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Molecular biology and metabolic engineering of tropane alkaloids biosynthesis

托品烷类生物碱生物合成分子生物学与代谢工程



全 文 :中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 43 卷 第 5 期 2012 年 5 月

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托品烷类生物碱生物合成分子生物学与代谢工程
卢 衍 1, 2,王细荣 1, 2,陈 敏 3,廖志华 1, 2*
1. 西南大学 三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆 400715
2. 西南大学生命科学学院 天然产物与代谢工程实验室,重庆 400715
3. 西南大学药学院 药物分析教研室,重庆 400715
摘 要:莨菪碱和东莨菪碱属于托品烷类生物碱,是重要的抗胆碱类药物。托品烷类生物碱生物合成分子生物学和代谢工程一
直是植物次生代谢工程研究的热点。随着植物功能基因组学和代谢组学的发展,托品烷类生物碱生物合成研究取得重要进展。
重点对托品烷类生物碱生物合成途径、功能基因和代谢工程研究进展进行综述,并对可能存在的问题以及应用前景进行展望。
关键词:托品烷类生物碱;生物合成;分子生物学;代谢工程;功能基因
中图分类号:R282.1 文献标志码:A 文章编号:0253 - 2670(2012)05 - 1018 - 06
Molecular biology and metabolic engineering of tropane alkaloids biosynthesis
LU Yan1, 2, WANG Xi-rong1, 2, CHEN Min3, LIAO Zhi-hua1, 2
1. Key Laboratory of Eco-environments in Three Gorges Reservoir Region, Ministry of Education, Southwest University, Chongqing
400715, China
2. Laboratory of Natural Products and Metabolic Engineering, School of Life Sciences, Southwest University, Chongqing 400715,
China
3. Drug Analysis Department, School of Pharmaceutical Sciences, Southwest University, Chongqing 400715, China
Key words: tropane alkaloids; biosynthesis; molecular biology; metabolic engineering; functional gene

托品烷类生物碱(tropane alkaloids,TAs)来源
于茄科颠茄属、赛莨菪属、山莨菪属、天蓬子属、马
尿泡属、泡囊草属、曼陀罗属等数 10 种药用植物[1]。
莨菪碱和东莨菪碱是 TAs 中最为重要的两种生物
碱,在临床上是应用广泛的抗胆碱类药物。与莨菪
碱相比,东莨菪碱具有不良反应少、药理作用更强
的特点,主要用于镇痛、麻醉、抗晕动症、治疗帕
金森症、改善微循环、戒毒脱瘾、治疗农药中毒等,
市场需求十分巨大[2]。但是东莨菪碱在植物中的量
比莨菪碱低得多,在东莨菪碱商业药源植物颠茄中
的量仅为干质量的 0.01%~0.08%,使得东莨菪碱价
格高昂。培育东莨菪碱高产的药源植物成为该领域
的热门研究内容。但通过大量研究表明,采用常规
育种、脱毒、杂交育种、射线诱变育种、多倍体育
种等方法,均未得到高产东莨菪碱药源植物。近年
来,随着 TAs 生物合成途径分子生物学和东莨菪碱
药源植物基因工程研究的深入,使得包括莨菪碱和
东莨菪碱在内的 TAs 生物合成的代谢调控在分子
水平上取得了重要进展,代谢工程成为培育高产
TAs 药源植物最有可能取得突破的方向。本文就
TAs 生物合成途径的分子生物学与代谢调控研究
进展进行系统综述。
1 托品烷类生物碱的生物合成途径
托品烷类生物碱的生物合成起始于鸟氨酸
(ornithine)和精氨酸(arginine)。鸟氨酸在鸟氨酸
脱羧酶(ornithine decarboxylase,ODC)作用下,
脱羧生成腐胺(putrescine);精氨酸在精氨酸脱羧
酶(arginine decarboxylase,ADC)催化下脱羧生成
精氨,然后经过一系列未知酶促反应生成腐胺[3];
腐胺在 N-甲基-腐胺转移酶(putrescine N-methyl-
transferase,PMT)作用下,甲基化形成 N-甲基-腐
胺(N-methyl-putrescine,mP),N-甲基-腐胺在二胺
氧化酶(diamine oxidase,DAO)作用下生成 4-氨
基-正丁醛(4-amino-butanal);4-氨基-正丁醛再自

