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Cloning,Expression and Purification of Urease B Subunit of Helicobacter pylori

幽门螺杆菌尿素酶B亚单位的克隆表达及纯化



全 文 :·研究报告·
生物技术通报
BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2015, 31(7):220-225
幽 门 螺 杆 菌(Helicobacter pylori,H. pylori) 被
公认是消化性溃疡、慢性活动性胃炎、胃黏膜相关
淋巴组织(MALT)淋巴瘤的主要致病因素,与胃癌
的发生存在密切关联性[1-3],已被世界卫生组织定
为Ⅰ类致癌因子[4]。H. pylori 感染呈现全球分布特点,
据有关报道显示,世界人口平均感染率已超过 50%,
发展中国家的 H. pylori 感染率更高,我国的感染率
达到 61%[5]。目前对于抗 H. pylori 感染方法主要采
用的是药物治疗法,但都存在一定的局限性[6],因
此开发抗 H. pylori 感染疫苗产品成为研究热点。
尿素酶 B 亚单位(UreB)作为疫苗的有效抗原
蛋白,具有无毒、免疫效果好等特点,已被相关实
验所证实[7-9]。目前关于 ureB 克隆表达及纯化的方
法已有报道,主要采用细菌培养的方法获取大量 H.
收稿日期 : 2014-10-15
基金项目 :国家科技重大专项子课题项目(2014ZX09102042-002),安徽省科技攻关计划项目(1301041020)
作者简介 :闫锦锦,男,硕士,研究方向 :生物化学与分子生物 ;E-mail :yanjinjin222702@163.com
通讯作者 :刘丹,女,博士,研究方向 :医学免疫学 ;E-mail :luckyliu2001@sina.com
幽门螺杆菌尿素酶 B 亚单位的克隆表达及纯化
闫锦锦  闫东明  邹雪  刘丹  彭超  苏亚南
(芜湖康卫生物科技有限公司,芜湖 241000)
摘 要 : 为获得高纯度具有生物活性的尿素酶 B 亚单位(UreB)蛋白,利用 PCR 方法扩增出 ureB 目的基因,将其插入到
pET28a 载体中,构建表达质粒 pET28a-ureB。将鉴定正确的质粒转入大肠杆菌中培养,通过 IPTG 诱导表达获得 UreB 蛋白。采用
Q Sepharose High Performance 阴离子交换层析纯化,G-25 凝胶过滤层析脱盐,并通过 SDS-PAGE 和免疫双扩散法对 UreB 蛋白进行
鉴定。结果表明,该蛋白相对分子质量约为 64 kD,与预期结果相符,脱盐后获得的 UreB 蛋白纯度为 98.5% ;免疫双扩散法证明
该蛋白具有良好的生物活性和反应特异性。最终确定的纯化工艺,达到了一步纯化即得到高纯度、具有生物活性蛋白的目的,该
纯化工艺简单、有效。
关键词 : 幽门螺杆菌 ;尿素酶 B 亚单位 ;UreB 蛋白 ;蛋白纯化
DOI :10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.07.034
Cloning,Expression and Purification of Urease B Subunit of
Helicobacter pylori
Yan Jinjin Yan Dongming Zou Xue Liu Dan Peng Chao Su Yanan
(Wuhu Kangwei Biotechnology Co.,Ltd.,Wuhu 241000)
Abstract: In order to obtain high-purity and bioactive urease B subunit protein(UreB), the fragments of ureB amplified by PCR
was inserted into expression vector pET28a, and the recombinant plasmid pET28a-ureB was constructed successfully. The identified plasmid
was transformed into Escherichia coli, which was induced to express by IPTG. The expressed protein UreB was purified by Q Sepharose High
Performance anion exchange chromatography and desalted by G-25 gel filtration chromatography, then analyzed by SDS-PAGE and double
immunodiffusion. The results indicated that the molecular weight of the protein was about 64 kD and its purity was 98. 5% after desalting, which
was in accord with the prediction. Double immunodiffusion showed that protein UreB possessed a favorable bioactivity and specificity. The
finalized purification process achieved the goal of 1-step purification may obtain high-purity and bioactive protein, and it was simpler than the
existing purification process as well as effective.
