免费文献传递   相关文献

德国小蠊变应原Bla g 8的克隆表达及进化分析



全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2012年第9期
收稿日期 : 2012-02-27
基金项目 : 贵州省社发攻关项目(黔科合 S 系 [2007]1038), 贵阳医学院研究生创新计划专项基金
作者简介 : 龙高群 , 女 , 硕士 , 研究方向 : 医学昆虫分子生物学 ; E-mail: longgaoqun@126.com
通讯作者 : 张春林 , 男 , 硕士 , 教授 , 研究方向 : 医学昆虫分子生物学 ; E-mail: zcl@gmc.edu.cn
德国小蠊(Blattella germanica)属节肢动物门、
昆虫纲、有翅亚纲、蜚蠊目、蜚蠊科,其体内外均
能携带多种病原体,如痢疾杆菌、沙门氏副伤寒甲、
乙杆菌、变形杆菌及蛔虫、钩虫、蛲虫、兰氏贾弟
鞭毛虫等,机械式的传播疾病,而且还是主要昆虫
过敏原之一,其体壁及分泌物等是重要的过敏原,
可引起变态反应[1],使过敏体质的人出现皮疹、哮
喘和打喷嚏等症状[2]。
有报道指出,以重组变应原用于免疫治疗,可
以显著降低患者的IgE结合能力,具有很好的疗效[3]。
Jone 等[4]通过研究也肯定了蟑螂重组变应原的诊断
和免疫治疗上的作用。在疫苗研究方面,Zhou 等[5]
研制的表达 Bla g 1 的 DNA 疫苗和 Yang 等[6]研制
的表达 Bla g 2 的质粒 DNA 遗传性疫苗均对蟑螂过
敏患者具有保护和治疗功效。在重组疫苗优化方面,
Kagen 等[7]对重组疫苗进行了优化,研究出了一种
新的更安全的方法,可以保持人类疫苗中变应原的
稳定性。由此可见,获得编码德国小蠊变应原 Bla g
德国小蠊变应原 Bla g 8的克隆表达及进化分析
龙高群 张春林
(贵阳医学院生物教研室,贵阳 550004)
摘 要: 通过 5-RACE获得德国小蠊变应原 Bla g 8基因的全长 cDNA序列,进行生物信息学分析,构建原核表达载体,诱
导重组蛋白表达,建立系统进化树,为进一步研究奠定基础。通过 5-RACE技术,PCR扩增获取编码德国小蠊变应原 Bla g 8蛋白
的全长 cDNA序列;采用生物信息学方法分析预测 Bla g 8蛋白的信号肽、疏水性、跨膜区、二级结构、三级结构;建立系统进化树;
构建原核表达载体 pET32a-B8,IPTG诱导重组蛋白表达,并用 His-tag抗体Western blotting验证。结果显示,获得编码德国小蠊变
应原 Bla g 8的全长 cDNA序列,其完整阅读框含 618个碱基,编码 205个氨基酸。序列分析显示该蛋白,肌球蛋白轻链,具有 EF
手蛋白保守功能域。IPTG诱导获得重组蛋白。获得德国小蠊 Bla g 8的完整 cDNA序列,成功构建重组原核表达质粒 pET32a-B8,
并表达出融合蛋白。
关键词: 德国小蠊 变应原 序列分析 原核表达
Molecular Cloning and Expression of Bla g 8 Gene from
Blattella germanica
Long Gaoqun Zhang Chunlin
(Department of Biology,Guiyang Medical College,Guiyang 550004)
Abstract: It was to clone the Bla g 8 gene of Blattella germanica,analyze its sequence,express recombinant protein of the Blattella
germanica Bla g 8,predict the protein structure. Base on a fragment sequence of the Bla g 8 from NCBI,obtained full-length Bla g 8 sequence
by RACE. Constructed the recombinant plasmid pET32a(+)-B8,expressed His-B8 fusion protein in E. coli BL21(DE3) by IPTG
induction,and identified by SDS-PAGE and Western blotting. Results showed the Blattella germanica Bla g 8 gene includ an reading fragme
of 618 bp code for 205 amino acid residues. It was found the full-length of Bla g 8 gene from Blattella germanica,construct the recombinant
plasmid pET32a(+)-B8,expressed His-GAPDH fusion protein.