收稿日期:2011-11-03
基金项目:国家“863”计划项目:东莨菪碱植物代谢产物生物反应器研制(2011AA100605);重庆市高校优秀人才资助计划
作者简介:卢 衍(1986—),硕士研究生,研究方向为药用植物的代谢工程。Tel: (023)68367146 E-mail: v015158@163.com
*通讯作者 廖志华 Tel: (023)68367146 E-mail: zhliao@swu.edu.cn
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 43 卷 第 5 期 2012 年 5 月

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发 的 转 化 为 1- 甲 基 -Δ- 吡 咯 啉 正 离 子
(1-methyl-Δ-pyrrolinium cation),并经过一系列未知
酶促反应生成 TAs 途径特有的前体托品酮
(tropinone)[4]。托品酮是 TAs 生物合成途径中的分
支点:(1)托品酮在托品酮还原酶 I(tropinone
reductase I,TRI)催化下还原成托品(tropine),托
品是莨菪碱和东莨菪碱等药用 TAs 的直接前体;
(2)托品酮在托品酮还原酶 II(TRII)催化下还原
成假托品(pseudotropine),假托品是打碗花精的直
接前体。因此,相对于目标产物莨菪碱和东莨菪碱
而言,由 TRII 主导的假托品生物合成途径是 TRI
主导的托品生物合成途径的竞争途径。托品与来自
于苯丙氨酸(phenylalanine)的苯乳酸(phenyllactic
acid)缩合生成海螺碱(littorine),而后海螺碱在
CYP80F1 的作用下生成莨菪碱[5],最后在莨菪碱
6-β-羟化酶(hyoscyamine 6-β-hydroxylase,H6H)
的作用下,莨菪碱羟基化形成山莨菪碱,进而环氧
化成东莨菪碱[6]。TAs 生物合成途径见图 1。

NH2HOOCH2N
NH2NH2
腐胺
HOOC
H2N
N
H
NH2
NH
精氨酸
ADC
N
H
NH2
H2N
NH
胍丁胺PMT
NHCH3NH2 NHCH3
N-甲基-腐胺 4-氨基-正丁醛
N
+
CH3
1-甲基-Δ-吡咯啉正离子
N
NH
CH3
N
OH
O
烟酸
尼古丁
H3C
N
O
H3C
N
OH
H3C
N
OH
OH OH
OHC
HO
H3C
N
O
H3C
N
O
OH
O
H3C
N
O
OH
O
OH
H3C
N
O
OH
O
O
H3C
N
O
OCH3
O
可卡因
鸟氨酸
托品酮
托品
假托品
打碗花精
TR I
TR II
NH2
苯丙氨酸
苯乳酸
海螺碱
莨菪碱
山莨菪碱
东莨菪碱
H6H
H6H
CYP80F1
DAO
H3C
H3C
N
OH
CHO
C
OH
ODC
O
O
O

图 1 TAs 生物合成途径
Fig. 1 Biosynthetic pathway of TAs
中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 43 卷 第 5 期 2012 年 5 月

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2 托品烷类生物碱生物合成途径中的功能基因
TAs 生物合成途径分子生物学研究开始于 20
世纪 80 年代,经过 30 多年研究,该途径中多个重
要功能基因,包括 PMT、TRI、TRII、CYP80F1 和
H6H 都已经从多种茄科植物中克隆鉴定(表 1)。
2.1 PMT
PMT 是一种甲硫氨酸依赖性的甲基转移酶,能
够促进腐胺氮甲基化生成 N-甲基-1, 4-丁二胺和 S-
腺苷高半胱氨酸,一般认为 PMT 催化的反应是 TAs
生物合成途径的限速反应,PMT 是 TAs 生物合成
表 1 茄科植物 TAs 合成相关酶基因
Table 1 Related genes involved in biosynthetic pathway of TAs from plants in Solanaceae
酶 功 能 植物来源 GenBank 编号 参考文献
莨菪 AB018572.1
颠茄(PMT1) AB018570.1
颠茄(PMT2) AB018571.1
7
毛曼陀罗(PMT1) AM177609.1
毛曼陀罗(PMT2) AM177610.1
8
山莨菪 AY690623.1 9
三分三(PMT1) EU670745.1
PMT 催化腐胺生成 N-甲基-腐胺
三分三(PMT2) EU670746.1
10
曼陀罗(TRI) L20473.1
曼陀罗(TRII) L20474.1
11
莨菪(TRII) L20485.1 12
马铃薯(TRI) AJ30584.1
马铃薯(TRII) AJ245634.1
13
三分三(TRI) EU424321.1
TRs 催化托品酮还原为托品/假托品
三分三(TRII) EU424322.1
14
CYP80F1 催化海螺碱生成 hyoscyamine aldehyde 莨菪 DQ387048.1 15
莨菪 M62719.1 4
颠茄 AB017153.1 16
H6H 催化莨菪碱生成东莨菪碱
三分三 EF187826.1 17