Key words: Helicobacter pylori ;urease B subunit ;UreB protein ;protein purification
2015,31(7) 221闫锦锦等 :幽门螺杆菌尿素酶 B 亚单位的克隆表达及纯化
pylori,利用基因工程技术克隆 ureB 基因,构建表达
质粒,并使用亲和层析及多级纯化相结合的方法获
得较高纯度的 UreB 蛋白[10-12],但利用离子交换层
析技术进行一步纯化,来获得高纯度 UreB 蛋白的相
关信息未见报道。
本研究以 pET11c-LTB-ureB 质粒为模板,设计
引物,克隆 ureB 基因,构建重组质粒 pET28a-ureB,
并使用离子交换层析一步纯化法,获得高纯度且具
有生物活性的目的蛋白,可作为疫苗参考品,为疫
苗后续研究奠定基础。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 菌 株 及 质 粒 E . coli DH5α 及 E. coli BL21
(DE3)由本实验室保种,pET11c-LTB-ureB 表达质
粒由本实验室构建保存,载体 pMD18-T、pET-28a
购自 TaKaRa 公司(大连)。
1.1.2 主要试剂 质粒提取试剂盒、DNA 凝胶回收
试 剂 盒 购 自 AXYGEN 公 司 ;Taq DNA 聚 合 酶、T4
DNA 连接酶、DL5000 DNA Marker、限制性内切酶
BamH Ⅰ、Nde Ⅰ、Xba Ⅰ、Xho Ⅰ 均 购 自 TaKaRa
公 司( 大 连 );离 子 交 换 层 析 柱 介 质 Q Sepharose
High Performance、凝胶过滤层析柱介质Sephadex G-25
Medium 购自美国 GE 公司。
1.2 方法
1.2.1 pET11c-LTB-ureB 重组质粒的克隆及序列测
定 取 5 μL pET11c-LTB-ureB 质粒转化 DH5α 感受
态,涂 Amp 抗性的 LB 平板,挑取单克隆于 LB 液
体培养基中大量扩增,用质粒提取试剂盒提取质粒。
经 BamH Ⅰ、Nde Ⅰ双酶切,电泳鉴定正确后,送
上海生工测序。
1.2.2 ureB 基因表达载体的构建 根据测序结果,
应用 Primer 5.0 设计扩增 ureB 基因引物。上游引物 :
GTCTAGAAATAATTTTGTTTAACTTTAAGAAGGAG-
ATATAATGAAAAAGATTAGCAGAAAAGAATATG
(下划线为 Xba Ⅰ酶切位点),下游引物 :CTCGAGT-
TACTAGAAAAT GCTAAAGAGTTGTGCCAAGCTCA
(下划线为 Xho Ⅰ酶切位点)。以 pET11c-LTB-ureB
质粒为模板,采用上述引物,进行 PCR 扩增。扩
增条件为 :95℃ 2 min ;95℃ 30 s,50℃ 30 s,72℃
2 min ;35 个循环。1% 琼脂糖凝胶电泳鉴定后,用
DNA 凝胶回收试剂盒回收 1 700 bp 目的片段,并将
ureB 基因连接到 pMD18-T 载体上,转化 DH5α 感受
态,提取阳性克隆质粒,用 Xba Ⅰ和 Xho Ⅰ双酶切
鉴定质粒,并将鉴定正确的质粒送至上海生工测序。
利 用 Xba Ⅰ 和 Xho Ⅰ 双 酶 切 测 序 正 确 的
pMD18T-ureB 和 pET-28a 载体质粒,并回收 1 700 bp
和 5 000 bp 的目的条带。将回收的目的片段和载体
片段,用 T4 DNA 连接酶连接,连接产物转化 BL21
(DE3)感受态细胞 ;均匀涂布于含有 Kan 抗性的
LB 平板,37℃恒温培养箱过夜培养,挑取单克隆
于 LB 液体培养基中大量扩增,提取重组质粒 ;经
Xba Ⅰ和 Xho Ⅰ双酶切鉴定正确后送上海生工测序。
1.2.3 UreB 蛋白的诱导表达 将测序结果正确的重
组工程菌接种于 5 mL 含 Kan 的 LB 液体培养基中,