Key words: Blattella germanica Allergen Sequence analysis Prokaryotic express
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2012年第9期174
8 的完整 cDNA 序列就显得尤为重要,是进一步获
取重组蛋白和研制疫苗的基础。
目前,国际免疫学会联合会(International Union
of Immunological Societies,IUIS)官方公布的德国小
蠊相关的变应原,主要有 Bla g 1、Bla g 2、Bla g 4、
Bla g 5、Bla g 6、Bla g 7 和 Bla g 8。除 Bla g 8 外,其
他几种变应原的基因克隆与蛋白表达、致敏性鉴定
皆已完成[8-10]。而关于 Bla g 8 的研究,除 GenBank
公布的部分序列(登录号 :ABD47458)和 IUIS 公
布的 Bla g 8 为德国小蠊变应原外,Bla g 8 的相关
研究均未见报道,且该序列并不完整,其 5端有
缺失。
蟑螂是昆虫中引发变态反应性疾病的主要类
型之一。1998 年,WHO 发布的关于免疫治疗的指
导文件中强调变应原的质量对变态反应性疾病的诊
断和治疗至关重要,用于免疫治疗的变应原应该是
纯品而不宜为粗制浸液[11]。目前,在我国临床上
使用的蟑螂粗浸液,由于难以达到质量标准化,且
含有大量非特异性抗原,所以整个蟑螂虫体的粗浸
液用于变态反应性疾病的诊断和脱敏治疗存在许多
不足[12],而蟑螂重组变应原很好地解决了这些问
题[9]。因此,获得编码德国小蠊变应原 Bla g 8 的完
整 cDNA 序列就显得尤为重要。
本研究以德国小蠊变应原 Bla g 8 为研究对象,
通过 RACE 技术获得其全长 cDNA 序列,构建 Bla g
8 原核表达质粒,诱导重组蛋白表达,并运用生物
信息学方法对Bla g 8蛋白的结构及建立系统进化树,
旨在为 Bla g 8 蛋白的进一步深入研究奠定基础。
1 材料与方法
1.1 材料
德国小蠊为本实验室人工饲养,RNA 提取试剂
盒购于 Omega 公司,RACE 试剂盒购于 Invitrogen 公
司,pMD18-T 质粒,限制性核酸内切酶 BamH I 和
Hind III 购于 TaKaRa 公司,pET-32a 为本实验常规
保存。
1.2 方法
1.2.1 全长 cDNA 序列的获取 通过美国国立生物
技术信息中心 NCBI(National Center for Biotechnology
Information)网站查询德国小蠊 Bla g 8 蛋白的氨基
酸 序 列(http ://www.ncbi.nlm.nih.gov),GenBank 登
录号为 :ABD47458。经分析发现该序列并不完整,
其 5端有缺失。根据该序列片段及 RACE 引物设
计要求设计 5-RACE 引物(表 1)。按 GeneRacerTM
Kit 试剂盒说明书提取德国小蠊成虫总 RNA 及逆
转录获得第一链的 cDNA,用 5-RACE 引物扩增出
cDNA 的 5-末端,将 PCR 产物切胶纯化回收后与
pMD18-T 克隆载体连接,通过氨苄青霉素抗性及蓝
白斑筛选后挑取阳性克隆,菌液 PCR 初步鉴定后送
上海生工生物工程有限公司测序。序列拼接后获得
德国小蠊变应原 Bla g 8 基因的全长序列,根据该序
列再设计全长引物,PCR 扩增出全长序列,将其克
隆到载体 pMD18-T(18T-B8)上后再送上海生工生
物公司测序鉴定。
表 1 5-RACE引物
引物 序列(5-3) 长度(bp)
Bla g 8-5 GSP TACGCAAACCGCCTCTCCCCGCGCGTT 27
Bla g -5 Nest TGGAAAGCGGGCAGTGAGCGCAACGCA 27
GeneRacerTM 5 Primer CGACTGGAGCACGAGGACACTGA 23
GeneRacerTM 5 Nested Primer GGACACTGACATGGACTGAAGGAGTA 26
1.2.2 Bla g 8 蛋白的生物信息学分析 Bla g 8 蛋白
的信号肽预测通过 CBS Prediction 服务器(登陆 http:
//www.cbs.dtu.dk 网站,选择 signalIP 方法);蛋白
疏水性预测采用 ExPASy Proteomics 服务器(登陆
http ://www.expasy.ch 网站,选择 ScanProsite 方法);
跨 膜 结 构 通 过 TMHMM Server v.2.0 服 务 器 预 测
(http ://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/) 在 线
预测。Bla g 8 氨基酸序列在公共数据库 NCBI 及变
应原数据库 SDAP(http ://fermi.utmb.edu/SDAP/)中
进行同源比对,获取各物种肌球蛋白轻链的氨基酸
序列,使用 MEGA4.1 软件的邻接法建立 NJ 系统树
(Neighbor-joining tree), 设 置 1 000 次 Bootstraps 进
2012年第9期 175龙高群等 :德国小蠊变应原 Bla g 8 的克隆表达及进化分析
行评估。
Bla g 8 蛋白的二级结构预测采用 ExPASy Proteo-
mics 服务器蛋白二级结构预测方法中的 SOPMA 在
线完成。用 Swiss-Model 服务器(http ://swissmodel.
expasy.org/)中,通过 Swiss-Model 蛋白质在线软件
完成蛋白质三维结构的预测。
利用 NCBI 在线软件 conserved domain (http ://
www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi)分析 Bla
g 8 蛋白的保守结构域,其功能结构域通过 SMART
(http://smart.embl-heidelberg.de/)在线软件完成预测。
1.2.3 德国小蠊 Bla g 8 重组蛋白表达
1.2.3.1 pET32a-B8 重组质粒的构建 利用 Primer
Primer5 软件,设计 5端带有 BamH I 和 3端带有
Hind III 的引物,以德国小蠊 18T-B8 质粒为模板进
行 PCR 扩增。同时双酶切处理 PCR 产物和 pET-32a
表达载体,纯化定量后 16℃连接过夜,并转化至感
受态大肠埃希菌 BL21,次日挑取阳性菌,放入含氨
苄青霉素(50 mg/mL)的 LB 液体培养基中培养过夜,
提取质粒进行 PCR、双酶切及测序鉴定。
1.2.3.2 pET32a-B8 重组蛋白的表达及鉴定 取过夜
培养的菌液 60 μL,加入含有氨苄青霉素的 6 mL LB
液体培养基中,37℃、280 r/min 震摇约 3 h 至 OD600=
0.6,加入 IPTG 诱导表达,取 6 h 表达液,SDS-PAGE
电泳分析。按照 His-Western blot kit 蛋白抗体试剂
说明书进行,重组蛋白经 12% SDS-PAGE 分离后转
移到硝酸纤维膜上,室温下封闭液封闭 1 h 后在摇
床上用 PBS 漂洗 3 次(10 min/次)。然后用 6-his tag
蛋白抗体孵育结合,PBS 漂洗 3 次(10 min/次),再
用抗 His-tag 蛋白抗体(二抗)孵育结合,PBS 漂洗
3 次(10 min/次)。采用二氨基联苯胺(DAB)显色
5 min,后将 NC 膜转移入 PBS 液,终止反应。
2 结果
2.1 Bla g 8全长cDNA序列的获取
通过 5-RACE 技术获得一条长约为 300 bp 的
条带,测序后与 Bla g 8 的部分序列拼接,获得一
个长为 618 bp 的完整开放阅读框,编码 205 个氨基
酸 ;全长引物 PCR 扩增,克隆到 pMD18-T 后测序
结果与拼接序列碱基一致(图 1),该序列已上传至
GenBank(登录号 :JN982315.1)。
M. DNA Marker DL2000 ;1. 3-RACE PCR 产物 ;2. 全长引物 PCR 产物
图 1 RACE PCR及全长 cDNA序列 PCR
2.2 生物信息学分析
2.2.1 Bla g 8 信号肽、蛋白疏水性及跨膜区分析
信号肽分析 Bla g 8 蛋白无信号肽序列。ExPASy
proteomics 服务器预测 Bla g 8 蛋白疏水性,得分大
于 0,且分值越大,表示疏水性愈好。结果显示该
蛋白的疏水性较差,虽然存在得分大于 0 的氨基酸
