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黑龙江省两种金丝桃属植物RAPD反应的初步研究



全 文 :收稿日期:2011-09-16
黑龙江省两种金丝桃属植物RAPD反应的初步研究
孟令锴1,李洁2,高长久1
(1.牡丹江医学院,黑龙江 牡丹江 157011 2.牡丹江医学院红旗医院)
摘 要:利用RAPD技术,对黑龙江省金丝桃属两种植物进行DNA分子遗传标记鉴别,从30种随机引
物中筛选出,对乌腺金丝桃、长柱金丝桃扩增具有较明显多态性的3种引物,进而从基因水平探讨其遗
传本质。结果表明:引物S75、S76、S80可作为乌腺金丝桃、长柱金丝桃的高特异性引物,用这三种鉴别
引物对样品的DNA进行PCR反应,经琼脂糖凝胶电泳,就可以准确鉴别。
关键词:长柱金丝桃;乌腺金丝桃;RAPD
Two Species of HypericumRAPD Reaction in Heilongjiang Province
Meng Lingkai 1,Li Jie2,Gao Changjiu1
(1.Mudanjiang Medical Colege,Mudanjiang,Heilongjiang157011
2.Hongqi Hospital,Mudanjiang)
Abstract:By the biological technique RAPD,We identified two species medicinal plants of Hypericumin
Heilongjiang by DNA molecular genetic marker.From 30random primers screened,the more obvious of
H.attenuatumChoisy.,Hypericum.ascyronL.amplified polymorphic with three kinds of primers,and
then from the gene level of their genetic nature.The results showed that:primers S75,S76,S80can be
used as H.attenuatumChoisy.,Hypericum ascyron L.of high-specific primers,using the three primer
to identify the DNA samples for PCR reaction by agarose gel electrophoresis,can accurately identifica-
tion.
Key words:Hypericum ascyron L.;H.attenuatumChoisy;RAPD
  金丝桃属(HypericumL.)为藤黄科(Clusiaceae)。
该属全世界约有400余种,我国有55种,8亚种。该属
植物的一些种在国内外广为药用,主要用于治疗抑郁
症、肝炎、痢疾,有抗菌消炎、镇痛、收敛等功效。传统
中医药学认为其具有清热解毒、收敛止血、利湿之功
效,用于治疗咯血、吐血、外伤出血、风湿骨痛、口鼻生
疮等症[7]。国内外对该属植物的研究极为重视。黑龙
江省分布的乌腺金丝桃(H.attenuatumChoisy.)和长
柱金丝桃(H.ascyron L.)的研究较少,主要集中在原
植物形态、生药性状、显微特征及部分化学成分含量的
测定及分析等传统生药学领域。
在目前生药学研究中,主要应用形态学、组织学、
化学等物种特异性遗传标记特征,这些特征特别是以
形态学为基础的鉴别方法虽然有着简便、易行等优点,
然而有很多特征为生物体的遗传物质与外界环境及其
他多种因素共同作用的结果,他们在受遗传因素影响
的同时,也受到如土壤、气候、阳光等因素的影响,而
DNA作为遗传物质,他保持着遗传特性,不受外界因
素影响,用DNA遗传物质进行物种鉴定,具有准确性
和可靠性。为此,本研究对金丝桃属两种药用植物进
行RAPD反应的初步研究,旨在为黑龙江省金丝桃属
植物RAPD的有效鉴定奠定基础
1 材料与方法
1.1 材料与仪器
取供试材料植株新鲜嫩叶片经硅胶干燥保存。乌
腺金丝桃:2011年7月采于黑龙江省牡丹江镜泊湖地
区。长柱金丝桃:2011年7月采于黑龙江省横道河地
区;PCR扩增仪,Thermo Electron Corporation;YLN-
2000凝胶成像分析系统,北京亚力恩机电技术研究
所;DYY-8B电泳仪,北京六一仪器厂;DU-800核酸蛋
白质分析仪,美国BECKMAN公司。
1.2 试剂
随机引物(primer)、DGL2000DNA Marker、Taq
DNA聚合酶、dNTPs、10×buffer、mgcl2、琼脂糖均购
自上海生工生物工程技术服务有限公司。
1.3 实验方法
1.3.1 基因组DNA提取
采用北京鼎国生物工程技术服务有限公司生产的