37℃摇床培养过夜。将过夜培养的重组工程菌按 1%
的比例转接入 50 mL 含 Kan 的 LB 培养液中,37℃
摇床培养(200 r/min)。待 OD600 ≈ 1.0 时,加入终
浓度为 1 mmol/L 的 IPTG 开始诱导,分别于诱导 0、
1、2、3、4、5 h 取样,并采用 SDS-PAGE 检测目的
蛋白诱导表达情况。
1.2.4 发酵菌体的处理 将高效表达的菌体以 1∶10
(M/V) 比 例 与 缓 冲 液(10 mmol/L Tris-HCl pH8.5)
混合、溶解,搅拌均匀后,向菌体悬液液中加入冰
袋将菌液冷却至 10℃左右,利用高压均质机高压(800
bar)破碎 2 次,破碎后的菌液通过管式离心机离心
收集粗包涵体沉淀(离心转速 :20 000 r/min ;离心
流速 :1 L/min),-20℃保存。
1.2.5 UreB 包涵体的洗涤及裂解 称取 UreB 包涵
体 20 g,按照 1∶10(m/v)的比例,用洗涤液Ⅰ(50
mmol/L Tris-HCl 1%Triton-X 100 pH8.5)溶解包涵体,
高速分散器混匀后,搅拌 1 h,8 000 g 离心 30 min,
弃上清,预留上清(收集液)检测,重复洗涤一次;
沉淀再用洗涤液Ⅱ(50 mmol/L Tris-HCl 1 mol/L 尿素
pH8.5)溶解,高速分散器混匀后,搅拌 1 h,8 000
g 离心 30 min,弃上清,预留上清检测,重复洗涤一次;
最 后 沉 淀 用 pH8.5 的 50 mmol/L Tris-HCl 8 mol/L 尿
素溶解,高速分散器混匀后,裂解过夜。
1.2.6 UreB 蛋 白 的 Q Sepharose High Performance 纯
化 柱 床 体 积 为 150 mL, 用 5 倍 柱 体 积 pH8.5 50
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.7222
mmol/L Tris-HCl、8 mol/L 尿素平衡层析柱 ;用 3 倍
柱体积含不同盐浓度的 50 mmol/L Tris-HCl 8 mol/L
尿素 pH8.5 的洗脱缓冲液进行梯度洗脱,盐浓度
梯度分别为 40 mmol/L、60 mmol/L、80 mmol/L、90
mmol/L、0.2 mol/L、2 mol/L NaCl, 流 速 为 15 mL/
min,采取分段收集样品的方法,对样品进行 SDS-
PAGE 检测,利用凝胶成像系统进行纯度分析,系
统的分析软件为 Imaglab(Version 4.1)。
1.2.7 超滤浓缩、脱盐 Q 柱样品用截留量为 50 kD
的膜包进行超滤浓缩后,用 G-25 凝胶过滤层析柱脱
盐处理(pH10.0 25 mmol/L 碳酸氢钠缓冲液),收集
样品进行 SDS-PAGE 检测,利用凝胶成像系统进行
纯度分析,系统的分析软件为 Imaglab(Version 4.1)。
1.2.8 免疫双扩散检测蛋白特性 选用重约 2 kg、
健康状况良好的新西兰大耳兔 2 只,每只兔子采用
背部多点皮内注射 1 mg 抗原。免疫时间分别为 0、
10、17 d,3 次免疫后取兔耳缘静脉血,免疫双扩散
检测 UreB 抗原的特异性。
用 0.9% 的生理盐水配制 1.5% 的琼脂糖凝胶,
水浴加热至充分溶化后,倒于载玻片上,制成厚度
约为 2-3 mm 厚的琼脂糖凝胶板 ;置于室温冷却凝
固后,用打孔器准确打孔,加热封底。冷却后,中
央孔内滴加一定的兔抗血清,加入量以不溢出为度,
周边孔分别滴加 UreB 纯化蛋白(1、5、10、20 μg)、
空白对照(pH10.025 mmol/L 碳酸氢钠缓冲液)、阴
性对照(pET-28a 空载质粒转化后诱导表达蛋白,
采用 Lowery 法测蛋白质含量,取 10 μg 加样)。加
完样品后,将琼脂平皿加盖后放置于加盖的湿盒内,
