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植物NAC转录因子家族在抗逆响应中的功能



全 文 :植物生理学报 Plant Physiology Journal 2014, 50 (10): 1494~1500  doi: 10.13592/j.cnki.ppj.2014.03631494
收稿 2014-08-20  修定 2014-09-23
资助 中央高校基本科研业务费专项资金(DL11EA019)和国家
自然科学基金(31170569)。
* 通讯作者(E-mail: sfandi@163.com; Tel: 0451-82191755)。
植物NAC转录因子家族在抗逆响应中的功能
王瑞芳, 胡银松, 高文蕊, 张宜欣, 宋兴舜*
东北林业大学生命科学学院, 哈尔滨150040
摘要: NAC转录因子是植物特有的一类转录因子, 其共同特点是在N端含有一段高度保守的约150个氨基酸组成的NAC结
构域, 而C端为高度多样化的转录调控区。NAC转录因子是具有多种生物功能的新型转录因子, 在植物细胞次生壁的生
长、植物顶端分生组织形成、植物侧根发育等生长发育过程以及作物的品质改良中具有重要作用。此外, 研究表明NAC
转录因子在植物抗逆反应中也具有重要的调控作用。本文综述了近年来NAC转录因子家族在植物抗逆中的研究进展。
关键词: 植物NAC转录因子; 非生物胁迫; 生物胁迫
Functions of NAC Transcription Factors Family in Stress Responses in Plants
WANG Rui-Fang, HU Yin-Song, GAO Wen-Rui, ZHANG Yi-Xin, SONG Xing-Shun*
College of Life Sciences, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China
Abstract: NAC transcription factors belong to a unique class of transcription factors in plants. The common
characteristic of the NAC proteins is the presence of a conserved NAC domain, comprising of about 150 amino
acids in N-terminals and a highly variable transcriptional regulation region in C-terminals. NAC transcription
factors play important roles in multiple biological processes such as secondary cell wall, plant apical meristem
formation, lateral root development and crop quality improvement. Besides, it has been shown that NAC tran-
scription factors play an indispensable role in plant resistance to adverse reaction. In this paper, we reviewed
the recent study progress on NAC transcription factors family in stress responses in plants.
Key words: NAC transcription factors in plants; abiotic stress; biotic stress
植物的生长发育不仅受遗传因子的控制, 同
时与环境条件因素密切相关。影响植物生长发育
的环境因素包括温度、光照、空气、水分、土壤
养分和生物因子等, 这些逆境通过细胞失水、膜
系统破坏、酶活性变化、光合作用下降等生理生
化代谢从而影响种子萌发、植株生长、开花结
果、产量和品质形成等过程, 并引起植株群体生
长发育的不均一性。在长期的进化过程中, 植物
形成了一系列生理、生化、代谢及防御机制, 以
适应和抵御各种生物和非生物逆境。在众多的抗
逆机制中, 基因表达的转录调控在植物适应环境
和抵御逆境胁迫中起重要作用。植物基因组中存