途径中的第一个限速酶。PMT 基因已经从烟草、莨
菪、毛曼陀罗、颠茄和三分三等植物中克隆。在茄
科植物中,PMT 由一个具有两个基因成员(PMT1
和 PMT2)的基因家族编码,这两个基因在编码区
序列和基因表达时空特异性上具有一定差异。三分
三 Anisodus acutangulus C. Y. Wu et C. Chen 中具有
两条 PMT 基因,即 AaPMT1 和 AaPMT2。AaPMT1
编码区为 1 017 bp,编码 338 个氨基酸;AaPMT2
编码区为 1 041 bp,编码 347 个氨基酸;AaPMT1
和 AaPMT2 在三分三根、叶和茎中都有表达,但
AaPMT1 在各组织中表达量高于 AaPMT2;同时茉
莉酸甲酯(MeJA)能够显著提高AaPMT1的表达[10]。
颠茄 Atropa belladonna L.也具有两条 PMT 基因,
即 AbPMT1 和 AbPMT2。AbPMT1 编码区为 1 011
bp,编码 336 个氨基酸;AaPMT2 编码区为 1 023
bp,编码 340 个氨基酸;AbPMT1 在颠茄根的表达
量远高于 AbPMT2。颠茄 PMT 基因对 MeJA 诱导
没有响应[7]。
2.2 托品酮还原酶(TRs)
TRs 是依赖还原型辅酶 II(NADPH)的立体专
一性还原酶,包括 TRI 和 TRII 两种类型,构成了
托品烷类生物碱生物合成的一个分支点[18]。TRI 和
TRII 都以托品酮为底物,但却具有不同的催化作用
和酶动力学特性。TRI 催化生成产物是托品,而 TRII
催化生成的产物是假托品。曼陀罗 TRI 和 TRII 基因
分别编码 273 和 260 个氨基酸的酶,两者序列有
64%氨基酸相同。在 pH 值为 7.0 时,TRI 酶活性是
TRII 的 11 倍;TRI 在高 Km值及酸性环境条件下,
能达到其最高的酶活[11]。莨菪 Hyoscyamus niger L.
TRI 和 TRII 在氨基酸序列上具有 64%的一致性,而
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且编码这两个酶的基因组序列具有相同的组织结
构,即内含子和外显子在基因组中的组织形式完全
相同;基因表达分析表明莨菪 TRI 和 TRII 具有相似
的表达时空特异性,且表达量大小比较接近[19]。三
分三 TRI 和 TRII 在各个组织中均有表达,但是 TRI
表达水平远低于 TRII,且 MeJA 诱导后这两个基因
表达都得到提高[14]。TRI 和 TRII 基因在不同植物中
表达特性的差异,说明这两个基因在不同植物的
TAs 生物合成途径中的代谢调控作用可能具有种属
特异性。
2.3 CYP80F1
海螺碱存在于产托品烷生物碱的植物中[20],它
是莨菪碱和东莨菪碱生物合成途径中的一个重要
产物和重要前体[21]。莨菪 CYP80F1 基因属于 P450
细胞色素氧化酶基因家族,编码 510 个氨基酸的酶,
在酵母中重组 CYP80F1 结合前体饲喂的研究表明,
CYP80F1 能 够 催 化 海 螺 碱 生 成 hyoscyamine
aldehyde(莨菪碱的直接前体);CYP80F1 基因只在
莨菪根及发根中表达,这与根是莨菪碱主要生物合
成部位一致。在莨菪发根中超表达 CYP80F1 不能
提高莨菪碱合成;而采用RNAi降低CYP80F1表达,
结果导致莨菪碱合成减少,转基因研究表明
CYP80F1 不是 TAs 合成途径中的限速酶[15]。