37℃温箱中孵育 30 h,观察并记录结果。
2 结果
2.1 ureB基因的核酸电泳鉴定
ureB 基因的 PCR 扩增产物和重组质粒 pET28a-
ureB 双酶切产物,用 1.0% 的琼脂糖凝胶电泳检测,
结果分别见图 1、图 2。图 1 中为扩增的目的基因
电泳结果,经序列测定 :ureB 基因大小为 1 710 bp,
与 ureB 基因的预期大小一致 ;从图 2 中可以观察到
pET28a-ureB 质粒采用 Xba Ⅰ和 Xho Ⅰ双酶切后,可
见约 5 000 bp 和 1 700 bp 左右的条带,与预期结果
一致。
2.2 UreB蛋白的诱导表达
将重组质粒转入大肠杆菌中扩增培养后进行诱
导表达 5 h,采用 SDS-PAGE 检测(0、1、2、3、4、
5 h)UreB 目的蛋白的表达情况。结果(图 3)显示,
UreB 的相对分子质量约为 64 kD,表达量随诱导时
间的延长而增加,诱导 5 h 时表达量最高,目的蛋
2000
bp
1 2
1500
1 :DNA Marker DL5000 ;2 :ureB 基因的 PCR 扩增产物
图 1 ureB 基因的 PCR 扩增
5000
bp
1 2
2000
1 :pET28a-ureB 重组质粒经 Xba Ⅰ、Xho Ⅰ双酶切 ;2 :DNA Marker DL5000
图 2 pET28a-ureB 重组质粒双酶切鉴定
70
kD
1 2 3 4 5 6 7
55
1-3 :IPTG 诱导时间 0、1、2 h ;4 :蛋白分子量标准 ;5-7 :IPTG 诱导时间
3、4、5 h
图 3 不同诱导时间下 UreB 的表达量分析
2015,31(7) 223闫锦锦等 :幽门螺杆菌尿素酶 B 亚单位的克隆表达及纯化
白约占总蛋白的 27.4%。
2.3 UreB包涵体洗涤
利用洗涤液Ⅰ和洗涤液Ⅱ对包涵体各洗涤两次,
SDS-PAGE 检测结果(图 4)显示,包涵体洗涤效果
良好,4 次洗涤收集液中 UreB 目的蛋白的纯度依次
为 9.7%、25%、37.5%、49.5%,而在裂解液中 UreB
纯度达到了 67.3%。
2.4.2 G-25 凝胶过滤脱盐 Q 柱样品用截留量为 50
kD 的膜包进行超滤浓缩,浓缩后的样品用 G-25 脱
盐柱进行脱盐处理。脱盐后目的蛋白以可溶性的形
式存在,经 SDS-PAGE 检测(图 6),样品中的目的
蛋白纯度高达 98.5%。
70
kD
1 2 3 4 5 6 7 8
55
1-3 :依次 6 μL、8 μL、10 μL 裂解液 ;4 :蛋白质分子量标准 ;5-8 :依次
10 μL 4 次洗涤收集液
图 4 UreB 包涵体的洗涤与裂解效果的电泳分析
2.4 UreB蛋白的纯化
2.4.1 阴 离 子 交 换 层 析 采 用 Q Sepharose High
Performance 阴 离 子 交 换 层 析 对 UreB 蛋 白 进 行 纯
化,经 SDS-PAGE 检测(图 5),用 80 mmol/L 和 90
mmol/L NaCl 进行洗脱可获得较高纯度的目的蛋白,
纯度可达到 96.7%、96.9%。
70
kD
1 2 3 4 5 6
55
1-3 :依次为 80-1、80-2、80-3,即为 80 mmol/L NaCl 洗脱分段接收的样品 ;
4 :蛋白质分子量标准 ;5-6 :依次为 90-1、90-2,即为 90 mmol/L NaCl 洗脱
分段接收样品
图 5 80 mmol/L 和 90 mmol/L NaCl 洗脱目的蛋白的电泳
分析
70
kD
1 2 3 4
55
1-3 :收集的样品 ;4 :蛋白质分子量标准
图 6 UreB 蛋白脱盐后电泳分析
2.4.3 目的蛋白免疫双扩散鉴定结果 兔抗 UreB 血
清免疫双扩散结果(图 7)显示,UreB 抗原具有良
好的反应特异性,在兔抗血清与 UreB 纯化蛋白之间
出现明显的免疫沉淀线,而兔抗血清与阴性对照之
间未出现沉淀线。
1