在大量编码不同类别转录因子的基因, 如拟南芥
(Arabidopsis thaliana)大约27 000个基因中有1 500
个以上基因编码转录因子, 约占拟南芥基因组的
5.9%, 而在植物特异蛋白中, 转录因子占到13%
(Riechmann等2000)。NAC转录因子家族, 是近10
年新发现的最大的一类植物特有的转录因子(Du-
val等2002), 具有植物特异性。NAC蛋白在许多生
物过程中发挥重要作用, 如植物的开花、次生壁
的形成、茎顶端分生组织的生长、侧根伸长、衰
老和信号转导等(Olsen等2005a, b)。迄今为止已在
拟南芥中至少发现107个NAC基因(Riechmann和
Ratcliffe 2000), 烟草(Nicotiana tabacum)中也包含
152个NAC基因(Rushton等2008), 而水稻(Oryza sa-
tiva)中含有140个(Fang等2008)。近年来, 有关该
基因家族在其他植物上的研究也得到了重视。
1 NAC转录因子
1.1 NAC转录因子的基本结构特征
NAC家族的命名源于Souer等(1996)从矮牵牛
(Petunia hybrida)中克隆得到第一个影响矮牵牛顶
端分生组织的形成与分化的NAM (No Apical Meri-
stem)基因, 该基因编码蛋白的N端中都含约150个
高度保守的氨基酸序列, 而C端序列高度多样化
(图1)。后来在拟南芥中发现ATAF1、ATAF2以及
CUC2 (cup-shaped cotyledon)基因也有与NAM相似
王瑞芳等: 植物NAC转录因子家族在抗逆响应中的功能 1495
的结构, 因此把具有这样结构特征的称为NAC结
构域(Aida等1997), 并将包含NAC结构域的蛋白称
为NAC转录因子。
在全基因组分析中, Ooka等(2003)根据NAC
结构域的氨基酸序列的相似性将NAC转录因子家
族分成I组和II组, 其NAC结构域包含有5个保守的
亚区域(A、B、C、D、E), 亚结构域C、D序列中
含有核定位信号, 可能与转录因子核定位及启动
子上特定顺式元件的识别有关。NAC结构域不同
于经典的螺旋-转角-螺旋的结构特征, 每个单体由
多个螺旋环绕一个反向平行的β-折叠构成, 它们通
过盐桥等作用形成具有功能的NAC蛋白二聚体,
该二聚体表面一侧富含正电荷, 可能与DNA的结
合有关。而其C端则为高度变异和具有转录激活
功能的调控区, 该端的共同特点是由一些简单氨
基酸如丝氨酸、苏氨酸、脯氨酸、谷氨酸等重复
出现的频率高(Nakashima等2012; Nuruzzaman等
2010; Christiansen等2011)。最新的研究发现一些
NAC蛋白的C-末端还表现出蛋白结合活性并具跨
膜(TM)元件(Seo和Park 2010; Kim等2010; Puranik
等2011)。
在cDNA与全基因组的对比中发现, 绝大部分
NAC基因开放阅读框中包含有3个外显子和2个内
含子, 前两个外显子编码保守的N-末端区域(NAC
结构域), 最后一个编码高度多样化的转录激活结
构域C-末端区(Yu等2014)。而另外有一小部分
NAC基因的C端含有一些额外的结构域, 编码一些
相应生化功能的蛋白。
图1 NAC家族蛋白质序列对比
Fig.1 Protein sequence comparison of NAC family
1: CcNAC1 (AHJ38168.1); 2: PmNAC (NP_001280200.1); 3: CsNAC2 (XP_004161162.1); 4: MrNAC5 (AFY26893.1); 5: CaNAC5
(ACS94038.1); 6: ChNAM (AEF80001.1); 7: XP_004149802.1; 8: CsNAC6 (XP_004172335.1); 9: AHJ38169.1; 10: XP_004290890.1; 11: Mn-
NAC2 (EXB60108.1); 12: BnNAC (AIA57507.1)。
植物生理学报1496
1.2 NAC转录因子的定位
Kikuchi等(2000)推测在NAC结构域的C和D亚
域中包含两个拟定的核定位(NLSs)。为了证实这
一点预测 , 在洋葱表皮细胞上瞬时表达C a r -
NAC2::GFP绿色荧光融合蛋白和GFP融合蛋白, 发
现GFP融合蛋白均匀地分布在整个细胞中, 而Car-
NAC2::GFP绿色荧光融合蛋白定位于细胞核。这
一结果表明, CarNAC2蛋白是一种核蛋白。Qin等
