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Molecular Detection of Fusarium circinatum, the Causal Agent of Pine Pitch Canker

松树脂溃疡病菌的分子检测


Fusarium circinatum, the causal agent of pitch canker disease, causes several serious diseases of pines. The pathogen infects a variety of vegetative and reproductive pine structures at different stages of maturity and produces a diversity of symptoms. Long distance spread of the disease occurs when materials infected with the pitch canker fungus are transported to pest free-area. Preventing disease spread is important because once pitch canker becomes established in area there is no way to stop it from infecting and killing trees. The objectives of our study was to establish a fast and reliable diagnostic test for the presence of F. circinatum. The oligonucleotide primers G1/G2 (5′-GCGGTGTCGGTGTGCTTGTA-3′/5′-ACTCACGGCCACCAAACCAC-3′), derived from the differentiation of intergenic spacer (IGS) regions within fungi, amplified a single 873 bp product from Fusarium spp The IGS DNA sequences of Fusarium spp. Were gained from GenBank. Oligonucleotide primers S1/S2 (5′-CTTACCTTGGCTCGAGAAGG-3′/5′-CCTACCCTACACCTCTCACT-3′), derived from IGS DNA, amplified a product of 364 bp which was unique to F. circinatum. The nested-PCR using primers G1/G2 and S1/S2 identified F. circinatum from other Fusarium spp This PCR assay was proved to be highly sensitive with the detection limit of 5×10-3 pg·μL-1 genomic DNA or 10 spores·(100 μL)-1 H2O. The result indicates that the nested-PCR could successfully used to detect the presence of F. circinatum directly from infected plant tissue.


