全 文 ：的生物合成途径而产生新的代谢旁路 、形成新的化
合物 ,尚有待进一步研究 。对重组菌株 N7059产生
的红色组分的结构解析研究 ,将为甘草与酵母菌之
间的基因交流提供进一步的化学证据和分子证据 。
离子注入介导外源 DNA 转化的最大特点是不
需要事先知道或克隆出目的 DNA 片段 ,因此在目
前没有GA 生物合成相关的基因信息的情况下 ,仍
可采用离子注入介导甘草基因组 DNA 转化方法 ,
以GA 为目标产物 ,筛选获得易于人工培养的产生
GA 的酵母工程菌株。通过对遗传稳定的生物合成
GA 的重组酵母菌的基因组学 、蛋白质组学和代谢
组学的深入研究 ,将获得与 GA 生物合成相关的多
个基因及其调控信息 。
致谢:武宝山副教授和凌海秋副教授参与离子
注入工作 ,乔坤云高级实验师和周俊副研究员进行
GA 和 GAs的 RP-HPLC 分析测试工作 。
参考文献:
[ 1] 　Cinat l J , M orgens tern B , Bauer G , et al.Glycyr rhi zin , an ac-
t ive component of liquorice root s , and replication of SARS-as-
s ociated coron aviru s [ J]. Lancet , 2003 , 361(9374):2045-
2046.
[ 2] 　T akei M , Kobayashi M , Li X D , et a l.Glycy rrhizin inhibi t s
R5 H IV replicat ion in peripheral blood monocytes t reated
w ith 1-methyladenosine [ J].P athobiolog y , 2005 , 72:117-
123.
[ 3] 　H arads S. T he b road ant iviral agent g lycyrrhizin di rectly
modulates the f luidi ty of p lasma memb rane and H IV-1 enve-
lope [ J].Biochem J , 2005 , 15(392):191-199.
[ 4] 　Yu Z L. Int rod uct ion to Ion Beam Biotechno log y [ M].New
York:Springer Pub lishin g H ouse , 2006.
[ 5] 　吕　杰 ,金　湘 , 毛培宏 , 等.氮离子注入介导麻黄基因组
DNA 转化酵母菌[ J].中草药 , 2008 , 39(8):1227-1230.
[ 6] 　邵鹏柱 ,曹　晖.中药分子鉴定[ M].上海:复旦大学出版社 ,
2004.
[ 7] 　李　伟 ,邹巧根 ,宋　喆 ,等.RP-HPLC法测定强力宁注射液
及甘草提取物中三种甘草皂苷的含量[ J].中国药科大学学
报 , 2002 , 33(1):32-34.
[ 8] 　杨文远 ,郝凤霞.用 RP-HPLC法同时测定甘草中的甘草酸
和甘草次酸[ J].宁夏大学学报:自然科学版 , 2005 , 26(1):56-
58.
[ 9] 　Feng H Y , Yu Z L , Chu P K.Ion im plan tat ion of organisms
[ J].Mat S ci Eng R , 2006 , 54:49-120.
[ 10] 　朱　辉 ,马　亮 ,詹良静.采用重组微生物技术靶位筛选非抗
菌活性的先导化合物[ J].国外医药 ·抗生素分册 , 2001 , 22
(2):69-76.
[ 11] 　张致平.微生物药物学[ M ].北京:化学工业出版社 , 2003.
[ 12] 　曹福祥.次生代谢[ M ].长沙:国防科技大学出版社 , 2003.
[ 13] 　Ro D K , Paradise E M , Ouellet M , et a l.Produ ction of the
antim alarial drug precurso r artemisinic acid in engineered
yeast [ J].Nature , 2006 , 440:940-943.