残基,但不存在一个连续 20 个氨基酸以上的疏水
空间。同时利用 TMHMM Server v.2.0 服务器预测 Bla
g 8 跨膜结构区的结果显示 Bla g 8 蛋白不存在跨膜
结构区。
2.2.2 结构分析 采用 SOMPA 方法对德国小蠊 Bla
g 8 蛋白的二级结构进行预测,结果显示,α-螺旋占
53.66%,β-折叠占 5.37%,无规则卷曲占 38.05%。
Bla g 8 蛋白的二级结构中 α-螺旋含量较高,并且 α-
螺旋结构与 β-折叠结构的相对含量大于 15%,属于
α+β 类型的蛋白。
通过 Swiss-model 预测 Bla g 8 蛋白的三级结构,
结果(图 2)显示,其 α-螺旋及 β-折叠的相对含量
与二级结构预测所得结果能较好地吻合。
保守结构域分析显示,Bla g 8 为德国小蠊一种
肌球蛋白轻链,具有完整的 EF-hand 钙结合结构域,
属于 EF-hand 钙结合蛋白家族。SMART 功能结构域
分析发现该蛋白具有 2 个完整的 EF-hand 钙结合基
序,分别位于第 61-89 位及第 165-193 位氨基酸,
EF-hand 一般成对出现,每个基序包括 12 个氨基酸
残基的环合 12 个残基的 α-螺旋。
2.2.3 氨基酸序列比对及系统进化分析 NCBI 同源
比对显示,德国小蠊 Bla g 8 基因编码的氨基酸序列
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2012年第9期176
与蠼和东方蝼蛄的同源性分别为 85% 和 87% ;变应
原数据库 SDAP 同源比对显示德国小蠊 Bla g 8 对草
虾、凡纳滨对虾肌球蛋白轻链变应原具有同源性,
其同源性均为 50.24%。使用 MEGA4.1 软件的邻接法
构建 NJ 系统进化树,如图 3 所示,NJ 系统树共分
为两大支,其中德国小蠊与对草虾、凡纳滨对虾聚
为一小支,并与 Synthetic construct聚为一大支;褐鼠、
智人及家马聚为一小支并与其他昆虫聚为一大支。
2.3 德国小蠊Bla g 8重组蛋白表达
2.3.1 pET28a-GAPDH 重组质粒的构建 重组质粒
pET32a-B8 经菌液 PCR 及提取重组质粒经 BamH I
和 Hind III 双酶切处理鉴定与测序鉴定,如图 4 所
示均与预期结果一致,表明以正确的方向将 Bla g 8
图 2 Swiss-model预测 Bla g 8的三级结构
肌球蛋白序列 GenBank 登录号为:Marsupenaeus japonicas(日本囊对虾,ADD70028.1),Rattus norvegicus(褐鼠,AAA98534.1),Gryllotalpa orientalis(东方蝼蛄,
AAW22543),Homo sapiens(智人,AAA59895),Biston betularia(桦尺蛾,AEP43792),Lepeophtheirus salmonis(鲑疮痂鱼虱,ADD38409.1),Lonomia oblique(蠼,
AAV91411.1),Crangon crangon(褐虾,ACR43477.1),Caligus rogercresssyi(智利鱼虱,ACO11381.1),Maconellicoccus hirsutus(木槿曼粉虾,ABM55658.1),
Tribolium castaneum( 赤 拟 谷 盗,XP976209.1),Nasonia virtripennis( 丽 蝇 蛹 集 金 小 蜂,XP001599362.1),Camponotus floridanus( 弓 背 蚁,EFN65648.1),
Aarpegnathos saltator(印度跳蚁,EFN85742.1),Acyrthosiphon pisum(豌豆芽,NP001119626.1),Haemaphysalis qinghaiensis(青海血蜱,AAV41826.1),Lycosa
singoriensis(黑腹狼蛛,ABX75494.1),Equus caballus(家马,XP001501584.1),Synthetic construct (ABP87672.1),Penaeus monodon(对草虾,ADV17342.1),
Litopenaeus vannamei(凡纳滨对虾,ACC76803.1),Blattelle germanic(德国小蠊)