全 文 :第 wv卷 第 t期
u s s z年 t 月
林 业 科 学
≥≤Œ∞‘׌„ ≥Œ∂ „∞ ≥Œ‘Œ≤„∞
∂²¯1wv o‘²1t
¤±qou s s z
松树脂溃疡病菌的分子检测 3
廖太林t ou 李百胜u 叶建仁t 纪 睿u 吴翠萍v 安榆林v 陈建东v
kt1 南京林业大学 南京 utssvz ~ u1 江苏昆山出入境检验检疫局 昆山 utxvst ~ v1江苏出入境检验检疫局 南京 utsss|l
关键词 } 松树脂溃疡病菌 ~分子检测 ~巢式 °≤•
中图分类号 }≥zyv1tx 文献标识码 }„ 文章编号 }tsst p zw{{kusszlst p sttt p sx
收稿日期 }ussy p sv p s| ∀
基金项目 }国家质检总局立项课题/松树脂溃疡病随木材传入中国的风险分析及检疫鉴定技术研究0的一部分kusswŒŽszxl ∀
3 感谢南京农业大学王克荣教授 !陈利锋教授提供了部分试验所需的对照菌株 ∀
Μολεχυλαρ ∆ετεχτιον οφ Φυσαριυµ χιρχινατυµ oτηε Χαυσαλ Αγεντ
οφ Πινε Πιτχη Χανκερ
¬¤² פ¬¯¬±tou ¬…¤¬¶«¨ ±ªu ≠¨¬¤±µ¨±t ¬•∏¬u • ∏≤∏¬³¬±ªv „± ≠∏¯¬±v ≤«¨ ± ¬¤±§²±ªv
kt1 Νανϕινγ Φορεστρψ Υνιϖερσιτψ Νανϕινγ utssvz ~u1 Κυνσηαν Εξιτ2ΕντρψΙνσπεχτιον ανδ Θυαραντινε Βυρεαυ
οφ ϑιανγσυ Προϖινχε Κυνσηαν utxvst ~v1 ϑιανγσυ Εξιτ2ΕντρψΙνσπεχτιον ανδ Θυαραντινε Βυρεαυ οφ Χηινα Νανϕινγ utsss|l
Αβστραχτ } Φυσαριυµ χιρχινατυµ o·«¨ ¦¤∏¶¤¯ ¤ª¨ ±·²© ³¬·¦«¦¤±®¨µ§¬¶¨¤¶¨ o¦¤∏¶¨¶¶¨√¨ µ¤¯ ¶¨µ¬²∏¶§¬¶¨¤¶¨¶²© ³¬±¨ ¶q ׫¨
³¤·«²ª¨±¬±©¨¦·¶¤√¤µ¬¨·¼ ²©√¨ ª¨·¤·¬√¨ ¤±§µ¨³µ²§∏¦·¬√¨ ³¬±¨ ¶·µ∏¦·∏µ¨¶¤·§¬©©¨µ¨±·¶·¤ª¨¶²©°¤·∏µ¬·¼¤±§³µ²§∏¦¨¶¤§¬√¨ µ¶¬·¼ ²©
¶¼°³·²°¶q²±ª§¬¶·¤±¦¨ ¶³µ¨¤§²©·«¨ §¬¶¨¤¶¨ ²¦¦∏µ¶º«¨ ± °¤·¨µ¬¤¯¶¬±©¨¦·¨§º¬·«·«¨ ³¬·¦«¦¤±®¨µ©∏±ª∏¶¤µ¨·µ¤±¶³²µ·¨§·²³¨¶·
©µ¨ p¨¤µ¨¤q°µ¨√¨ ±·¬±ª§¬¶¨¤¶¨ ¶³µ¨¤§¬¶¬°³²µ·¤±·¥¨¦¤∏¶¨ ²±¦¨ ³¬·¦«¦¤±®¨µ¥¨¦²°¨ ¶ ¶¨·¤¥¯¬¶«¨§¬± ¤µ¨¤·«¨µ¨ ¬¶±² º¤¼·²¶·²³