马蹄香表达序列标签资源的 SSR信息分析
李　珊1 ,周天华2 ,赵桂仿2 ,朱云国1 ,杨晓伶1 ,程　舟1 ＊①
(1.同济大学生命科学与技术学院 , 上海　200092;2.西北大学生命科学学院 , 陕西 西安　710069)
摘　要:目的　分析马蹄香 ES T 资源的 SSR信息 , 为开发 ES T-SS R标记奠定基础。方法　从 GenBank 中获得马
蹄香 ES T 序列 ,用 Sequenche r 4.8 软件进行序列拼接得到 Uni-EST 序列 , 用 SciRoKo3.4 软件对 Uni-ES T 序列进
行 SSR扫描 ,分析 ES T-SS R的分布频率和重复基元的类型特征。结果　共获得 10 274 条马蹄香 EST 序列 ,通过
预处理共得到全长为 5.11×106 bp的无冗余 Uni-EST 6 643 条。在这些序列中共搜索出 1 408 个 SSR 位点 ,分布
在 1 232 条 Uni-EST 序列中 ,发生频率为 18.55%, ES T-SS R的平均长度为 22.30 bp ,平均每 3.63 kb 含 1 个 SSR
位点 。单核苷酸重复在马蹄香 EST-SSR中占主导地位 , 发生频率为 12.24%, 其次为二核苷酸重复 , 发生频率为
5.01%。在所有重复基元中 , A/ T 基元出现频率最高 , 其次为 AG/ CT 。结论　马蹄香 ES T 中 SS R出现的频率较
高 ,并且类型较为丰富。
关键词:马蹄香;表达序列标签;EST-SSR
中图分类号:R282.2　　　文献标识码:A　　　文章编号:0253-2670(2010)03-0464-05
Data mining for simple sequence repeats in expressed sequence tags from Saruma henryi
LI Shan
1 , ZHOU Tian-hua2 , ZHAO Gui-fang2 , ZHU Yun-guo1 , YANG Xiao-ling 1 , CHENG Zhou1
(1.Schoo l of Life Science s and Technolog y , Tongji Univ ersity , Shanghai 200092 , China;
2.Co lleg e of Life Science s , Nor thw est Univer sity , Xi′an 710069 , China)
Abstract:Objective　T o analy ze the simple sequence repeat(SSR)info rmation in expressed sequence
·464· 中草药　Chinese Traditional and Herbal Drugs　第 41 卷第 3 期 2010 年 3 月
①收稿日期:2009-06-10　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　基金项目:国家自然科学基金资助项目(30800087)作者简介:李　珊(1976—),女 ,陕西西安人 ,讲师 ,博士,主要从事资源植物学研究。
Tel:13916300269　E-mail:li shanbio@yah oo.com.cn＊通讯作者　程　舟　T el:(021)65985185　Fax:(021)65985185　E-mail:chengzhou@mai l.t ongji.edu.cn
tag (ES T)re source o f S aruma henryi and lay a solid foundation fo r the development o f ES T-SSR markers
in this species.Methods　ES Ts of S.henry i were downloaded from GenBank and used to perform the con-
tig assembly using Sequenche r 4.8.Uni-ES Ts w ere obtained and screened for SSR-containing unigenes u-
sing SciRoKo 3.4.The dist ribut ing f requency of the EST-SSRs and the basic characte ristics o f motif s w ere
analyzed.Results　A total of 10 274 ESTs of S.henryi were ret rieved and w ere assembled into 6 643 non-
redundant Uni-ES Ts wi th a total leng th of 5.11×106 bp.In all , the data mining yielded 1 408 SSR loci ,
which cor responded to 1 232 Uni-ESTs (18.55%). On average , ES T-SSRs spanned 22.30 bp , and
occurred every 3.63 kb in length.In S.henryi , mononucleo tide repeats predominated w ith an occurrence
f requency of 12.24%.Dinucleo tide repeats follow ed w ith a f requency of 5.01%.The most f requent one
w as A/T among all the repeat mo tif s , then fo llow ed by AG/CT.Conclusion　SSRs in ESTs of S.henryi
display a relatively high level o f occurrence f requency and show abundance of types.