2
3
4
5
6
7
1 :空白对照 ;2 :阴性对照(10 μg);3 :兔抗 UreB 血清 ;4-7 :分别为 1、5、
10、20 μg UreB 纯化蛋白
图 7 免疫双扩散鉴定
3 讨论
研究表明,UreB 作为疫苗的抗原,具有较好的
免疫保护作用,如何获得高质量 UreB 蛋白,是能否
作为疫苗参考品的关键。这就要求不仅要获得高纯
生物技术通报 Biotechnology Bulletin 2015,Vol.31,No.7224
度的 UreB 蛋白,还需要保证其具有良好的生物活性、
反应特异性,为此我们构建重组表达质粒,进行诱
导表达及纯化工艺的摸索。
本研究选用 pET28a 作为表达载体,并以实验
室保存的 pET11c-LTB-ureB 表达质粒为模板,设计
带有 Xba Ⅰ和 Xho Ⅰ酶切位点上下游引物,克隆出
疫苗的抗原基因,成功构建了重组表达质粒 pET28a-
ureB。将重组质粒转入大肠杆菌中进行表达,可获得
以包涵体形式表达的 UreB 蛋白,该形式被认为可防
止蛋白质降解,且利于纯化[13,14]。
我们优化了包涵体洗涤工艺,进行 4 次洗涤即
可达到较好的洗涤效果,其中采用洗涤液Ⅰ进行的
前两次洗涤,电泳检测 UreB 蛋白纯度只有 9.7% 和
25%,这表明前两次洗涤杂蛋白去除效果较好,而
洗涤液Ⅱ中因含有尿素,导致目的蛋白有一定量的
损失,但经过工艺验证,当洗涤液Ⅱ中尿素浓度 1
mol/L 时,可使目的蛋白损失最小,而杂蛋白去除
效率最大化,洗涤液在电泳检测结果表明杂质去除
效果非常明显,杂质去除率可达 30% 以上。经过
多次试验验证,包涵体的最佳裂解液为 pH8.5 的 50
mmol/L Tris-HCl 8mol/L 尿素溶液。在蛋白纯化过程
中,样品能否保证其生物学活性,被看作工艺是否
成功的前提条件[15],而经过多次纯化必然会对蛋白
的活性有所影响。因此,在 UreB 纯化过程中,利用
Q Sepharose High Performance 阴离子交换层析进行了
多次实验摸索,确定了最佳的平衡缓冲液为 pH8.5
的 50 mmol/L Tris-HCl 8 mol/L 尿素溶液。同时在目
的蛋白洗脱的过程中,摸索出盐离子最佳洗脱梯度,
并采取分段收集样品的方法检测样品,最终确定了
一步纯化即可获得高纯度且具有生物活性的目的蛋
白的方法。而根据已有的相关报道,在利用阴离子
交换层析法进行 UreB 纯化时,在裂解及平衡缓冲
液组成上有所不同,所用缓冲液 pH 值多为 8.0,大
多采用了梯度洗脱,但都未采取分段收集样品方法,
这就导致收获液的纯度达不到要求,增加了纯化
难度。
实验表明离子交换层析是一种高效分离蛋白的
方法,可以根据蛋白表面静电荷不同,建立适合的
盐离子洗脱梯度,从而获得我们所需要具有生物活
性的目的蛋白。目前有相关报道的 UreB 纯化方法,
一是采用亲和层析进行纯化 ;二是采用多级纯化法,
如亲和层析与离子交换层析相结合或离子交换层析
与疏水层析相结合,这两种方式都可以获得较满意
蛋白纯度,可见的报道中最高的蛋白纯度为 98.3%。
相比以上两种传统的 UreB 纯化方式,我们通过摸索
纯化工艺,优化纯化条件,最终确定了一步纯化的
工艺,将 UreB 蛋白经 Q Sepharose High Performance
阴离子交换层析纯化及 G-25 凝胶过滤脱盐后,能够
快速获得纯度高且具有生物活性、反应特异性的目
的蛋白,蛋白纯度可高达 98.5%,在节省了时间的
同时,保证了蛋白的活性,同时节省了生产成本。
4 结论
本研究确定的纯化工艺,达到了一步纯化即得
到高纯度、具有生物活性蛋白的目的,该纯化工艺
简单、有效。制备的 UreB 蛋白,可作为口服重组幽
门螺杆菌疫苗的参考品,用于疫苗的相关检测试验。
参 考 文 献
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(责任编辑 李楠)