¬·©µ²°¬±©¨¦·¬±ª¤±§®¬¯¯¬±ª·µ¨ ¶¨q׫¨ ²¥­¨¦·¬√¨ ¶²©²∏µ¶·∏§¼ º¤¶·² ¶¨·¤¥¯¬¶«¤©¤¶·¤±§µ¨ ¬¯¤¥¯¨§¬¤ª±²¶·¬¦·¨¶·©²µ·«¨ ³µ¨¶¨±¦¨
²© Φq χιρχινατυµ q׫¨ ²¯¬ª²±∏¦¯¨ ²·¬§¨ ³µ¬°¨ µ¶ŠtЊu kxχ2Š≤ŠŠ×Š×≤ŠŠ×Š×Š≤×׊ׄ2vχΠxχ2„≤×≤„≤ŠŠ≤≤„≤≤„„„≤≤„≤2
vχl o§¨µ¬√¨ §©µ²°·«¨ §¬©©¨µ¨±·¬¤·¬²± ²©¬±·¨µª¨±¬¦¶³¤¦¨µkŒŠ≥l µ¨ª¬²±¶º¬·«¬± ©∏±ª¬o¤°³¯¬©¬¨§¤¶¬±ª¯¨{zv ¥³³µ²§∏¦·©µ²°
Φυσαριυµ ¶³³qq׫¨ ŒŠ≥ ⁄‘„ ¶¨ ∏´¨±¦¨¶²© Φυσαριυµ ¶³³q º¨ µ¨ ª¤¬±¨ §©µ²° Š¨ ±…¤±®q ’¯¬ª²±∏¦¯¨ ²·¬§¨ ³µ¬°¨ µ¶≥tΠ≥u kxχ2
≤×ׄ≤≤×׊Š≤×≤Š„Š„„ŠŠ2vχΠxχ2≤≤ׄ≤≤≤ׄ≤„≤≤×≤×≤„≤×2vχl o§¨µ¬√¨ §©µ²° ŒŠ≥ ⁄‘„ o¤°³¯¬©¬¨§¤³µ²§∏¦·²©vyw ¥³
º«¬¦«º¤¶∏±¬´∏¨ ·² Φq χιρχινατυµ q ׫¨ ±¨ ¶·¨§2°≤• ∏¶¬±ª ³µ¬°¨ µ¶ŠtЊu ¤±§ ≥tΠ≥u ¬§¨±·¬©¬¨§ Φq χιρχινατυµ ©µ²° ²·«¨µ
Φυσαριυµ ¶³³qq׫¬¶°≤• ¤¶¶¤¼ º¤¶³µ²√¨ §·²¥¨ «¬ª«¯¼ ¶¨±¶¬·¬√¨ º¬·«·«¨ §¨·¨¦·¬²± ¬¯°¬·²©x ≅ tsp v ³ª#ˏpt ª¨ ±²°¬¦⁄‘„ ²µ
ts ¶³²µ¨¶#ktss ˏlpt ‹u ’ q׫¨ µ¨¶∏¯·¬±§¬¦¤·¨¶·«¤··«¨ ±¨ ¶·¨§2°≤• ¦²∏¯§¶∏¦¦¨¶¶©∏¯¯ ¼ ∏¶¨§·² §¨·¨¦··«¨ ³µ¨¶¨±¦¨ ²© Φq
χιρχινατυµ §¬µ¨¦·¯¼©µ²°¬±©¨¦·¨§³¯¤±··¬¶¶∏¨ q
Κεψ ωορδσ} Φυσαριυµ χιρχινατυµ ~°²¯ ¦¨∏¯¤µ§¨·¨¦·¬²±~±¨ ¶·¨§2°≤•
松树脂溃疡病k Φυσαριυµ χιρχινατυµl为美国 !南非等国外针叶树上发生的一种危险性林木病害k≥·²µ¨µετ
αλqot||w ~∂¬¯­²¨ ± ετ αλqot||wl ∀该病害常引起寄主树干流脂溃疡 !雌花和球果坏死 !种子变质以及苗木枯
死 ∀其病原菌可随种子 !苗木 !病木木材 !媒介生物以及黏附土壤进行远距离传播 ∀日本 t|{|年kŽ²¥¤¼¤¶«¬
ετ αλqot|{|l !墨西哥 t||t年kŠ∏¨µµ¤ ετ αλqot||tl !南非 t||w年k∂¬¯­²¨ ± ετ αλqot||wl !智利 usst年k •¬±ª©¬¨ §¯
ετ αλqousstl等地相继发现有松树脂溃疡病为害 o该病害在世界各地呈现出迅速蔓延之势 ∀
松树脂溃疡病菌分类上被认为是李瑟组镰刀菌k Φυσαριυµ ¶¨¦·¬²± Λισεολαl的 t 个种 o其有性阶段为
Γιββερελλα φυϕικυροι k¶¤º¤§¤l Œ·² i Ž¬°∏µ¤中的交配群 ‹k≥·¨¨ ±®¤°³ ετ αλqo t|||l ∀除上述交配群外 oΓ q