Key words:Saruma henry i Oliv.;expressed sequence tag (ES T);EST-SSR
　　马蹄香 Saruma henry i Oliv.是马兜铃科
(Aristo lochiaceae)马蹄香属的多年生草本药用植
物 ,目前仅在湖北 、陕西 、贵州 、四川及甘肃等省区呈
斑块状分布[ 1] 。马蹄香属是中国特有而古老的单型
属 ,属下仅马蹄香一种。该种在马兜铃科的系统演
化上占据着重要位置 ,对研究中国种子植物区系组
成 、性质和发育等问题具有重要意义[ 2] 。作为我国
传统的民间草药 ,马蹄香的根 、根状茎及叶片入药 ,
根及根状茎主治胃寒痛 、关节痛 ,叶片外敷主治化脓
疮疡 。现代研究表明其体内主要药用成分为马兜铃
酸 、挥发油 、甾体皂苷等 ,具有抗菌 、抗肿瘤 、镇痛 、降
低胆固醇等功效[ 3] 。此外 ,该种是中国特有蝴蝶
Luehdor f ia longicaudata Lee 幼虫唯一的食物来
源[ 4] 。由于马蹄香繁殖力低 、对生境要求严格 、自然
更新困难 、人为采挖现象严重 ,导致野生居群规模逐
渐减小并呈现出退化趋势 。该种已被列入中国高等
植物濒危及受威胁物种名录及秦巴山区重点植物名
录 ,属于国家级保护植物 ,急需进行保护和恢复[ 5] 。
迄今国内外学者对该种的研究集中在形态学 、分类
学 、生殖生物学等方面[ 6] ,尚未见到利用分子标记对
其遗传学背景进行研究 ,并提出有效的保护策略 ,对
其进行合理保护 。
SSR(simple sequence repeat)指以少数几个核
苷酸(一般为 1 ～ 6个)为重复单位的多次串联重复
DNA 序列 ,与其他分子标记技术相比 , SSR标记具
有数量丰富 、多态性高 、共显性遗传 、DNA 用量少 、
重复性好等优点 ,被证明是最有利用价值的功能性
分子标记之一。根据开发 SSR标记的来源序列性
质不同 , 可以分为基因组 SSR(Genomic SSR ,
gSSR)和表达序列标签 SSR(Expressed sequence
tag-SSR , ES T-SSR)。开发 gSSR需要构建基因组
文库 、探针杂交 、克隆测序等繁杂的操作过程 ,不仅
费用高 ,难度大 ,而且 gSSR具有种属特异性 ,极大
地限制了其发展和应用 。EST-SSR则可以直接基
于公共数据库中的 ES T 序列开发 ,除具备传统基因
组来源的 SSR标记众多优势外 ,具有信息量大 、通
用性好 、开发简单 、可能与基因功能表达有直接或间
接关系等优点 ,在多种植物中已建立该标记 ,并应用
于遗传多样性 、遗传作图等研究中。但目前马蹄香
EST 序列的情况尚未明晰 ,更无利用马蹄香 ES T
序列开发 ES T-SSR的报道。本实验对现有马蹄香
EST 序列中的 SSR信息进行了较为全面的分析 ,为
了解马蹄香 EST 资源的特性 ,进一步开发 、利用马
蹄香 ES T-SSR标记奠定了基础。
1　材料与方法
1.1　马蹄香 EST 来源:从 NCBI(The National
Center fo r Bio technolog y Informat ion)网站的Gen-
Bank数据库(ht tp://www.ncbi.nlm.nih.gov/)下
载马蹄香 ES T 序列 ,数据截止至 2009年 2月 。
1.2　ES T 序列拼接:用 Sequencher 4.8软件(Gene
Code s Co rpo rat ion ,美国)进行序列拼接(Contig as-
sembly)。拼接参数为:序列重叠不少于 50个核苷
酸 ,相似度不低于 95%,得到 Uni-ES Ts序列 。
1.3　SSR筛选:用 SciRoKo 3.4软件[ 7] 对 Uni-ES-
T s序列进行 SSR 扫描。筛选标准为:单核苷酸最
少重复 14次 ,二核苷酸最少重复 7 次 ,三核苷酸最
少重复 5次 ,四核苷酸 、五核苷酸 、六核苷酸最少重
复 4次 。
2　结果与分析
2.1　ES T 序列拼接:从 GenBank数据库上 ,共下载
到 10 274条符合条件的马蹄香 ES T 序列 。为了减
少冗余序列 ,获得比单个 ES T 序列更长且来自同一
·465·中草药　Chinese Traditional and Herbal Drugs　第 41 卷第 3 期 2010 年 3 月
基因的共有序列 ,利用 Sequencher 4.8软件对马蹄
香的 ES T 序列进行拼接 。共得到 Uni-EST 序列
6 643条 ,其中重叠序列(Cont ig)1 660条 ,独立序列
(Sing leton)4 983条。
