全 文 :湖 北 农 业 科 学 2011 年
(责任编辑 王 珞)
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第 50 卷第 16 期
2011年 8 月
湖北农业科学
Hubei Agricultural Sciences
Vol. 50 No.16
Aug.,2011
收稿日期:2011-01-19
基金项目:安徽省教育厅科研项目(KJ2010B015)
作者简介:魏胜华(1972-),男,安徽蚌埠人,讲师,博士,从事微生物学研究,(电话)13855316466(电子信箱)dreammn@126.com。
DNA 的提取与纯化是进行分子标记试验最关
键的一步, 获得高质量的 DNA 样品是进行 PCR 扩
增的首要步骤[1]。从植物材料中提取基因组 DNA 的
质量受到多种因素的影响,在不同植物或同种植物
不同时期组织中存在着不同数量的多糖、色素以及
种类繁多的次生物质,特别是多糖、酚类在提取过
程中可与 DNA 产生沉淀,形成包裹 DNA 的黏稠胶
状物,其难以溶解或产生褐变,使得 DNA 提取质量
较低,获得的 DNA 溶液常常黏度大乃至呈胶状,这
些物质如果清除不净则会影响后续的试验研究[2-4]。
大戟属(Euphorbia Linn)为大戟科(Euphorbiaceaec)
植物中最大的一属,全世界有2 000 余种 [5],其中不
改良 CTAB法提取大戟属药用植物叶片总 DNA试验
魏胜华,孟 娜
(安徽工程大学生物与化学工程学院,安徽 芜湖 241000)
摘要:由于大戟属(Euphorbia Linn)植物叶片中含大量的多糖、酚类等次生代谢物质,严重影响总 DNA 的
提取,因此,以大戟属药用植物叶片为材料,对常用的 CTAB(Hexadecyltrimethy ammonium bromide)法进
行了改良,并通过琼脂凝胶电泳法对所提 DNA 样品进行了检测。 结果表明,改良 CTAB 法提取的植物总
DNA 纯度很高,较适合提取大戟属植物的总 DNA。
关键词:大戟属;药用植物;CTAB 法;总 DNA 提取
中图分类号:Q949.753.5;Q503 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2011)16-3418-03
A Modified CTAB Method for Total DNA Extraction from the Medicinal Herb Leaves
of Euphorbia Linn
WEI Sheng-hua,MENG Na
(College of Biology and Chemical Engineering, Anhui Polytechnic University,Wuhu 241000,Anhui, China)
Abstract: The cells in Euphorbia Linn leaves were rich in amylose and hydroxybenzene. These substances provided some se-
riously adverse effects on extraction of DNA from Euphorbia. Using the leaves of Euphorbia as material, the DNA were ex-
tracted by a modified CTAB (Hexadecyltrimethy ammonium bromide) method and detected by means of agarose gel elec-
trophoresis. The results showed that the modified CTAB method was suitable for extraction of its’ DNA and it was a good-
method for total DNA extraction from Euphorbia.
Key words: Euphorbia Linn; medicinal herb; hexadecyltrimethy ammonium bromide(CTAB) method; total DNA extraction
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2011.16.049
第 16 期
少种具有很高的药用价值,李忠国[6]调查发现,安徽
省琅琊山药用植物资源中有 22 种大戟科药用植
物;李惠等 [7]通过研究华东地区大戟属药用植物资
源后,整理出了 26 种大戟属药用植物,并且药用部
位明确,疗效确切,具有较高的药用价值。 大戟属药
用植物的医药价值使得其研究开发成为了热点,尤
其是对大戟属药用植物在分子水平上的探讨方兴
未艾。 目前在大戟属药用植物进行分子标记试验
中,由于本属植物具有白色或黄白色乳汁,含酚类、
黄酮类等次生物质较多,若提取方法不当,不仅提
取出来的 DNA 容易降解, 而且会影响 PCR 扩增反
应的稳定性和重复性。 因此,如何高效简便地去除
多糖、 多酚等次生物质, 对提取纯化大戟属植物
DNA至关重要。目前,大戟属药用植物总 DNA提取
方法的研究在国内外尚未见报道,所以在前期研究
的基础上 [8,9],结合本属植物特点,以经典提取植物
DNA 的 CTAB (十六烷基三乙基溴化铵,Hexade-
cyltrimethy ammonium bromide)法为基础[10],并加以
改进, 筛选出一种比较适合大戟属植物 DNA 提取
的方法,为大戟属药用植物进一步开发利用提供技
术支持。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 供试材料 试验所用植物材料为采自安徽
省琅琊山的大戟 (E. pekinensis Rupr.)、月腺大戟
(E. ebracteolata Hayata);采自芜湖市的乳浆大戟(E.