φυϕικυροι至少还包括另外 z个在遗传上完全不同的交配群 o分别以 „ !… !≤ !⁄!∞ !ƒ !Š命名k…µ¬·½ ετ αλqo
t|||l ∀不同交配群具有定殖于特定寄主的倾向k∞¯ °¨ µot||xl ∀开展松树脂溃疡病菌检疫鉴定常常需要同
时进行致病性测定或与已知标准菌株进行有性杂交 o常规检疫鉴定方法费时费力 o有时结果还不准确 ∀
∂¬¯­²¨ ±等kt||zl o≥·¨¨ ±®¤°³等kt|||l以及 ≥¦«º¨ ¬ª®²©¯ µ¨等kusswl曾试着从基因角度揭示松树脂溃疡病菌与其
他近缘种间的差异 o相继建立了 • „°⁄!°≤• p • ƒ°以及实时 °≤• 检测方法 ∀然而综观以上方法 o有的实验
重复性不强 o有的难以直接应用于样品检测 o有的仪器要求和检测成本较高 o口岸实际应用难度极大 ∀本研
究的目的是建立一种经济 !快速 !简便且准确地检测方法 o为各口岸开展进境种子 !苗木 !木材检疫 o防止松树
脂溃疡病菌传入提供可靠的技术手段 ∀
1 材料和方法
t1t 供试菌株 供试菌株及相关特性见表 t ∀
表 1 供试菌株及来源
Ταβ .1 Στραινστεστεδ ανδ τηειρ οριγινσ
交配群类型
¤·¬±ª·¼³¨
菌 种
’µª¤±¬¶°
菌种编号
‘²q²©¶·µ¤¬±¶
寄 主
‹²¶·
来 源 ≠
• ¶¨²∏µ¦¨
‹ Φq χιρχινατυµ ‘ƒ˜‹ p t 加勒比松 Πινυσ χαριβαεα ‘≤„˜• k‘²µ·« ≤¤µ²¯¬±¤o˜≥„l
‹ Φq χιρχινατυµ ‘ƒ˜‹ p u 琉球松 Πqλυχηυεενσισ ‘≤„˜• k¤³¤±l
‹ Φq χιρχινατυµ ‘ƒ˜‹ p v 辐射松 Πq ραδιατα ‘≤„˜• kŠ¨ ²µª¬¤o˜≥„l
‹ Φq χιρχινατυµ ‘ƒ˜‹ p w 展叶松 Πq πατυλα ‘≤„˜• k≥²∏·« „©µ¬¦¤l
„ Φq µονιλιφορµε ‘„˜„ p t ‘„˜
„ Φq µονιλιφορµε ‘„˜„ p u ‘„˜
… Φq συβγλυτινανσ ‘„˜…p t ‘„˜
≤ Φq µονιλιφορµε ‘„˜≤ p t ‘„˜
≤ Φq µονιλιφορµε ‘„˜≤ p u ‘„˜
⁄ Φq προλιφερατυµ ‘„˜⁄p t ‘„˜
⁄ Φq προλιφερατυµ ‘„˜⁄p u ‘„˜
∞ Φq συβγλυτινανσ ‘„˜∞p t ‘„˜
∞ Φq συβγλυτινανσ ‘„˜∞p u ‘„˜
∞ Φq συβγλυτινανσ ‘„˜∞p v ‘„˜
ƒ Φq µονιλιφορµε ‘„˜ƒ p t ‘„˜
) Φq γραµινεαρυµ ‘„˜Š ‘„˜
) Φq σολανι ‘„˜≥ ‘„˜
) Πηψτοπητηορᶳ³q ≥±°
) Τιλλετιᶳ³q ≥±×
≠ ‘≤„˜• }美国应用农业研究中心 ‘¤·¬²±¤¯ ≤ ±¨·¨µ©²µ„ªµ¬¦∏¯·∏µ¤¯ ˜·¬¯¬½¤·¬²± • ¶¨¨¤µ¦«k˜≥„l ~‘„˜ }南京农业大学 ‘¤±­¬±ª„ªµ¬¦∏¯·∏µ¨ ˜±¬√ µ¨¶¬·¼q
t1u 菌株培养和菌丝体收集 将菌株接于 °⁄„培养基上 ous ∗ ux ε 黑暗培养 ts §o用接种针将菌丝体轻轻
刮下 o置于塑料管中 o冷冻干燥 o加少许石英砂研磨至细粉 op us ε 下保存 ∀