03
第1期(总第116期) 中 国 林 副 特 产 No.1(GSNO.116)
2012年2月 Forest By-Product and Speciality in China  Feb.2012
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DOI:10.13268/j.cnki.fbsic.2012.01.009
植物基因组DNA抽提试剂盒提取。
操作步骤:
第1步:组织≤0.5g,液氮研磨,加入1mL溶液B,
反复摇均,室温5min。
第2步:加入2.5mL溶液C,20μL溶液 A,充分
摇均,室温放置20min。
第3步:≥8000rpm离心3min。
第4步:取上清,加入50μL溶液D,≥8000rpm离
心1min,弃上清。
第5步:加入80μL溶液C,摇均,≥8000rpm离心
5min,弃上清。
第6步:加入1mL溶液E,摇均,≥8000rpm离心
30~60s,弃上清。
第7步:重复步骤6。
第8步:≥12000rpm离心30~60s,吸干上清,室
温敞开晾干约5~10min。
第9步:取250μL溶液F,摇均,40~50℃水浴3~
5min。
第10步:≥12000rpm离心30~60s,取上清,即为
DNA。
1.3.2 供试材料基因组DNA检测
供试材料基因组DNA 质量检测在DU-800核酸
蛋白质分析仪上进行。取1μL的 DNA溶液和99μL
的TE Buffer于石英比色皿中,混匀,以TE Buffer为
对照液,测定波长260nm、280nm的OD260、OD280值,计
算OD260/OD280的比值以得样品的纯度,并按总DNA
含量(μg/mL)=OD260×50×100,计算各样品DNA的
浓度。
1.3.3 RAPD反应
反应总体积25μL。依次加超纯水,1μmol/L引
物,10 倍 PCR 缓冲液 (10mmol/L Tris,pH9.2),
25mmol/L KCl,1.5mmol/L MgCl2,0.2mmol/L
dNTPs,40ng左右模板DNA,1UTaq酶。
扩增程序:
①193℃,2min。
②293℃变性1min,36℃退火1min,72℃延伸反
应1.5min,45个循环。
③72℃,保温5min,循环结束后反应产物置于4℃
保存。
1.3.4 随机引物的筛选
从样本中选出具有代表性的且总DNA质量相对
较好的样品作为代表,利用上文中得到的反应条件进
行PCR扩增,在30个随机引物中(10bp)进行筛选,选
择具有稳定的、能扩增出具有多态性带的有效引物。
1.3.5 PCR产物鉴定与记录
PCR产物用1.5%琼脂糖凝胶电泳(在1×TAE
中)分离与鉴定,在紫外透射仪上观察与照相,以
DGL2000为DNA分子量标准。
2 结果
2.1 供试材料总DNA的质量
DNA 质 量 在 DU-800 上 测 定 OD260、OD280 及
OD260/OD280值及浓度。见表1。
表1 供试材料基因组DNA的紫外分析结果
样品名称 OD260 OD280 浓度/(ng·mL-1) OD260/OD280
乌腺金丝桃 0.048  0.025  240  1.920
长柱金丝桃 0.055  0.030  275  1.834
2.2 引物筛选结果
图1 部分引物筛选结果
注:1:空白、2:Marker、Sangon引物3:S10 4:S74 5:S75 6:S76
7:S77 8:S78 9:S80
2.3 供试材料基因组的部分指纹图谱
图2 乌腺金丝桃、长柱金丝桃RAPD指纹图谱
注:0:空白1:S75乌腺金丝桃;2:S75长柱金丝桃;3:S76乌腺金
丝桃;4:S76长柱金丝桃;5:S80乌腺金丝桃;6:S80长柱金丝桃;7:
Marker
由扩增图谱可知:S75、S76、S80引物对乌腺金丝
桃及长柱金丝桃基因组DNA扩增,图谱表明两种植物
均在200bp左右有相同长度条带,同时也有不同的条
带出现,说明其在遗传上既具有相似性,又存在差异,
根据这些差异可以有效鉴别金丝桃属两种近缘植物乌
腺金丝桃及长柱金丝桃。如应用S75乌腺金丝桃在
2000bp左右有一DNA谱带出现,而长柱金丝桃此条
带缺失,该条带的有无可以有效鉴别这两种近缘植物。
3 结论
本课题研究结果显示,应用 RAPD方法可以准
确、快速、简便地鉴定中药,且只需很少量的样品就可
完成。引物S75、S76、S80可作为乌腺金丝桃、长柱金
丝桃的高特异性引物,用这三种鉴别引物对样品的
DNA进行PCR反应,经琼脂糖凝胶电泳,就可以准确
鉴别。
作者简介:孟令锴(1980-),男,黑龙江齐齐哈尔人,讲
师,硕士,研究方向:生药鉴定及品质评价。E-mail:mLk720
@163.com。
13
2012年 孟令锴等:黑龙江省两种金丝桃属植物RAPD反应的初步研究 第1期
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