esula L.)、斑地锦(E. supina Rafin)、地锦(E. humi-
fusa Willd.)、 一 品 红 (E. pulcherrima Willd. et
Klotzsch.),原植物均经安徽师范大学周守标教授鉴
定。 用于提取 DNA 的材料为各供试植物的新鲜叶
片,采后迅速置于冰盒中,带回实验室后,除去主叶
脉,在电子天平上精确称取 0.5 g,于-20 ℃冰箱保存
3 d。
1.1.2 主要试剂 ①DNA 抽提缓冲液 ,NaCl 500
mmol / L,Tris-HCl 100 mmol / L、pH 值 8.0 和 EDTA
20 mmol / L、pH 值 8.0。 ②DNA 裂解缓冲液 ,NaCl
700 mmol / L, Tris -HCl 50 mmol / L、 pH 值 8.0 和
EDTA 20 mmol / L、pH 值 8.0,CTAB 5%(m/V),β-巯
基乙醇 1%(用前加)[11]。 ③TE 缓冲液,Tris-HCl 10
mmol / L、pH值 8.0 和 EDTA 1 mmol / L、pH值 8.0。④
50×TAE 缓冲液,Tris 242 g,冰乙酸 57.1 mL,EDTA
(0.5 mol / L、pH值 8.0)100 mL。⑤氯仿-异戊醇混合
液(体积比为 24∶1,下同)。 配制药品用的水均为双
蒸馏水。 将以上缓冲液分装后,密封、灭菌,置于冰
箱 4℃保存。
1.1.3 主要仪器 试验中的主要仪器有凝胶成像
仪、微波炉、离心机、超低温冰箱、电泳槽、电泳仪、
手掌型离心机、恒温水浴锅、电热恒温鼓风干燥箱、
超净工作台等。
1.2 方法
1.2.1 改良 CTAB 法提取植物总 DNA ①提取前
将裂解缓冲液放至 65 ℃水浴中。 ②称取 0.5 g植物
材料,用液氮速冻后,迅速研磨成细粉,分装于 1.5
mL 的 Eppendorf 管中。 ③在 Eppendorf 管中加入 1
mL DNA 提取缓冲液, 用力摇动使其充分混匀后,
于 15 ℃、8 000 g离心 5 min。④静止后弃上清,再加
入 1 mL DNA 提取缓冲液 ,充分混匀 ,于 15 ℃ 、
8 000 g 离心 5 min。 ⑤静止后弃上清, 加入 1 mL
65 ℃预热的 DNA 提取缓冲液, 悬浮沉淀, 充分混
匀,放入 65 ℃水浴 30 min。 ⑥于 15 ℃、12 000 g离
心 5 min,取上清,加入等体积的氯仿-异戊醇混合
液,轻轻颠倒混匀,静置 10 min。⑦于 15 ℃、12 000
g 离心 5 min,取上清,加入等体积的异丙醇,充分混
匀,4 ℃静置 30 min 。 ⑧于 15 ℃、12 000 g离心 10
min,静止后弃上清,加入 75 %(V/V)乙醇洗数次。
⑨于 15 ℃、12 000 g离心 3 min, 静止后弃上清,自
然风干直至无酒精味。 ⑩加入 100 μL TE 缓冲液,
放入 4 ℃环境待用,或-20 ℃储存。
1.2.2 电泳检测 对所提取的 DNA 取 3~5 μL 于
0.8%的琼脂糖凝胶上,以 5 V / cm 电泳 1 h 左右,EB
染色 20~25 min,在凝胶成像系统(AlphaImager)中
观察和拍照。
2 结果与分析
2.1 DNA电泳结果
将叶片各部位提取的 DNA 进行琼脂糖凝胶电
泳, 检测结果见图 1。 DNA 电泳结果显示, 改良
CTAB 法所提取的大戟属植物叶片的 DNA 为一条
清晰完整的条带,DNA 片段大小较一致, 条带后面
没有明显的拖尾, 证明所提叶片的总 DNA 含杂质
较少。
M.Marker;1.大戟;2.月腺大戟;3.乳浆大戟;4.地锦;5.斑地锦;6.一品红
图 1 改良 CTAB 方法提取的总 DNA 电泳图
6 5 4 3 2 1 M
魏胜华等:改良 CTAB 法提取大戟属药用植物叶片总 DNA 试验 3419
湖 北 农 业 科 学 2011 年
2.2 总 DNA纯化
加入等体积的氯仿-异戊醇混合液, 轻缓颠倒
混匀, 室温静置 10~15 min; 于 12 000 g 离心 10
min;重复前面步骤。 取上清液,加入终浓度 0. 2~0.