t1v 基因组 ⁄‘„的抽提 菌丝体基因组 ⁄‘„的抽提参照颜子颖等kt||{l的 ≤ׄ…法 ∀孢子基因组 ⁄‘„的
抽提参照 ≤∏¯¯¨ ±等kt||{l的冻融法 ∀
t1w 样品中病原菌基因组 ⁄‘„的抽提 tl种子中病原菌基因组 ⁄‘„的抽提 取 us ª松树种子于三角瓶
中 o加入灭菌水 o充分振荡洗涤 x °¬±o取洗涤液于 w sss µ#°¬±pt o离心 x °¬±o收集沉淀 o冻融法提取病菌
⁄‘„ o同 t1v1u ∀ul土壤中基因组 ⁄‘„的抽提 取 s1v ª土壤 o烘干 o充分碾碎 o加入 s qw h脱脂奶粉 o采用冻
融法提取病菌 ⁄‘„ o同 t1v1u ∀vl木屑中基因组 ⁄‘„的抽提 取 s1x ª锯木屑 o采用冻融法提取病菌 ⁄‘„ o同
t1v1u ∀
t1x 引物设计与合成 根据 Š¨ ±…¤±®中登录 Φυσαριυµ 属 vt种µ• ‘„基因内间隔区 ŒŠ≥序列 o利用引物设计
软件 k °µ¬°¨ x1tl o设计一对镰刀菌通用引物 ŠtЊu o序列为 }xχ2Š≤ŠŠ×Š×≤ŠŠ×Š×Š≤×׊ׄ2vχΠxχ2
„≤×≤„≤ŠŠ≤≤„≤≤„„„≤≤„≤2vχ o一 对 针 对 松 树 脂 溃 疡 病 菌 的 特 异 引 物 ≥tΠ≥u o序 列 为 } xχ2
≤×ׄ≤≤×׊Š≤×≤Š„Š„„ ŠŠ2vχΠxχ2≤≤ׄ≤≤≤ׄ≤„≤≤×≤×≤„≤×2vχ ∀引物合成委托上海基康生物技术有限公司
公司完成 ∀
t1y 分子检测体系的建立 第 t轮 °≤• 扩增的反应体系为 ux ˏo反应组分为 }ts ≅ µ¨¤¦·¬²± ¥∏©©¨µu1x ˏo
u1x °°²¯#pt ª≤¯ u t1x ˏots ³°²¯ #pt上下游引物各 s1x ˏots °°²¯ #pt §‘×° u ˏox ˜#ˏpt פ´ 酶
s1ux ˏo模板 ⁄‘„提取液 t ˏo灭菌水补足 ux ˏ∀以灭菌水代替模板 ⁄‘„作为阴性对照 ∀混合液在 °×≤
p uss °≤• 仪上进行扩增 o反应程序为 }|x ε 变性 x °¬±o进入循环 o|w ε 变性 vs ¶oxy ε 退火 wx ¶ozu ε 延伸
t °¬±ous个循环后 zu ε 延伸 ts °¬±∀
将第 t轮 °≤• 扩增产物稀释 tss倍 o取 t ˏ稀释液作为第 u轮扩增的模板 ∀第 u轮 °≤• 扩增的反应体
系体积为 ux ˏo反应组分为 }ts ≅ µ¨¤¦·¬²± ¥∏©©¨µu1x ˏou1x °°²¯#pt ª≤¯ u t1x ˏots ³°²¯#pt上下游引物各
s1x ˏots °°²¯#pt §‘×° u ˏox ˜#ˏpt פ´ 酶 s1ux ˏo灭菌水补足 ux ˏ∀以灭菌水代替模板 ⁄‘„作为阴
utt 林 业 科 学 wv卷
性对照 ∀混合液在 °×≤ p uss °≤• 仪上进行扩增 o反应程序为 }|w ε 变性 v °¬±o进入循环 o|w ε 变性 vx ¶o
yy ε 退火 xx ¶ozu ε 延伸 xs ¶ows个循环后 zu ε 延伸 tu °¬±∀取 ts ˏ扩增产物于 t1u h琼脂糖凝胶中电
泳 o∞…染色后 o于紫外灯下观察 o并于凝胶成像系统上检测并拍照 ∀
t1z 灵敏度的测定 将 ‘ƒ˜‹ p v的基因组 ⁄‘„稀释成 x ≅ tsx !x ≅ tsw !x ≅ tsv !x ≅ tsu !xs !x !x ≅ tsp t !x ≅