2.4 H6H
H6H 是一种双功能酶,具有羟基化和环氧化的
作用,是托品烷类生物碱生物合成途径中一个重要
的限速酶。它可将莨菪碱的 C-6β 羟基化形成山莨
菪碱,而后将山莨菪碱的 C-6、C-7 环氧化形成东
莨菪碱[6](图 1)。H6H 基因已从莨菪、颠茄、三分
三、曼陀罗等茄科药用植物中被克隆出来。莨菪
H6H 基因的编码区能够编码 344 个氨基酸,通过
cDNA 可推断有 12 个肽段。莨菪 H6H 主要在根中
表达,但在叶、茎以及培养的细胞中均没有表达[4]。
三分三 H6H 基因在氨基酸水平上,与莨菪、颠茄
和曼陀罗 H6H 的一致性分别为 95%、95%和 93%。
与莨菪以及颠茄等其他茄科植物 H6H 基因只在根
部表达的特征不同的是三分三 H6H 在根、茎、叶
中均有表达,说明 H6H 在不同物种中的表达方式
有所不同[18]。H6H 是东莨菪碱生物合成途径中公认
的关键酶,也是利用基因工程技术提高东莨菪碱生
物合成的最重要功能基因。
3 TAs 生物合成途径的代谢工程
TAs 生物合成途径中重要功能基因的克隆和功
能鉴定为利用这些基因遗传改造 TAs 生物合成途
径,开展 TAs 生物合成途径代谢工程研究奠定了良
好基础。在利用 PMT、TRs 和 H6H 基因遗传改造
不同产 TAs 药用植物中取得了丰富研究成果。
TAs 生物合成途径存在于莨菪、颠茄、曼陀罗、
三分三等茄科不同属植物中,该途径相关基因序列
及其编码蛋白质序列相似性普遍很高,表明该途径
在进化上具有共同起源。一般认为,不同植物中相
同生物合成途径涉及的限速步骤和关键酶比较一
致。但是在 TAs 生物合成途径中却发现转 PMT 基因
在具有相同生物合成途径的不同植物中具有不同表
现。在曼陀罗过量表达 PMT 基因使莨菪碱量提高 2
倍多,东莨菪碱量提高 3 倍多;在埃及莨菪
Hyoscyamus muticus L. 中过量表达PMT基因使莨菪
碱量提高近 5倍[22];而在颠茄中过量表达PMT基因,
莨菪碱量没有显著性变化[23]。这些研究表明,PMT
在曼陀罗和埃及莨菪的 TAs 生物合成途径中是限速
酶,而在颠茄的 TAs 生物合成途径中不是限速酶。
因此,对于开展 TAs 生物合成途径代谢工程而言,
在针对不同植物是否选用PMT作为目的基因进行遗
传转化要根据具体情况分析,不能一概而论。
TRs 是 TAs 生物合成途径的分支点,不同 TRs
基因的表达会引导代谢流流向不同的途径。在颠茄
发根中超表达 TRI,导致莨菪碱量提高 3 倍多,东
莨菪碱量提高 5 倍多;而由 TRII 主导的打碗花精量
降低 30%~90%,这是由于 TRI 大量表达,对 TRII
形成强有力的竞争,使得托品酮向莨菪碱和东莨菪
碱生物合成方向流动更多所致[24]。在三分三发根中
超表达 TRI,使得莨菪碱量提高 1.87 倍,东莨菪碱
量提高8倍[14]。这些转基因研究表明TRI是实现TAs
生物合成能力大幅度提高的一个重要功能基因。
H6H 被公认为是东莨菪碱生物合成的限速酶,
H6H 的表达与东莨菪碱产量呈正比关系。在产 TAs
药用植物中超表达 H6H 基因,能够大幅度提高东
莨菪碱的量。在颠茄中转入 H6H 基因,其转基因
植株中东莨菪碱量提高十分显著,转基因颠茄叶与
茎中的生物碱几乎全是东莨菪碱,而在其根中能够
检测到莨菪碱[6]。在颠茄发根中超表达 H6H 基因,
使得东莨菪碱的量比对照提高了 5 倍[25]。在埃及莨
菪中超表达 H6H 基因,转基因发根最高克隆产生
了 17 mg/L 的东莨菪碱[26]。