4 mol / L 的 NaAc、12 倍体积的无水乙醇,放置 1 h。
12 000 g离心 10 min,弃上清液。 用 70 %乙醇洗涤
沉淀 2~3 次,自然干燥后,溶于 50~100 μL TE中,-
20 ℃保存备用。
3 讨论
虽然植物 DNA 的提取是一项常规的分子生物
学实验技术,但由于大戟属植物组织细胞中含有大
量的酚类、多糖及其他次生代谢产物,使得用传统
的 CTAB 方法难以分离出高质量的 DNA,如果提取
方法选择不当,会干扰后续的操作。 作者对大戟属
植物叶片总 DNA 的提取过程经过反复的改进,最
后提取出了质量较高的总 DNA,并在提取中总结出
以下操作事项,以期为大戟属药用植物的分子生物
学研究提供技术支撑。
1)首先,用于 DNA 提取的植物材料是从远离
实验室的野外采集获得,新鲜材料在旅途中容易枯
萎、腐烂,特别是一些离体材料极易受到 DNA 酶的
作用,导致 DNA的降解。 因此采集后必须迅速置于
冰盒中,带回实验室。
2)植物材料在研磨时,一定要使材料处于低温
状态, 而且所用研钵应该是预先在-20 ℃冰箱冷冻
过夜、待其彻底冷却后再放入植物材料。 在研磨过
程中,确保不要让液氮挥发干净,以防止植物材料
回温,否则会造成 DNA 的严重降解;研磨叶片时,
粉末研得越细越好, 研磨好的材料非常容易变褐,
宜迅速转入 Eppendorf 管中,不要使之融化,以免造
成 DNA的降解。
3)在提取 DNA 的过程中,所有的操作均需要
动作轻柔,避免剧烈振动,以免 DNA断裂降解。
4)在用氯仿-异戊醇混合液抽提时,离心温度
应保持不低于 15 ℃;若温度太低,可能导致 CTAB
沉淀,从而损失 DNA;在离心前增加氯仿-异戊醇混
合液和提取缓冲液的接触时间,让杂质更好地被分
离,减少用氯仿-异戊醇混合液的抽提次数,避免操
作过程中 DNA的污染。
5)CTAB 是一种阳离子去污剂, 既能有效裂解
植物的细胞壁,又能去除多糖类物质,还可以溶解
细胞膜,较好去除多糖的干扰。在加入 CTAB缓冲液
进行温浴时,将时间延长至 2 h 能更好地处理多糖、
酚类及其他杂质,所获得的 DNA质量也将较高。
6)在提取过程中,采用常规 CTAB 法常出现多
酚类物质的褐化现象,使 DNA 溶液颜色产生浑浊。
β-巯基乙醇具有抗氧化作用, 在改良 CTAB 法中,
提取液中加入 1% β-巯基乙醇可以有效地去除植
物组织内的多糖物质和多酚类物质,防止酚类物质
造成褐化现象。
7)PCR 技术对 DNA 样品量和纯度的要求均不
高,但因 PCR 具有很高的灵敏度,为防止试剂交叉
污染,应尽量减少提取步骤;采用改良的 CTAB 法提
取大戟属植物 DNA,能够获得高质量的 DNA样品。
8)在 DNA 提取过程中,用异丙醇沉淀时,若异
丙醇未挥发尽, 会直接影响 Taq DNA 聚合酶的活
性,试验中应该让异丙醇沉淀离心后充分挥发。
9)在 DNA 提取过程中,氯仿是蛋白的有效沉
淀剂,对 Taq DNA聚合酶有变性作用。
10)DNA 沉淀出现后 , 絮状沉淀不一定全是
DNA 沉淀,判断絮状沉淀的标准是看其是否易溶于
TE,若易溶则说明其杂质含量较少,若难溶则说明
其杂质含量较高,纯度较差。 而 TE溶解是一个比较
缓慢的过程,为了充分溶解,通常在 4℃条件下溶解
1 d。
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