2.2　马蹄香 ES T-SSR 的分布和频率:结果显示 ,
6 643条 Uni-EST 序列的总长度为 5.11×106 bp ,
平均长度为 769.23 bp 。从中搜索到 SSR位点数为
1 408个 ,分布在 1 232 条 ES T 序列中 ,发生频率为
18.55%,平均每 3.63 kb 含 1 个 SSR位点。各类
SSR片段的平均长度为 22.30 bp ,每 Mbp 长度核
苷酸序列上平均的 SSR 位点数为 275.81(表 1)。
在 6 643条 Uni-EST 序列中 ,共查到 510条含有非
单核苷酸重复的 Uni-EST 序列 ,占 U ni-ES T 总数
的 7.68%,其中 SSR位点数为 595个。
表 1　SSR在马蹄香无冗余 EST中的发生频率
Table 1　Occurrence frequency of SSR in non-redundant EST of S.henryi
重复类型 SSR 数 占总 SSR比例/%
发生频率
/ %
SSR平均
长度/ bp
SSR总
长度/ bp
每 Mbp核苷酸含
SSR 位点数
单核苷酸重复 813　　 57.74 12.24　　 21.69　　 17 634　　 159.26　　
二核苷酸重复 333　　 23.65 5.01　　 24.52　　 8 165　　 65.23　　
三核苷酸重复 198　　 14.06 2.98　　 20.70　　 4 099　　 38.79　　
四核苷酸重复 26　　 1.85 0.39　　 18.15　　 472　　 5.09　　
五核苷酸重复 11　　 0.78 0.17　　 23.55　　 259　　 2.15　　
六核苷酸重复 27　　 1.92 0.41　　 28.74　　 776　　 5.29　　
总计　　　　 1 408　　 100 21.20　　 137.34　　 31 405　　 275.81　　
　　　　发生频率(%)=含 SSR位点序列数/序列总数
　　　　Occurrence f requency (%)= num ber of SSR containing sequences/ t otal num ber of sequences
　　马蹄香中 EST-SSR的重复类型比较丰富 ,单
核苷酸重复至六核苷酸重复类型都能检测到(表
1)。从 SSR位点数量上来看 ,在所有 1 408 个 SSR
中 ,出现最多的是单核苷酸重复 ,共 813 个 ,占总
SSR的 57.74%,发生频率为 12.24%;其次为二核
苷酸重复 ,共 333个 ,占总 SSR的 23.65%,发生频
率为 5.01%;三核苷酸重复为 198个 ,占总 SSR的
14.06%,发生频率为 2.98%;四 、五 、六核苷酸重复
较少 ,分别有 26 、11 、27个;共占总 SSR的 4.55%,
发生频率共计 0.97%。各类 SSR的总长度最大值
为 17 634 bp ,最小值为 259 bp ,总长度从大到小的
排列顺序与 SSR位点数量多少的顺序相同 。各类
SSR的平均长度差异较大 ,六核苷酸重复最长 ,为
28.74 bp ,四核苷酸最短 ,为 18.15 bp。每 Mbp 核
苷酸序列上包含的 SSR位点总数为 275.81 ,其中每
Mbp核苷酸序列包含的单核苷酸 SSR位点数最多 ,
五核苷酸 SSR 位点数最少。每 8.17 个 Uni-EST
中存在一个单核苷酸 SSR位点 ,发生频率最高 ,其
次为二核苷酸 、三核苷酸;每 603.91个 Uni-ES T 中
存在一个五核苷酸 SSR位点 ,发生频率最低 。
2.3　EST-SSR重复基元的类型特征:马蹄香基因组
中主要重复基元的数目 、种类见表 2。单核苷酸 SSR
中的重复基元为A/ T 和 C/G ,其中 A/ T 基元 807条
占到该类基元的 99.26%。二核苷酸 SSR中重复基
元有 3 种 ,其中 AG/CT 基元数目最多 , 有 286 条
(85.89%), AC/GT 最少 ,为 6条(2.70%), 见图 1。
表 2　马蹄香基因组中 EST-SSR的主要基元
Table 2　Main repeat motifs in EST-SSR of S.henryi
基元 数量 基元 数量 基元 数量 基元 数量
A/ T 807 AG/CT 286 AAG/CTT 102 A AAG/CTTT 10
C/G 6 A T/ AT 38 AG C/GCT 27 A TAG/CTA T 3
AC/ GT 9 AGG/CCT 17 A AAC/GTTT 3
A TC/GA T 16 AAA T/A TTT 3