(2014)将麻风树的JcNAC1基因的N-末端序列与
35S::GFP相连(35S::JcNAC1::GFP), 和35S::GFP分
别转到烟草的叶片中, 连有JcNAC1的GFP绿色荧
光信号仅仅在细胞核中发现, 证明N-末端的NLS信
号是在细胞核中。推测NAC转录因子进入细胞核
中发挥重要的作用, 由亚细胞定位结果推断, 具有
相近生物学功能NAC蛋白更可能定位于相同的亚
细胞结构, 这点与其产生和发挥特定生物学功能
密切相关。但是NAC蛋白不会永久性存在于细胞
核(Lu等2007; Nogueira等2005), 也不会通过C-端
跨膜区域(Lin等2007; Kim等2007, 2006)短暂地与
原生质膜发生联系, 在某种刺激下, 跨膜的NAC转
录因子也会通过蛋白裂解作用, 以一种活性形式
由细胞膜转移到细胞核发挥作用。
2 NAC转录因子的功能
2.1 植物细胞次生壁的生长
NAC转录因子对细胞次生壁的生长起双向作
用, 既能促进次生壁生长又能抑制其生长。有研
究发现多个NAC基因对细胞次生壁的形成起着正
调控作用, ND2/3、MYB103/85/52/54/69/42/43/20
和KNAT7等11个SND1转录因子能促进拟南芥次
生壁正常形成, 这些基因的过量表达, 则促进纤维
中次生壁的增厚; 抑制表达, 能显著减少纤维细胞
次生壁增厚(Kubo等2005)。拟南芥中的ANAC012
和X N D 1对细胞次生壁的形成起到抑制作用 ,
A N A C 0 1 2在植物根和茎的形成层高度表达 ,
ANAC012的表达能显著抑制拟南芥木纤维细胞中
次生壁形成, 但增加了木质部导管的细胞壁厚度
(Ko等2007), XND1在胚轴原生木质部特异性表达,
抑制木质部导管细胞次生壁的形成, 薄壁细胞缺
乏次生壁增厚, 植株严重矮化, 这可能与木质部导
管的缺失有关, 但韧皮部仍然能形成韧皮部细胞
(Zhao等2008)。
2.2 植物顶端分生组织形成
NAC转录因子家族中的AtNAM与顶端分生
组织形成相关, AtNAM在包含顶端分生组织的整个
胚胎区域表达, 而NAM、CUC1/2只在顶端分生组
织边缘有所表达。Souer等(1996)发现矮牵牛NAM
突变体不能形成茎顶端分生组织, 证明NAM基因
在花的分生组织器官原基的形成中起作用。Aida
等(1997)发现在拟南芥CUC1和CUC2双基因突变
体中, 子叶、萼片和雄蕊融合, 难以形成顶端分生
组织。
2.3 植物侧根发育
NAC基因的表达能够促进植物侧根发育。在
逆境胁迫中NAC基因受诱导, 介导生长素等信号转
导, 以促进侧根发育, 该转录因子可以激活下游生
长素响应基因表达, 过量表达促进侧根发育。拟
南芥AtNAC2的过表达促进侧根发育, 乙烯前体
ACC (l-aminocyclopropane-l-carboxylicacid)能够诱
导AtNAC2的表达, 且在乙烯过量产生系eto1-1中,
mRNA水平表达量增加。AtNAC2还促进或抑制
下游基因的表达。这表明AtNAC2可能在植物侧
根形成过程中同时感受外界环境和内部信号(He
等2005)。NAC1在TIR1 (transport inhibitor respon-
sive protein1)下游为侧根的发育转导生长素信号。
2.4 延缓植物生长
植物NAC基因能够调控细胞分裂, 改变植物
的生命周期。膜蛋白水解和细胞分裂素信号能激
活NTM1 (NAC with transmembrane motif1)的表达,
其在NTM1突变体中, 诱导一系列CDK (cyclin-de-
pendent kinases)抑制子基因表达, 这些基因抑制组
蛋白H4的合成, 从而抑制了细胞分裂, 导致生长延
迟 (Kim等2006)。Saad等 (2013)用0、5和10
μmol·L-1 ABA分别浸泡转SNAC1基因的水稻幼苗
A2、A4和阴性对照NTY12, 在没有加入ABA处理
中, A2、A4和NTY12的根长和株高没有任何差异,
在5 μmol·L-1 ABA浸泡中, 转基因植株根长短于对
照组, 株高也矮于NTY12, 并且在10 μmol·L-1 ABA
处理中, 这种抑制现象更明显。
3 NAC转录因子在植物逆境胁迫中的作用
干旱、高盐、冷害等非生物胁迫和生物胁迫
是影响植物生长发育的主要逆境因子。当植物处
于逆境胁迫下, 植物细胞会感知外界的胁迫信号,
王瑞芳等: 植物NAC转录因子家族在抗逆响应中的功能 1497
通过多种复杂的信号传导途径如ABA、GA、乙
烯和生长素等信号途径, 把信号传递到胁迫应答