tsp u !x ≅ tsp v !x ≅ tspw !x ≅ tspx ³ª#ˏpt等 tt个浓度梯度 o按巢式 °≤• 程序扩增 ∀
将 tss ˏ‹u ’ 中的 ‘ƒ˜‹ p v孢子数量分别调成 t ≅ tsz !t ≅ tsy !t ≅ tsx !t ≅ tsw !t ≅ tsv !t ≅ tsu !ts !t个 o
离心 o提取 ⁄‘„ o按巢式 °≤• 程序扩增 ∀
t ouu1⁄usss ¤µ®¨µ~u1 阴性对照 ‹u ’ ‘¨ª¤·¬√¨¦²±·µ²¯ ‹u ’ ~
v1‘ƒ˜‹ p t ~w1‘ƒ˜‹ p u ~x1‘ƒ˜‹ p v ~y1‘ƒ˜‹ p w ~z1‘„˜„
p t ~{1‘„˜„ p u ~|1‘„˜… p t ~ts1‘„˜≤ p t ~tt1‘„˜≤ p u ~
tu1‘„˜⁄p t ~ tv1‘„˜⁄ p u ~ tw1‘„˜∞ p t ~ tx1‘„˜∞ p u ~
ty1‘„˜∞ p v ~ tz1‘„˜ƒ p t ~ t{1‘„˜Š ~ t|1‘„˜≥ ~ us1≥±° ~
ut1≥±× q下同 ∀ ׫¨ ¶¤°¨ ¥¨ ²¯º q
图 t 巢式 °≤• 第 t轮扩增结果
ƒ¬ªqt ׫¨ µ¨¶∏¯·²©±¨ ¶·¨§2°≤• ©¬µ¶·µ²∏±§¤°³¯¬©¬¦¤·¬²±
分别在 us ª湿地松k Πινυσελλιοττιιl种子 !s1v ª土壤以及
s1x ª木屑中按 t ≅ tsy !t ≅ tsx !t ≅ tsw !t ≅ tsv !t ≅ tsu !ts个
等 y个梯度加入 ‘ƒ˜‹ p v孢子液 o提取 ⁄‘„ o按巢式 °≤•
程序扩增 ∀
取 ts ˏ上述扩增产物于 t1u h琼脂糖凝胶中电泳 o∞…
染色后 o于紫外灯下观察 o并于凝胶成像系统上检测并
拍照 ∀
2 结果与分析
u1t 松树脂溃疡病菌及其相关种的巢式 °≤• 扩增 巢式
°≤• 第 t轮扩增结果表明 o供试的 tz种镰刀菌均可扩增出
一条 {zv ¥³大小的条带 o而阴性对照和其他镰刀属以外的
种没有扩增出此条带k图 tl ∀以第 t轮扩增产物为模板 o进
行巢式第 u轮 °≤• 扩增 o结果表明 o只从松树脂溃疡病菌的
w个菌株中扩增出 vyw ¥³大小特异性条带 o而阴性对照和
其他菌株没有扩增出特异条带k图 ul ∀
u1u °≤• 扩增松树脂溃疡病菌的灵敏度 将 ‘ƒ˜‹ p v的
基因组 ⁄‘„以及 tss ˏ‹u ’ 中的孢子稀释成不同浓度梯
度 o进行巢式°≤•扩增 o结果显示巢式°≤•扩增最低可检测
图 u 松树脂溃疡病菌及其相关种的巢式 °≤• 扩增
ƒ¬ªqu ‘¨¶·¨§2°≤• ¤°³¯¬©¬¦¤·¬²± ²© Φq χιρχινατυµ
到病原菌⁄‘„浓度为 x ≅ tsp v ³ª#ˏptk图 vl o而分生孢子检
测的限量为 ts个#ktss ˏlpt ‹u ’k图 wl ∀
u1v 带菌种子中病菌的检测 利用巢式 °≤• 对带菌种子
进行检测 o结果 us ª种子中加入 t ≅ tsy !t ≅ tsx !t ≅ tsw !t ≅
tsv !t ≅ tsu 个孢子的样品均能检测出特异条带 o而加入 ts
个孢子的种子没有特异条带k图 xl ∀
u1w 带菌土壤中病菌的检测 利用巢式 °≤• 对带菌土壤
进行检测 o结果 s1v ª细土中加入 t ≅ tsy !t ≅ tsx !t ≅ tsw !
