的退火温度改
为 46 度;第二步反应体系上 /下游引物改为 T5 - 1 / C3
- 1,第二步反应条件退火温度改为 60℃。 回收目标
片段,即为正向插入片段 F。 用平末端片段 3′端加 A
反应液在 F的 3′端添加 A碱基,连接至 pMD19 - T 载
体,酶切检测正确后送生工生物(上海)有限公司测
序,并将重组子命名为 pMD19T⁃F。
1􀆰 2􀆰 2􀆰 3  反向插入片段 R 的合成  以正向插入片段
F为模板,T5 - 2 / C3 - 2 为上 /下游引物,扩增反向插
入片段 R。 并将反向插入片段 R 连接入 T -载体,经
酶切检测正确后,将重组子命名为 pMD19T⁃R。
1􀆰 2􀆰 3  RNAi中间载体的构建  用 XhoⅠ/ KpnⅠ分别
消化连接有正向插入片段 F 的 T -载体 pMD19T⁃F 和
含有 pdk内含子(intro)的质粒载体 pHANNIBAL,回收
目的片段,经 T4 DNA 连接酶连接,获得具有内含子
(intro)和正向插入片段的重组子,经酶切鉴定正确后
命名为 pHAIF;用 ClaⅠ/ XbaⅠ分别消化连接有反向
插入片段 R的 T -载体 pMD19T⁃R 和载体 pHAIF,回
收目的片段,经 T4 DNA连接酶连接,获得具有内含子
(intro)连接的正、反向插入片段的重组子 RNAi 中间
载体,经酶切鉴定正确后命名为 pHAIFR。
1􀆰 2􀆰 4  RNAi表达载体的构建   用 SacⅠ/ PstⅠ分别
消化载体 pHAIFR 和 pCEPSPS,回收目的片段,经 T4
DNA连接酶连接,获得具有内含子连接的发卡 RNA
(intron splicing hpRNA,ihpRNA)结构的重组子 RNAi
表达载体,经酶切鉴定正确后送生工生物(上海)有限
公司测序,并将重组子命名为 pCEIHFR(图 1)。
1􀆰 2􀆰 5  RNAi表达载体转化农杆菌及鉴定  用冻融法
将 pCEIHFR转化农杆菌 LBA4404,转化细胞均匀涂布
于含有链霉素和利福平的 YEP固体培养基,28℃培养
2 d后,挑取单克隆接种到含有相同浓度的链霉素和
利福平的 YEP 液体培养基,28℃震荡培养 2 d 后提取
质粒,分别用特异引物 T5 - 1 / T3 - 1、P5 - 1 / P3 - 1、C5
- 1 / C3 - 1、P5 - 1 / C3 - 1 和 T5 - 1 / C3 - 1 扩增质粒,
鉴定阳性克隆。
1􀆰 2􀆰 6  农杆菌介导的人参果茎段遗传转化及鉴定 
以人参果试管苗茎段(去腋芽)为受体材料进行农杆
菌遗传转化,激素配方参照 Atkinson 等[11]的研究,筛
选培养基中加入 50 μmol·L - 1草甘膦。 当获得的抗性
幼苗长到 1 cm 左右时,切下转入生根培养基(MS +
0􀆰 3 mg·L - 1 IBA + 30 μmol·L - 1草甘膦)进行生根筛选
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  12 期 TMV、PVM和 CMV干扰载体构建及对人参果遗传转化
注:RB:右边界;OCS⁃ter:OCS 终止子;Anti⁃Sense:反向插入片段;pdk intro:PDK内含子;Sense:正向插入片段;35S Pro:CaMV 35S 启动子;
EPSPS:草甘膦抗性基因;35S ter:CaMV35S终止子;LB:左边界。
Note: RB: Right roarder; COS⁃ter: OCS terminator; Anti⁃sense: Fragment in anti⁃sense orientation; pdk intro; Sense: Fragment in sense orientation;
35S Pro: CaMV 35S promoter; EPSPS: Glyphosate resistance gene; 35S⁃ter: CaMV 35S terminator; LB: Left roarder.