A CC/GGT 11 A ATC/GATT 2
AAC/G TT 9 A ATG/CATT 1
CCG/CGG 6 AAGG/CCTT 1
A CG/ CGT 5 ACCT/AGG T 1
AA T/ ATT 3 ACG C/GCGT 1
ACT/AG T 2 AGCC/GGCT 1
共计 813 333 198 26
图 1　马蹄香基因组中二核苷酸重复基元组成百分比
Fig.1　Percentage of dif ferent motifs in dinucleotide
repeats of S.henry i
·466· 中草药　Chinese Traditional and Herbal Drugs　第 41 卷第 3 期 2010 年 3 月
三核苷酸 SSR中重复基元的种类最丰富 ,有 10种 ,
共计 198条 ,其中 AAG/CT T 基元的数量最多 ,出
现了 102次(51.52%),见图 2。四核苷酸SSR中的
重复基元有 10种 ,数量较少 ,仅 26条。
图 2　马蹄香基因组中三核苷酸重复基元组成百分比
Fig.2　Percentage of different mot ifs in trinucleotide
repeats of S.henryi
3　讨论
表达序列标签在国际公共数据库中迅猛增长 ,
为遗传分析提供了丰富资源。现有文献报道表明在
不同物种中 SSR出现的频率各不相同 ,本研究从
6 643条 Uni-ES T 序列中检索到 1 408 个 SSR 位
点 , 1 232条含 SSR ,占 Uni-ES T 总数的 18.55%,
高于油菜(13.58%)[ 8] 、人参(9.37%)[ 9] 、水稻
(4.7%)、玉米(1.4%)[ 10] 等物种 ,表明马蹄香 EST
中可能含有较为丰富的 SSR。ES T-SSR的频率一
般是通过搜索数据库中 EST 序列估算出来的 ,当采
用不同搜索 SSR长度 、重复类型等标准以及分析数
据多少不同时 ,均可能造成 EST-SSR的分布频率 、
特点等发生较大变化 ,导致统计结果不一致 ,这种差
异也可能是物种间 SSR信息差异的真实体现。
从目前的报道来看 ,大多数植物的 ES T-SSR
主要属于二 、三核苷酸重复类型 ,但不同物种间主导
重复基元的类型有所差异 。例如在拟南芥 、大
豆[ 11] 、柑橘[ 12] 等中以三核苷酸重复为主 , 在茶
树[ 13] 、人参[ 9] 、猕猴桃[ 14] 等中二核苷酸重复占了主
导地位 ,而在油菜[ 8] 、黄瓜[ 15] 、谷子[ 16] 中二 、三核苷
酸重复所占比例较为接近 。与其他物种相比 ,马蹄
香的 ES T-SSR 既与它们有相似性又具有自身特
点。马蹄香的 EST-SSR以单核苷酸为主 ,其中 A/
T 基元最多 。其次为二核苷酸重复类型 ,并且与报
道的多数植物相同 , AG/CT 在马蹄香的二核苷酸
重复类型中占绝对优势。三核苷酸重复种类最为丰
富 ,其中 AAG/CTT 重复最多 , 与 Gao 等[ 17] 对大
豆 、Cardle等[ 18] 对拟南芥 、金基强等[ 13] 对茶树的研
究结果类似 ,进一步验证了 Gao 等[ 17] 关于在双子叶
植物中 AAG/CTT 重复丰度很高的推测。
在 cDNA 文库中 ,高表达基因转录过于丰富 ,
测序后会产生冗余 ES T ,随机或鸟枪法测序也会产
生冗余 EST ,此外数据库中的 EST 是由不同研究
者登记的 ,也会导致同一表达基因的 EST 重复出
现 。冗余数据可能由于存在大量的错误而难以处
理 ,对分析 SSR信息也会产生重要影响 ,因此本研
究采用 Sequencher 4.8 软件进行辅助处理 , 得到
6 643条无冗余 ES T ,为进一步明确马蹄香的 EST-
SSR信息奠定了基础。
由于真核生物基因存在 Po ly(A)和 Poly(T)结
构 ,而这一结构上的单核苷酸重复不能算作 SSR重
复序列[ 19] ,因此在微卫星引物开发过程中这些单核
苷酸重复序列被认为是无用的 ,予以删除 。马蹄香
Uni-ES T 序列中共有 722 条含有单核苷酸重复的
Uni-ES T 序列 ,510条不含有单核苷酸重复的 Uni-
EST 序列 ,这 510条序列将用于后续的引物开发 。
本研究明确了马蹄香 EST-SSR的基本特性 ,
为进一步开发 EST-SSR标记奠定了基础 ,对加速
马蹄香 EST 资源的开发利用 、遗传多样性评价 、特
定性状的辅助选择 、比较基因组学研究等都具有重
要意义 。
参考文献:
[ 1] 　中国植物志编辑委员会.中国植物志[ M].北京:科学出版
社 , 1988.