t ≅ tsv 个孢子的样品均能检测出特异条带 o而加入 tss个
和 ts个孢子土样中没有特异条带k图 yl ∀
u1x 带菌木屑中病菌的检测 利用巢式 °≤• 对带菌木屑
进行检测 o结果显示 s1x ª木屑中加入 t ≅ tsy !t ≅ tsx !t ≅
tsw !t ≅ tsv !t ≅ tsu 个孢子的样品均能检测出特异条带 o而
加入 ts个孢子的木屑中没有特异条带k图 zl ∀
3 结论与讨论
目前 o松树脂溃疡病只在美国 !墨西哥 !日本 !南非 !西班牙 !智利 !海地等地有发现 o中国尚未有该病害发
生的报道 o国内应切实加强进境苗木 !种子 !木材以及木质包装的检疫 ∀为此 o建立松树脂溃疡病菌经济 !快
速地检测技术势在必行 ∀
vtt 第 t期 廖太林等 }松树脂溃疡病菌的分子检测
t1⁄usss ¤µ®¨µ~u q阴性对照 ‘¨ª¤·¬√¨¦²±·µ²¯ }‹u ’ ~v p tv q以
‘ƒ˜‹ p v ⁄‘„为模板的浓度 ≤²±¦¨±·µ¤·¬²±¶²©‘ƒ˜‹ p v ⁄‘„ }x ≅
tsx ox ≅ tsw ox ≅ tsv ox ≅ tsu oxs ox ox ≅ tsp t ox ≅ tsp u ox ≅ tsp v ox ≅
tsp w ox ≅ tsp x ³ª#ˏpt
图 v °≤• 扩增松树脂溃疡病菌的灵敏度k ´l
ƒ¬ªqv ‘¨¶·¨§2°≤• ∏¶¬±ª§¬¯∏·¨§ª⁄‘„ ²© Φq χιρχινατυµ k ´l
t q⁄usss ¤µ®¨µ~u q阴性对照 ‘¨ª¤·¬√¨¦²±·µ²¯ }‹u ’ ~v q阳性
对照 °²¶¬·¬√¨ ¦²±·µ²¯ ~ ‘ƒ˜‹ p v ⁄‘„ 模板浓度 ≤²±¦¨±·µ¤·¬²±}x
±ª#ˏpt ~w p tt q孢子数量 °²µ¨ ±∏°¥¨µ}t ≅ tsz ot ≅ tsy ot ≅
tsx ot ≅ tsw ot ≅ tsv ot ≅ tsu ots ot
图 w °≤• 扩增松树脂溃疡病菌的灵敏度k µl
ƒ¬ªqw ‘¨¶·¨§2°≤• ∏¶¬±ª§¬¯∏·¨§¦²±¬§¬¤²© Φq χιρχινατυµ k µl
t q⁄usss ¤µ®¨µ~u q阴性对照 ‘¨ª¤·¬√¨ ¦²±·µ²¯ }‹u ’ ~v q阳性
对照 °²¶¬·¬√¨¦²±·µ²¯ ~ ‘ƒ˜‹ p v ⁄‘„ 模板浓度 ≤²±¦¨±·µ¤·¬²±}x
±ª#ˏpt ~w p | q孢子数量 °²µ¨ ±∏°¥¨µ}t ≅ tsy !t ≅ tsx !t ≅ tsw !