图 1  pCEIHFR表达载体结构示意图
Fig. 1  Structure map of pCEIHFR expressing vector
直至形成完整再生植株。 以提取再生植株叶片基因组
DNA为模板,分别以 T5 - 1 / T3 - 1、P5 - 1 / P3 - 1 和
C5 - 1 / C3 - 1 为上 /下游引物进行 PCR 扩增,检测阳
性克隆。
2  结果与分析
2􀆰 1  靶标片段 T、P、C的克隆
以人参果感病叶片的总 RNA 为模版(图 2 泳道
1、2),经反转录获得 cDNA第一链,再以 cDNA第一链
为模板,分别以 T5 - 1 / T 3 - 1、P5 - 1 / P3 - 1、C5 - 1 /
C3 - 1 为上 /下游引物扩增到长度(含有酶切位点和保
护碱基)约为 200 bp(图 2 泳道 3、4)、300 bp(图 2 泳
道 5、6)和 250 bp(图 2 泳道 7、8)的特异片段,与预期
靶标片段大小一致。 回收扩增片段,并与克隆载体
pMD19 - T 连接,送生工生物(上海)有限公司测序。
测序结果分别与 GeneBank 中 TMV P126 基因 [ GI:
161168450]、PVM CP 基因[GI:361071296]、CMV 2b
蛋白基因 [ GI: 115335088 ] 的序列同源性达到了
99% 、99%和 94% ,说明成功克隆到了靶标片段。
2􀆰 2  靶标片段 T、P、C 的融合以及反向插入片段 R
的合成
采用重叠延伸 PCR 技术 ( splicing⁃by⁃overlap
extension,SOE),连接 PVM CP和 CMV 2b 的靶标片段
P和 C,得到大小约为 500 bp(图 3 泳道 1、2)的融合基
因 PC,同样方法连接 TMV P126 靶标片段 T和融合基
因 PC,构建正向插入片段 F,大小约为 700 bp(图 3 泳
道 3、4),回收片段 F并与 pMD19 - T载体连接,经 Xho
Ⅰ/ KpnⅠ双酶切鉴定(图 3 泳道 5),送生工测序后有
两个碱基发生突变,由于融合片段不需要在生物体内
表达蛋白,不影响后续实验,并将重组子命名为
注:1,2:RNA电泳图片;M:DL1000 DNA 分子标准;3,4:靶
标片段 T扩增条带;5,6:靶标片段 P扩增条带;7,8:靶标片
      段 C扩增条带。
Note: 1, 2: RNA electrophoretogram; M: DL1000 DNA
marker; 3,4: Target sequence T; 5,6: Target sequence P;
      7,8: Target sequence C.
图 2  提取 RNA检测和靶标片段检测
Fig. 2  Detection of RNA and Target sequence
pMD19T⁃F。
然后再以正向插入片段 F 为模板,T5 - 2 / C3 - 2
为上 /下游引物,扩增反向插入片段 R,回收 R 片段并
与 pMD19 - T 载体连接,酶切条带与预期大小一致
(图 3 泳道 6),说明成功克隆到反向插入片段 R,并将
重组子命名为 pMD19T⁃R。
2􀆰 3  RNAi中间载体 pHAIFR和表达载体 pCEIHFR
的构建
2􀆰 3􀆰 1  RNAi中间载体 pHAIFR的构建
2􀆰 3􀆰 1􀆰 1   正向片段 F 插入 pHANNIBAL 质粒   用
XhoⅠ/ KpnⅠ 分 别 消 化 载 体 pMD19T⁃F 和 载 体
pHANNIBAL,回收目的片段,经 T4 DNA 连接酶连接
后得到载体 pHAIF,克隆转化,提取质粒,分别进行
XhoⅠ单酶切检测(图 4 泳道 1)、XhoⅠ/ KpnⅠ双酶切
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核  农  学  报 27 卷
注:M1,M2:DL1000 DNA分子标准;M3:DL5000 DNA 分子标准;1,
2:靶标片段 P和 C融合基因;3,4:靶标片段 T、P和 C 融合基因;5:
pMD19T⁃F经 XhoⅠ/ KpnⅠ双酶切检测;6:pMD19T⁃R 经 ClaⅠ/ Xba
      Ⅰ双酶切检测。
Note: M1,M2: DL1000 DNA marker; M3: DL5000 DNA marker; 1,2:
The fusion gene of P and C; 3,4: The fusion gene of T、P and C; 5:
Restriction analysis of pMD19T⁃F; 6: Restriction analysis of pMD19T⁃R.