上述TAs生物合成途径遗传改造均是采用超表
达单基因的策略,取得了较好成效。由于天然产物
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合成途径代谢调控的复杂性,位于同一途径中的不
同基因在推动代谢流流向共同的目标产物中可能
具有协同作用。2004 年,唐克轩教授课题组首次在
国际上采用双基因超表达策略改造TAs生物合成途
径,研究发现超表达 PMT 和 H6H 的转基因莨菪发
根中东莨菪碱量比野生型和含有单基因(PMT 或
H6H)的转基因莨菪发根显著提高:共转 PMT 和
H6H 莨菪发根中东莨菪碱量最高是单转 H6H 发根
中的 2 倍,而其量高达 411 mg/L,直到现在仍然是
东莨菪碱生物合成途径遗传改造后东莨菪碱产量
的最高记录,可能的原因是 PMT 和 H6H 在 TAs 生
物合成途径中存在共同推动代谢流向终产物东莨
菪碱合成方向流动的协同作用[27]。随后,在东莨菪
碱商业药源植物颠茄中超表达 PMT 和 H6H,也进
一步验证了这种策略的可行性,并在此基础上培育
出了东莨菪碱高产的转基因颠茄[28-29]。
4 问题与展望
虽然TAs生物合成途径的分子生物和代谢工程
研究在过去的 30 年取得了丰富成果和巨大进展,
但由于植物次生代谢产物生物合成途径的复杂性,
仍然有诸多科学问题有待深入研究。在 TAs 生物合
成分子生物学研究方面,目前已经克隆鉴定了
PMT、TRI、TRII 和 H6H 等 TAs 合成途径中的重要
功能基因,但该途径中还有多步酶促反应步骤不清
楚,相关的酶及其编码的基因也未获得,如催化托
品酮和莨菪碱合成的酶与基因。在这些未知的步骤
中,是否存在限速步骤和限速酶更有待研究。
TAs 生物合成部位是根,但是在植物全株均有
分布,表明 TAs 存在转运机制,而关于 TAs 转运的
分子机制研究目前才刚刚开始,正在成为该领域的
研究热点。大量前期研究表明,TAs 生物合成受到
MeJA和ABA等植物激素的诱导而表现出超量积累
的现象,该途径中相关基因如 PMT、TRs 和 H6H
等在 MeJA 和 ABA 等诱导下表现为表达量显著上
升,说明这些功能基因受到 MeJA 响应的相关转录
因子的正调控,但是关于转录因子调控 TAs 生物合
成途径的研究仍是一片空白;而对于转录因子调控
植物次生代谢产物生物合成的研究一直是该领域
的前沿热点。
在 TAs 生物合成途径代谢工程研究方面,目前
已经对 PMT、TRs 和 H6H 进行了转基因研究并实
现了莨菪碱/东莨菪碱量的大幅度提高,但是这些研
究大多是在莨菪和曼陀罗中进行,由于相同基因在
具有相同途径的不同植物中表现可能不同(最为典
型的就是 PMT),使得直接将这些研究成果用于商
业药源植物如颠茄就具有一定风险。因此,针对不
同产 TAs 的药用植物,在开展代谢工程研究时要充
分考虑这一因素。关于 TAs 生物合成途径代谢工程
研究,绝大多数是采用这些药用植物的发根作为表
达系统(到目前为止,仅有两例培育产 TAs 转基因
植株的报道),由于生产上使用的是植株,而在发
根这一器官中获得的理论成果应用有限。虽然发根
TAs 生物合成途径代谢工程研究理论成果对于培育
TAs 高产转基因植株具有一定指导意义,但是这些
成果直接移植到转基因植株中不一定有相同表现。
针对这一情况,还应培育转基因植株,进一步研究
转基因对 TAs 在植株中合成的作用。
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