图 3 构建的肌球蛋白轻链氨基酸序列系统进化树
2012年第9期 177龙高群等 :德国小蠊变应原 Bla g 8 的克隆表达及进化分析
基因克隆到表达载体 pET-32a。
MLC 经分析无信号肽也不含跨膜区[13],与凡纳滨对
虾 MLC 预测结果一致。提示德国小蠊 Bla g 8 不可
能作为膜受体起作用,也不可能是定位于膜上的锚
定蛋白或者离子通道蛋白。
结构域分析发现,该蛋白为肌球蛋白轻链,是
EF-hand 钙结合蛋白家族的一员,过敏原数据库同
源比对,Bla g 8 与变应原 Pen m 3.0101、Lit v 3.0101
及 Cup a 4 具有同源性,且这些蛋白均为肌球蛋白轻
链,是 EF-hand 钙结合蛋白家族的成员。EF-hand 家
族蛋白具有相似的结构[14],暗示 Bla g 8 为德国小
蠊一种变应原。而本次试验也通过原核表达获得了
德国小蠊 Bla g 8 的重组蛋白,这就为下一步收集蟑
螂过敏病人血清,检测 Bla g 8 重组蛋白的变应原性
提供了理论依据。
建立 NJ 系统进化树,共分为两大支,德国小蠊
与对草虾、凡纳滨对虾聚为一小支,并与 Synthetic
construct聚为一大支 ;褐鼠、智人及家马聚为一小
支并与其他昆虫聚为一大支。其中对草虾、凡纳滨
对虾及 Synthetic construct的肌球蛋白轻链即 Pen m
3.0101、Lit v 3.0101[15]及 Cup a 4 均为 IUIS 已公布
的肌球蛋白轻链为变应原的物种均聚为一支,所有
变应原的氨基酸序列聚为一支,非变应原氨基酸序
列聚为一支。而截至目前为止,所见进化树都是按
物种进行聚类,而此次出现的按功能聚类现象未见
任何报道,该结果为下一步研究该类蛋白的结构及
进化方式奠定了基础。
M1.DNA Marker λ-Hind III ;1. 质粒 pET-32a ;2. BamH I 和 Hind III 双酶
切处理的质粒 pET-32a ;3. 重组质粒 pET32a-B8 ;4. BamH I 和 Hind III
双酶切处理的重组质粒 pET32a-B8 ;5. PCR 检测重组质粒 pET32a-B8 ;
M2. DNA 标准品 DL2000
图 4 重组质粒 pET32a-B8限制性内切酶鉴定
2.3.2 表达产物 SDS-PAGE 及 Western blotting 鉴定
SDS-PAGE 分析,在 0 h 未有目的蛋白表达,但经
4 h 后在约 42 kD(His 标签大小约为 20 kD)处有大
量重组蛋白表达(图 5),与理论预测融合蛋白大小
相一致。His-tag 抗体 Western blotting 分析显示在 42
kD 处重组蛋白能与 His-tag 抗体特异结合。阴性对
照(空质粒)并无此条带(图 6),进一步说明该条
带为融合表达所得目的蛋白。
M. 蛋白质 Marker ;1. 未经 IPTG 诱导的空质粒 pET-32a ;2. 经 IPTG 诱导
的空质粒 pET-32a ; 3. 未经 IPTG 诱导的重组质粒 pET32a-B8 ;4. 经 IPTG
诱导的重组质粒 pET32a-B8
图 5 pET32a-B8基因表达产物的 SDS-PAGE分析
M. 蛋白质 Marker ;1. 经 IPTG 诱导的重组质粒 pET32a-B8 ;2. 未经 IPTG 诱
导的重组质粒 pET32a-B8 ;3. 经 IPTG 诱导的空质粒 pET-32a
图 6 重组 pET32a-B8蛋白的Western blotting分析
3 讨论
经分析德国小蠊 Bla g 8 不含信号肽序列,同时
也不含有跨膜区,而凡纳滨对虾肌球蛋白轻链基因
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2012年第9期178
4 结论
本研究通过 5-RACE PCR 扩增,获得德国小蠊
变应原 Bla g 8 的完整 cDNA 编码序列,含 618 bp 编
码 205 个氨基酸 ;构建原核表达重组质粒,诱导重
组蛋白表达及纯化,获得可溶性重组蛋白。
参 考 文 献
[1] 刘国璋 , 何麟 .我国人体寄生虫及病媒昆虫染色体研究概况 .中
国寄生虫学与寄生虫病杂志 , 1989, 7(2):128-132.