图 3  靶标片段的融合及酶切鉴定
Fig. 3  The fusion of target fragment then restriction
analysis of pMD19T⁃F and pMD19T⁃R
检测(图 4 泳道 2)、XhoⅠ/ XbaⅠ双酶切检测(图 4 泳
道 3),得到的条带和预期大小一致。
2􀆰 3􀆰 1􀆰 2  反向片段 R插入 pHANNIBAL质粒  用 Cla
Ⅰ/ XbaⅠ分别消化载体 pMD19T⁃F 和载体 pHAIF,回
收目的片段,经 T4 DNA 连接酶连接,构建了 RNAi 中
间载体 pHAIFR,克隆转化,提取质粒,分别进行 ClaⅠ
单酶切检测(图 4 泳道 4),ClaⅠ/ XbaⅠ双酶切检测
(图 4 泳道 5),XhoⅠ/ XbaⅠ双酶切检测(图 4 泳道
6),得到的条带和预期大小一致。
2􀆰 3􀆰 2  RNAi表达载体 pCEIHFR 的获得   用 SacⅠ/
PstⅠ分别消化载体 pHAIFR 和载体 pCEPSPS,回收目
的片段,经 T4 DNA 连接酶连接,构建了植物表达载体
pCEIHFR,分别进行 PstⅠ/ SacⅠ双酶切检测(图 4 泳
道 7),KpnⅠ/ XbaⅠ双酶切检测(图 4 泳道 8),SacⅠ
单酶切检测(图 4 泳道 9),得到和预期大小一致的条
带。 并对 pCEIHFR进行测序,结果表明已成功将启动
子、终止子和发卡结构转入载体 pCEPSPS。
2􀆰 4  RNAi表达载体 pCEIHFR转化农杆菌及其鉴定
将 RNAi 表达载体 pCEIHFR 转化农杆菌菌株
LBA4404,提取质粒,分别用引物 T5 - 1 / T3 - 1、P5 -
1 / P3 - 1、 C5 - 1 / C3 - 1、P5 - 1 / C3 - 1 和 T5 - 1 / C3 -
1 进行 PCR鉴定,目标条带大小与预期一致(图 5 泳
道 1、2、3、4、5),证明目标载体已成功转入农杆菌。
2􀆰 5  转化再生苗的获得及检测
通过对人参果试管苗茎段进行遗传转化,将获得
注:M:DL10000 DNA分子标准;1:重组质粒 pHAIF经 XhoⅠ单
酶切鉴定;2:重组质粒 pHAIF 经 XhoⅠ/ KpnⅠ双酶切鉴定;3:
重组质粒 pHAIF 经 XhoⅠ/ XbaⅠ双酶切鉴定;4:重组质粒
pHAIFR经 ClaⅠ单酶切鉴定;5:重组质粒 pHAIFR 经 ClaⅠ/
XbaⅠ双酶切鉴定;6:重组质粒 pHAIFR 经 XhoⅠ/ XbaⅠ双酶
切鉴定;7:重组表达载体 pCEIHFR 经 PstⅠ/ SacⅠ双酶切鉴
定;8:重组表达载体 pCEIHFR经 KpnⅠ/ XbaⅠ双酶切鉴定;9:
    重组表达载体 pCEIHFR经 SacⅠ单酶切鉴定。
Note: M: DL10000 DNA marker; 1: Recombinant plasmid pHAIF
digested by XhoⅠ; 2: Recombinant plasmid pHAIF digested by
XhoⅠand KpnⅠ; 3: Recombinant plasmid pHAIF digested by
XhoⅠand XbaⅠ; 4: Recombinant plasmid pHAIFR digested by
ClaⅠ; 5: Recombinant plasmid pHAIFR digested by ClaⅠand
XbaⅠ; 6: Recombinant plasmid pHAIFR digested by XhoⅠand
XbaⅠ; 7: Recombinant plasmid pCEIHFR digested by PstⅠand
SacⅠ; 8: Recombinant plasmid pCEIHFR digested by KpnⅠand
  XbaⅠ; 9: Recombinant plasmid pCEIHFR digested by SacⅠ.