t ≅ tsv !t ≅ tsu !ts ∀下同 ∀ ׫¨ ¶¤°¨¥¨ ²¯º q
图 x 带菌种子中病菌的检测
ƒ¬ªqx „µ·¬©¬¦¬¤¯ ¼¯ ¦²±·¤°¬±¤·¨§¶¨ §¨·¨¶·
基因内间隔区kŒŠ≥l是指位于 u{≥ µ• ‘„ 基因 vχ端与
t{≥ µ• ‘„基因 xχ端之间的序列 ∀通常认为 ŒŠ≥是高变区 o
为真菌属内种间比较和种内变种及其遗传多样性分析的重
要分子标记kŠµ¼·¤ ετ αλqot||z ~Š∏¬§²·ετ αλqot||| ~…∏±¼¤µ§
ετ αλqo t||y ~ ≥∏ª¬·¤ ετ αλqo usstl ∀张金霞等 kusswl以
• „°⁄和 ŒŠ≥ 为分子标记 o研究了中国栽培白灵侧耳
k Πλευροτυσ νεβροδενσισl菌株的遗传多态性 o对供试菌株的 ŒŠ≥
分析表明 oŒŠ≥u区域进化较快 o菌株间具有丰富的多态性 o
利用 ŒŠ≥ p • ƒ°可对白灵侧耳菌株进行鉴定 ∀≥¦«º¨ ¬ª®²©¯ µ¨
等kusswl建立的松树脂溃疡病菌实时 °≤• 检测方法也是以
ŒŠ≥为基础的 ∀
采用巢式 °≤• 可明显提高样品检测的灵敏度 o最低限
量病菌 ⁄‘„ 浓度为 x ≅ tsp v ³ª#ˏpt o分生孢子 ts 个#
ktss ˏlpt o该方法检测 ⁄‘„浓度的灵敏度为 ≥¦«º¨ ¬ª®²©¯ µ¨
等kusswl建立实时 °≤• 的 u sss倍 ∀试验中采用的 ‘ƒ˜‹ p t !‘ƒ˜‹ p u !‘ƒ˜‹ p v以及 ‘ƒ˜‹ p w分别为美国
北卡罗莱那州加勒比松k Πq χαριβαεαl !日本琉球松k Πq λυχηυενσισl !美国佐治亚州辐射松k Πq ραδιαταl !南非
展叶松k Πq πατυλαl上的分离物 ow个松树脂溃疡病菌菌株地理来源广泛 ∀以引物 ≥t !≥u对松树脂溃疡病菌
及其他对照菌株的 ⁄‘„进行 °≤• 扩增 o电泳的结果只有目标菌的 w个菌株可扩增出特异条带 o说明引物
≥t !≥u具有较强的特异性 ∀
图 y 带菌土壤中病菌的检测
ƒ¬ªqy „µ·¬©¬¦¬¤¯ ¼¯ ¦²±·¤°¬±¤·¨§¶²¬¯ ·¨¶·
图 z 带菌木屑中病菌的检测
ƒ¬ªqz „µ·¬©¬¦¬¤¯ ¼¯ ¦²±·¤°¬±¤·¨§¶¤º§∏¶··¨¶·
⁄º¬±¨ ¯¯kussyl对松树种子携带松树脂溃疡病菌的研究表明 o松种主要以表面带菌为主 ∀因此 o本试验采
用人工污染种子模拟种子带菌与实际情况基本相吻合 ∀本试验采用冻融法直接从土壤 !木屑中提取病菌
⁄‘„ o可以大大降低病菌孢子过筛过程损耗 o避免研磨不充分 o最终提高实际检测灵敏度 ∀
wtt 林 业 科 学 wv卷
参 考 文 献
„∏¶∏¥¨¯ ƒ o…µ¨±·• oŽ¬±ª¶·²±¨ • ∞o ετ αλqt||{ q精编分子生物学实验指南 q颜子颖 o王海林 o译 q北京 }科学出版社
张金霞 o黄晨阳 o张瑞颖 o等 qussw q中国栽培白灵侧耳的 • „°⁄和 ŒŠ≥分析 q菌物学报 ouvkwl }xtw p xt|
…µ¬·½ ‹ × „ o≤²∏·¬±«²  o •¬±ª©¬¨ §¯ • ƒ ’ o ετ αλqt||| q Φυσαριυµ συβγλυτινανσ©q¶³q πινι µ¨³µ¨¶¨±·¶¤§¬¶·¬±¦·°¤·¬±ª³²³∏¯¤·¬²±¬±·«¨ Γιββερελλαφυϕικυροι
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k责任编辑 朱乾坤l
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