[2] 齐欣 , 孙耕芹 . 德国小蠊生物学特性及综合治理 . 中国媒介生
物学及控制杂志 , 2004, 15(1):73-75.
[3] Zeiler T, Taivainen A, Rytkönen M, et al. Recombinant allergen
fragments as candidate preparations for allergen immunotherapy.
Allergy Clin Immunol, 1997, 100(6):721-727.
[4] Jeong KY, Hongb CS, Yong TS. Recombinant allergens for diagnosis
and immunotherapy of allergic disorders, with emphasis on cockroach
allergy. Curr Protein Pept Sci, 2006, 7(1):57-71.
[5] Zhou B, Ensell M, Glichstein J, et al. Characterization of the
protective and therapeutic efficiency of a DNA vaccine encoding the
cockroach allergen Bla g 1. Allergy Clin Immunol, 2006, 117(2):
1071-1074.
[6] Yang J, Nair U, Yoo TJ. Genetic vaccination with plasmid DNA
encoding cockroach allergen Blag-2 in mice. Allergy Clin Immunol,
2002, 109 :209-212.
[7] Kagen S, Muthiah R, Holinbeck JA. A new and safer method for
preserving allergen stability in human vaccines. Allergy Clin
Immunol, 2004, 113(2)(Suppl):S110-114.
[8] Arruda LK, Vailes LD, Hayden ML, et al. Cloning of cockroach
allergen, Bla g4, identifies ligand binding proteins(or calycins) as
a cause of IgE antibody responses. Biol Chem, 1995, 270(52):
196-201.
[9] 马慧 , 刘志刚 . 蟑螂重组变应原的研究进展 . 热带医学杂志 ,
2007, 23(2):288-291.
[10] Sookrung N, Chaicumpa W. A revisit to cockroach allergens. Asian
Pac J Allergy Immunol, 2010, 28(2-3):95-106.
[11] 蒋圣娟 , 孙玉军 , 张强 , 等 . 花生致敏蛋白 Ara h1 的电子克隆
及生物信息学分析 . 安徽科技学院学报 , 2009, 23(2):31-37.
[11] 潘书波 .1390 例高校本科生 UPI 人格健康评价效应及对策 . 中
国体育科技 , 2002, 36(6):39-50.
[12] Nelson HS. Tudies of allergen extract stability :the effects of
dilution and mixing. Allergy Clin Immunol, 1996, 98(2):
382-388.
[13] 李文兰 , 盛小伟 , 高永华 , 等 . 凡纳滨对虾肌球蛋白轻链基
因 MLC 的克隆及表达分析 . 西南农业学报 , 2011, 24(4):
1558-1563.
[14] 彭鸿娟 , 陈晓光 , 王殉章 . 日本血吸虫一个新钙结合蛋白全
长编码区的克隆与功能预测 . 中国人兽共患病杂志 , 2002, 18
(2):47-49.
[15] Ayuso R, Grishina G, Ibáñez MD, et al. Sarcoplasmic calcium-
binding protein is an EF-hand-type protein identified as a new
shrimp allergen. Allergy Clin Immounol, 2009, 124(1):114-120.
(责任编辑 马鑫)