图 4  重组质粒 pHAIF、pHAIFR和
pCEIHFR酶切鉴定
Fig. 4  Identification of recombinant plasmid
pHAIF、pHAIFR and pCEIHFR
的 50 株长度约为 1 cm的再生幼苗转接到含 30 μmol·
L - 1草甘膦的生根筛选培养基,成活 45 株完整植株
(图 6)。 提取这 45 株再生植株的叶片基因组总 DNA,
分别以 T5 - 1 / T3 - 1、P5 - 1 / P3 - 1 和 C5 - 1 / C3 - 1
为上 /下游引物进行 PCR鉴定,有 24 株能够完全扩增
出长度分别约为 200 bp、300 bp 和 250 bp 的特异条
带,而作为阴性对照的非转基因植株则未出现相应的
条带(图 7,仅列出部分扩增结果),初步说明外源基因
已整合到这 24 株再生植株中。
3  讨论
RNAi是由 dsRNA引发的细胞内 mRNA特异降解
现象[12 - 14]。 利用 RNAi 技术将不同病毒或同一病毒
不同株系的有效核酸片段融合,构建具有内含子和反
向重复结构的植物表达载体转化植物,获得的转基因
84
  12 期 TMV、PVM和 CMV干扰载体构建及对人参果遗传转化
注:M:DL1000 DNA 分子标准;1:T5 - 1 / T3 - 1 作引物的 PCR 产
物;2:P5 - 1 / P3 - 1 作引物的 PCR 产物;3:C5 - 1 / C3 - 1 作引物
的 PCR产物;4:P5 - 1 / C3 - 1 作引物的 PCR产物;5:T5 - 1 / C3 -
      1 作引物的 PCR产物。
Note: M: DL1000 DNA marker; 1: PCR products using primers of T5
- 1 / T3 - 1; 2: PCR products using primers of P5 - 1 / P3 - 1; 3:
PCR products using primers of C5 - 1 / C3 - 1; 4: PCR products using
primers of P5 - 1 / C3 - 1; 5: PCR products using primers of T5 - 1 /
      C3 - 1.
图 5  pCEIHFR转化农杆菌菌株
LBA4404 阳性克隆的 PCR鉴定
Fig. 5  PCR identification of positive clones of pCEIHFR
transformed into Agrobacterium strain LBA4404
植株具有同时抗多种病毒的能力,还兼具抗性强(近
注:A:农杆菌侵染;B:愈伤组织诱导;C:芽分化;D ~ F:生根及成苗。
Note: A: Agrobacterium infection; B: Callus induction; C: Shoot regeneration; D ~ F: Rooting and seedling.
图 6  遗传转化、选择及再生人参果植株获得
Fig. 6  Transformation, selection, and regeneration of transgenic Pepino(Solanum muricatum)
似免疫)、抗性持久、生物安全性高等优点[2 - 3]。 但是,
植物病毒编码的 RNA 沉默抑制子(Viral suppressor of
RNA silencing, VSR)能够抑制宿主的基因沉默,抵抗
由基因沉默介导的宿主对病毒的抗性。 已知 TMV 编
码的 VSR P126 蛋白[15] 和 CMV 编码的 VSR 2b 蛋
白[16]可通过与宿主基因沉默通路中的 RNA或者关键
蛋白分子(如 AGO蛋白、DCL 酶)相互作用,发挥抑制
宿主对病毒的抗性以及干扰宿主正常的基因表达调控
的功能[17 - 20],因此,本试验从 TMV 和 CMV 的 VSR 中
选取靶标片段,利用 RNAi技术将 VSR降解,抑制其功
能的发挥,提高 RNAi抗病毒效果。 在前人的 RNAi实
验中,从 P126[21]和 2b[22]蛋白基因中选取靶标片段也
获得了抗性植株,但本试验在靶标片段选取上与前人
的试验有所不同,抗性效果有待验证。 笔者在对 PVM
的靶标片段选择时,还未发现 PVM VSR 的相关报道,
但已有研究表明,转化不同病毒外壳蛋白基因(CP)的
全部或部分基因片段,均能获得高度抗病的转基因植
株[3 - 4,23 - 24],因此本实验从 PVM 的 CP 中选取靶标片
段。 经过 Blast分析,P126 基因、CP 基因和 2b 蛋白基
因分别在 TMV、PVM 和 CMV 不同株系的基因组中都
很保守,可以有效提高抗病毒谱。
哺乳动物细胞内,较长的 dsRNA(多于 29 个核苷
酸)会导致非特异性基因沉默,即“脱靶”(off⁃target)效
应[25],只有大约 21 个核苷酸的 siRNA 才能有效引发
特异性基因沉默;而非哺乳动物细胞不需要考虑 off⁃
target效应[26],可以利用较长的双链 RNA 直接诱导
RNAi而无需合成 siRNA,因此,设计非哺乳动物细胞
RNAi试验的步骤比较简便,只需通过目的基因体外转
录得到所需要的 dsRNA,再通过浸染、注射或转染靶
细胞即可实现 RNAi 等[27]。 Wesley 等[7]以及 Smith
等[8]的研究成果也支持上述观点,他们研究表明,在
94
核  农  学  报 27 卷
注:M:DL1000 DNA分子标准;1 ~ 7:转基因植株;N:非转化植株。
Note: M: DL1000 DNA marker; 1 ~ 7: Transgenic plants; N: Untransformed plant.