[ 2] 　Gregory M P.A phyletic rearrangement in the Aristolochi-
aceae [ J].Amer J Bot , 1956 , 43:110-122.
[ 3] 　徐文友 ,袁伍会 ,王桂莲 , 等.马蹄香的生药学研究[ J].西安
医科大学学报 , 1996 ,17(1):74-76.
[ 4] 　Igarashi S , Fukuda H. The Li fe H istor ies o f Asian B ut ter-
f l ies [ M ].T okyo:Tokai Universi ty Press , 1997.
[ 5] 　陈灵芝.中国的生物多样性———现状及保护对策[ M].北京:
科学出版社 , 1993.
[ 6] 　彭　强 ,赵　桦 ,张国柱.马蹄香的生药学鉴定及其与华细辛
的鉴别[ J].中草药 , 2005 , 36(2):277-280.
[ 7] 　Kofler R , Schlö erer C , Lelley T. SciRoKo:a new tool for
w hole genome microsatelli te search and inves tigation [ J].
B ioin f ormat ics , 2007 , 23:1683-1685.
[ 8] 　李小白 ,张明龙 , 崔海瑞.油菜 EST 资源的 SSR 信息分析
[ J].中国油料作物学报 , 2007 , 29(1):20-25.
[ 9] 　杨成君 ,王　军.人参 EST 资源的 SSR信息分析[ J].植物生
理学通讯 , 2008 , 44(1):69-73.
[ 10] 　Kan tety R V , Rota M L , Mat th ew s D E. Data mining for
sim ple sequence repeats in expressed sequence tag s f rom bar-
ley maize , rice , sorghum and w heat [ J]. P lant Mo l Bio l ,
2002 , 48:501-510.
[ 11] 　Cardle L , Ramsay L , Milbourne D , et al.Compu tat ional and
ex perimental characterization of physical ly clustered simple
·467·中草药　Chinese Traditional and Herbal Drugs　第 41 卷第 3 期 2010 年 3 月
sequence repeats in plants [ J]. Genetics , 2000 , 156:847-
854.
[ 12] 　C hen C X , Zh ou P , Choi Y A , et a l.Mining and characteri-
zing microsatelli tes f rom cit rus ESTs [ J].Theor A ppl Genet ,
2006 , 112:1248-1257.
[ 13] 　金基强 ,李素芳 ,龚晓春 ,等.茶树 EST 资源中 SSR的信息分
析[ J].科技通报 , 2006 , 22(4):471-476.
[ 14] 　F raser L G , Harvey C F , C rowhurst R N , et al. EST-de-
rived microsatellit es f rom Act inid ia species and thei r poten tial
for mapping [ J].Theor A pp l Genet , 2004 , 108:1010-1016.
[ 15] 　Kong Q , Xiang C , Zh ang C , et a l.Mining charactering mic-
rosatel lit es in Cucum is melo expressed sequence tags f rom se-
quence database [ J].Mol Ecol Notes , 2007 , 7:281-283.
[ 16] 　Jia X P , Shi Y S , Song Y C , et a l.Development of EST-SSR
in foxtai l millet (S etar ia italica)[ J]. Genet Resour Crop
E vo l , 2006 , 54:233-236.
[ 17] 　Gao L F , T ang J F , Li H W , et al.Analysis of m icrosatel-
lit es in major crop s assessed by com putat ional and experimen-
t al approaches [ J].Mol Breed , 2003 ,12:245-261.