的转录因子, 再由各类转录因子启动胁迫应答响
应基因表达, 从而激活植物抗逆反应, 降低逆境对
植物造成的损害。研究发现, NAC转录因子直接
参与或通过调控参与干旱、高盐、冷害应答基因
的表达, 在植物抗干旱、高盐等非生物逆境胁迫
中起重要作用。
3.1 NAC转录因子在干旱胁迫响应中的作用
目前已发现多个NAC家族蛋白参与植物逆境
的响应。有的NAC转录因子可与MYC-like元件结
合, 该元件的核心序列(CATGTG)在拟南芥ERD1
干旱诱导反应应答过程中起作用。从拟南芥中分
离的3个N A C基因 ( A N A C 0 1 9、A N A C 0 5 5和
ANAC072)都受到干旱的诱导表达, 过表达NAC能
显著提高植株的耐旱能力(Tran等2004)。在干旱
响应实验中 , ATAF1的T-DNA插入系ataf1-1和
ataf1-2突变体的抗旱能力恢复率大大高于野生型7
倍多, 同时实时定量分析发现与干旱胁迫响应相
关的COR47、ERD10、KIN1、RD22和RD29A等基
因表达增强(Lu等2007)。另一类NAC转录因子基
因主要在气孔的保卫细胞中被诱导表达, 干旱胁
迫时促进气孔关闭, 但是并不影响光合速率, 因而
抗旱性大为提高, 在生殖生长期严重干旱的情况
下, 过表达SNAC1的转基因水稻坐果率较对照提高
22%~34%, 在营养生长期, 转基因植株也表现出很
强的抗旱(Hu等2006)。
3.2 NAC转录因子在高盐胁迫响应中的作用
转录因子(又称为反式作用因子)是能够与真
核基因启动子区域中顺式作用元件发生特异性相
互作用的DNA结合蛋白, 转录因子之间以及转录
因子与其他相关蛋白之间的相互作用能够激活或
抑制基因转录。其中一类转录因子能同时调控多
个耐盐信号转导途径, 被认为是改良植物耐盐性
最具潜力的一类基因。目前, 越来越多的研究证
明过量表达转录因子基因能够提高植物耐盐性
(Bouaziz等2012)。
信号转导途径是植物感受盐胁迫与诱导耐盐
基因表达之间的联系, 植物通过激活信号转导途
径使细胞在生理生化水平做出反应以适应盐渍环
境(Amtmann等1997), 盐胁迫引发的信号转导过程
起始于细胞膜的信号感受系统, 盐胁迫信号被细
胞膜上的初级信号受体感知后, 首先引起细胞质
中Ca2+浓度、磷脂酶、活性氧、肌醇磷酸等第二
信使变化, 引发细胞磷酸化级联反应, 诱导转录因
子基因表达以调控盐胁迫相关基因的表达, 最终
达到离子和渗透平衡以维持酶活性, 进而对损伤
进行控制和修复, 减轻盐胁迫对植物生长的抑制
作用(Orellana等2010)。
以番茄(Solanumly copersicum)为材料的研究
发现2个盐敏感NAC基因SlNAC1和SlNAM1, 组织
表达谱分析显示SlNAC1在花和成熟的番茄果实中
有高水平的表达。在番茄栽培品种‘Edkawi’中Sl-
NAC1和SlNAM1可以被盐胁迫诱导, 可能在番茄抗
逆中发挥重要作用(Yang等2011)。另外, 有学者从
菊花中克隆到一个NAC转录因子基因DgNAC1, 在
转化烟草的研究中发现, DgNAC1的过表达显著提
高了烟草的耐盐性(Liu等2011)。
3.3 NAC转录因子在冷害胁迫响应中的作用
研究表明, 植物在受到寒冷危害时, 可通过改
变植物组织结构、生物膜组成、胁迫蛋白、活性
氧代谢、渗透调节和类似脱落酸等激素的合成来
提高细胞对各种逆境的抗性。
Hu等(2006)在水稻IRAT109中分离到1个NAC
基因SNAC2, Northern blot启动子活性分析证实
SNAC2受低温诱导表达, 野生型与SNAC2过表达转
基因植株同在4~8 ℃下低温处理5 d后, 野生型全
部死亡, 转基因植株有50%的存活率, 且转基因植
株对ABA的敏感性也显著增强。转基因植株的基
因芯片分析表明, SNAC2转录因子正向调控了许
多抗逆相关基因的表达, 如过氧化物酶、鸟氨酸
转氨酶、钠氢交换蛋白、热激蛋白、GDSL-like脂
肪酶、苯丙胺酸脱氨裂解酶基因等。
Mao等(2012)也从小麦中分离到一个NAC转
录因子基因TaNAC2, 基因表达谱显示其参与冷害
胁迫响应。相比野生型拟南芥, 过表达TaNAC2的
转基因植株对冷害胁迫的耐受力大大增强, 转基
因植株在低温下细胞膜稳定性高。因此, 我们认
为TaNAC2能提高作物对非生物胁迫耐性, 在转基
因育种方面具有很大的应用潜力。
3.4 NAC转录因子在抗病害中的作用
植物易受到细菌、真菌和病毒等病原物的侵
植物生理学报1498
害, 促使植物形成了一系列复杂的抗病机制。在