图 7  部分转基因人参果中 T(A)、P(B)和 C基因(C)检测
Fig. 7  PCR products of T gene(A),P gene (B) and C gene (C) in transgenic Pepino(Solanum muricatum)
许多植物中,发卡 RNA 结构(hpRNA)的正 /反义壁长
度在 98 nt和 853 nt之间时都能产生有效的沉默效应,
并且在对单一植物物种的 RNAi 试验中,包含内含子
的发卡 RNA结构(ihpRNA)对植物的沉默数量比例更
大,能够达到 90% ~100% 。 Hirai等[9]以及李云等[10]
的研究进一步发现,当 ihpRNA 的茎、环长度比例(茎
环比)在 2∶ 1和 1∶ 2之间时,产生的干扰效果更好。
4  结论
本研究利用 E⁃RNAi 网站[28 - 29] ( http: / / www.
dkfz. de / signaling / e⁃rnai3 / / )提供的分析软件,对 TMV
P126、PVM CP和 CMV 2b的高效干扰靶标片段进行预
测和筛选,从网站给出结果中选取含有较多有效
siRNA的长 dsRNA( long dsRNA)区域作为靶标片段,
采用重叠 PCR法将靶标片段融合,成功构建了具有优
化插入结构的 RNAi植物表达载体 pCEIHFR。 在后期
遗传转化中,激素浓度参照 Atkinson 等[11]的研究,并
在分化和生根培养基中加入合适浓度的草甘膦进行直
接筛选,成功获得 45 株完整的人参果再生植株。 经过
PCR检测,其中 24 株为转基因阳性植株,为利用 RNAi
技术培育抗病毒人参果植株奠定了基础。
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Construction of RNA Interference Vector Against Tobacco Mosaic Virus,
Potato Virus M and Cucumber Mosaic Virus and Transformation in
Pepino (Solanum muricatum Ait. )
GAO Yi⁃feng1,2,3   ZHANG Fei⁃fei3   ZHANG Jin⁃wen1,2,3   LU Yan⁃mei1,2,3
WEI Gui⁃min1,2,3   MA Ting⁃Rui1,2,3
( 1Gansu Key Lab of Crop Improvement&Germplasm Enhancement, Lanzhou, Gansu  730070; 2Gansu Provincial Key Lab of
Aridland Crop Science, Lanzhou, Gansu  730070; 3College of Agronomy, Gansu Agricultural University, Lanzhou, Gansu  730070)
Abstract:Pepino(Solanum muricatum) is perennial herb with vegetative propagation. It is easy to be infected by many
viruses due to continuous planting. In order to find a new method for defending viral diseases, the purpose of this
experiment was to study three kinds of harmful viruses which were common in pepino. Based on the genes sequence of
Tobacco mosaic virus (TMV) P126, potato virus M (PVM) CP and Cucumber mosaic virus (CMV) 2b in GenBank, the
RNAi design website E⁃RNAi was used to search for Long dsRNA fragment that containing the more effective small
interfering RNA[siRNA, long 19nt] fragment as the RNAi target sequences. The splicing⁃by⁃overlap extension PCR was
used to fuse three target sequences in together, and at the same time to construct a inverted repetitive structure with pdk
(pyruvate orthophosphate dikinase) intro of plant RNAi expression vector pCEIHFR which was supposed to form intron
splicing hpRNA (ihpRNA) after transcription. The recombinant plant⁃expression vector pCEIHFR was introduced into
Agrobacterium tumefaciens LBA4404 by direct transferring, and then the target cDNA with inverted repeat was
introduced into pepino. Twenty four transgenic plants were confirmed by glyphosate resistant selection and PCR testing.
Key words:Tobacco Mosaic Virus; Potato Virus M; Cucumber Mosaic Virus; ihpRNA; Transgenic Pepino
15