[ 18] 　Cardle L , Ramsay D , Milbourne D , et al.Compu tat ional and
ex perimental characterization of physical ly clustered in simple
sequence repeats in plants [ J].Genet ics, 2000 , 156:847-
854.
[ 19] 　孙佳莹 ,辛大伟 ,单彩云 ,等.SS 标记开发软件 SSR MINING
1.0的编制[ J].中国农业科学 , 2008, 41(10):3336-3342.
喜树枝叶采收型品系海喜 1号喜树碱的组织分布特征研究
于景华 ,常　影 ,张学科 ,祖元刚＊① ,唐中华 ,贾雪莹
(东北林业大学 森林植物生态学教育部重点实验室 , 黑龙江 哈尔滨　150040)
摘　要:目的　研究喜树枝叶采收型品系海喜 1 号喜树碱的组织分布特征 ,为合理利用提取依据。方法　以四川
种源的普通喜树为对照 ,采用高效液相色谱法 , 检测了喜树品系———海喜 1 号各器官不同组织部位喜树碱的量。
结果　各器官不同组织部位 ,海喜 1 号喜树碱量普遍高于普通喜树 , 特别是半木质化枝条韧皮部显著高于普通喜
树(P<0.01),幼叶喜树碱量显著高于普通喜树(P<0.05);不同品系的喜树均表现出幼嫩枝叶喜树碱量高于成熟
组织的特点 ,但喜树碱在不同器官的组织分布模式并不相同 , 幼嫩器官和主根为离心式分布 , 而成熟器官(木质化
枝条 、主干)是向心式分布。结论　海喜 1 号具有枝叶一年多次 、连年采收利用模式的种质类型 , 喜树碱在海喜 1
号中的这种分布模式反映了喜树碱化学防御功能作用的转变。
关键词:喜树;品系;喜树碱;组织分布
中图分类号:R282.2　　　文献标识码:A　　　文章编号:0253-2670(2010)03-0468-05
Distribution characteristics of camptothecin in branches and leaves of harvest pattern
Camptotheca acuminataHisun-Ⅰ
YU Jing-hua , CHANG Ying , ZHANG Xue-ke , ZU Yuan-gang , TA NG Zhong-hua , JIA Xue-ying
(Key Labor ator y of Fo rest Plant Ecolog y , Ministry of Education , Northea st For estry Univ ersity , Harbin 150040 , China)
Abstract:Objective　To study the tissue dist ribution characteristics of harvest pattern campto thecin
(CPT)in branches and leaves of Camptotheca acum inataHisun-Ⅰ(HI).Methods　Taking the variety of
C.acum inata o riginal ly f rom Sichuan Province(SC)as control , the contents of CPT in di fferent tissues of
the o rgans in C.acuminata HI w ere detected by HPLC.Results　In the dif ferent t issues , the CPT level in
C.acum inata of H I w as higher than that in C.acum inata of SC , especially in the semi-lignif ied branch of
phloem (P<0.01)and young leaves(P<0.05).All the dif fe rent st rains of C.acuminate show ed that the
contents of CPT in young leaves and branches are highe r than those in mature t issue , but the distribution
pat tern of CPT in the di fferent tissues of o rgans w as distinct.In the tender o rg ans and main roo ts , the dis-
t ribution w as in an efferent w ay and in the lignif ied branch and main stem o rgans , the distribution w as in
an af ferent model.Conclusion　The line of HI is the germ plasm type suitable fo r multiple times in one
year and consecutive years fo r harvest.The dist ribution pat tern of CPT in H I might be co rrelated w ith the
·468· 中草药　Chinese Traditional and Herbal Drugs　第 41 卷第 3 期 2010 年 3 月
①收稿日期:2009-06-10　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　基金项目:国家自然科学基金资助项目(30840019);黑龙江省自然科学基金资助项目(C200511 , C0233)作者简介:于景华(1972—),黑龙江省庆安县人 ,副教授,博士 ,长期从事植物种质资源及新种质选育 、生理生态特性等领域的教学和研究工作 ,在该领域已发表 20余篇研究论文 ,出版学术专著 3部 ,获国家级科技奖励 1项。
Tel:(0451)82190259　E-mail:jing huay@gm ail.com＊通讯作者　祖元刚　T el:(0451)82191517　Fax:(0451)82102082　E-mail:zygorl@vip.hl.cn