受到病原菌的侵染时, 植物通常通过水杨酸(sali-
cylic acid, SA)、茉莉酸(jasmonic acid, JA)、乙烯
(ethylene, ET)等抗病信号传导途径来活化一大批
防卫反应基因的协同表达, 从而激活植物的抗病
防卫反应。研究显示, AP2/ERF、bZIP、WRKY等
不同类型的转录因子参与植物抗病反应中防卫基
因的表达调控。近年来, 已发现大量的NAC基因的
表达受到茉莉酸(JA)、水杨酸(SA)以及乙烯(ET)
等激素的诱导, 功能分析证实部分NAC转录因子家
族基因在病害生理中发挥着重要作用。
拟南芥ATAF1的表达受到损伤(Collinge和
Boller 2001)和霉菌的诱导, ataf1-1突变体对病菌的
抗性明显减弱, 说明ATAF1在病害防御上可能有积
极作用(Jensen等2007)。ATAF2的表达受到损伤、
茉莉酸甲酯(MeJA)以及SA的诱导, ATAF2过表达
植株的一些病程相关基因表达水平下降, 对土源
病菌的抗性减弱, 表明ATAF2在植物病害生理中起
负向调控作用(Delessert等2005)。此外, ANAC019
和ANAC055基因能促进2个JA诱导型基因VSP1
(vegetative storage protein 1)和LOX2 (lipoxygenase
2)的转录, 从而提高植株抗病能力(Bu等2008)。与
生物胁迫有关的NAC基因还包括水稻OsNAC6
(Nakashima等2007)、OsNAC019 (Lin等2007)、辣
椒(Capsicum annuum) CaNAC1 (Oh等2005)以及甘
蔗(Saccharum sinense) SsNAC-23 (Nogueira等2005)
等。另外, 有些NAC基因还参与介导植物与病毒的
相互作用。如2个小麦NAC蛋白能与双生病毒
(geminivirus)的RepA蛋白直接结合, 因此被命名为
GRAB1 (gemi-nivirus RepA-binding protein 1)和
GRAB2 (Xie等1999)。拟南芥的NAC蛋白TIP可以
结合芜菁萎缩病毒(turnip crinkle virus, TCV)的衣
壳蛋白, 这种互作介导植株对TCV产生高敏反应
和系统抗性(Ren等2000)。番茄SlNAC1基因的表
达受到卷叶病毒(tomato leaf curl virus, TLCV)诱
导, SlNAC1能与病毒复制增强蛋白(REn)结合, 并
促进其DNA的复制(Selth等2005)。
4 问题与展望
自从植物NAC转录因子发现以来, 人们对其
生物学功能及活性调控的研究已经取得了很大的
进展, 涉及到植物生长发育、防御反应和激素调
节等方面。但是, 目前关于NAC转录因子研究主
要集中在模式植物拟南芥和水稻。而在其他植物
(特别是一些重要的农作物)中NAC转录因子的研
究尚处于基因克隆、序列分析、结构鉴定和表达
分析等层面上(柳展基等2007), 至于其生物学功能
及调控的报道极少。尽管已经揭示了一些NAC转
录因子的功能, 但其复杂的调控系统还有待更深
入研究。
NAC转录因子本身也存在着复杂的活性调控
机制, 如miRNA在转录水平的调控(Tran等2007)、
磷酸化和泛素化修饰及蛋白-蛋白互作等蛋白水平
上的调控机制等(Mitsuda等2011)。深入研究NAC
转录因子的活性调控机制及其调控的下游靶标基
因有助于阐明NAC转录因子在植物抗病抗逆反应
中的作用机制。有些NAC转录因子基因对其中单
个基因的插入突变或RNAi沉默后不会引起任何生
物学表型的变化, 而只有对2个基因同时突变的双
突变体才能表现出可见的表型(Cuperus等2011;
Rhoades等2002)。
综上所述, 尽管NAC基因的功能还有待深入
研究, 但它们在植物遗传工程方面已展现出了巨
大的应用潜力, 利用基因工程手段改变NAC基因表
达水平或NAC蛋白活性有可能获得抗病抗逆转基
因作物新品种或新材料, 提高植株的综合品质。
因此, NAC在植物分子育种中具有巨大的潜在价
值和广阔的应用前景, 为进一步选育和改良植物
的抗逆性奠定了坚实的工作基础。同时, 借助高
通量基因表达分析技术——基因芯片和蛋白芯片,
微阵列、蛋白互作分析以及功能的获得或缺失突
变体分析等技术, 将有助于快速揭开NAC转录因
子在植物生长发育代谢以及逆境应答等过程中的
调控机制及信号转导, 全面的认识NAC基因的调控
网络。
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