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Progress in study on thermostability and substrate specificity of hydantoinase

海因酶热稳定性及底物特异性研究进展



全 文 :海因酶热稳定性及底物特异性研究进展
梅艳珍,何冰芳,欧阳平凯!
(南京工业大学 制药与生命科学学院,南京 !"###$)
摘 要:海因酶是在微生物中广泛分布的能水解 %&取代海因衍生物制备光学纯氨基酸的关键生物催化剂,在各种
氨基酸的酶法生产中具有良好的应用前景。着重概述了海因酶的热稳定性、底物特异性研究及应用,并讨论了其
发展方向。
关键词:海因酶;热稳定性;底物特异性
中图分类号:’%% 文献标识码:( 文章编号:")*! + ,)*-(!##%)#, + ##!. + #%
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6%, 7#"+&:6LI34PD:34O7;P67JKDOP3T:E:PL;OSTOPJ3P7 OV7H:<:H:PL
近十年来,光学纯氨基酸在医药、食品、农药等
方面的广泛应用,引起了越来越多的兴趣["]。利用
海因酶生物转化法进行光学纯氨基酸的不对称合成
成为新的研究热点,不仅是生产制备 F&氨基酸的极
好补充,也为生产制备 R&氨基酸提供了一条可行性
路线。生物催化剂的区域立体选择性强、操作简单、
成本较低、公害少,且能完成一些化学合成难以进行
的反应。此领域受到微生物学家、有机化学家和药
物化学家的极大重视[!]。在海因酶法制备 F&色氨
酸、F&蛋氨酸、R&苯丙氨酸等氨基酸的研究方面取得
了较好的进展[, X %],尤其是已成功实现了 R&对羟基
苯甘氨酸等非天然氨基酸的工业化生产[)]。
如图 " 所示,海因酶法制备光学纯氨基酸通常
有两种途径:其一,利用一菌双酶法,即海因酶和 ?&
氨甲酰水解酶联合使用;其二,单酶与化学偶联法,
即海因酶水解 %&取代海因后用化学方法如亚硝酸盐
法或热解法使 ?&氨甲酰氨基酸脱氨甲酰。RF&%&单
取代海因是该酶学方法的原料,酮式和烯醇式的互
变异构是海因结构的一个典型特征。在中性条件
下,酮式占优,而在弱碱性溶液中则在 . 位和 % 位之
间发生烯醇化,这一特征具有的实用价值是,不需要
通过化学消旋化步骤,即可将消旋的 %&单取代海因
转化为中间体 ?&氨甲酰氨基酸,此中间体进一步被
氨甲酰水解酶转化为 R&氨基酸或 F&氨基酸。由于
海因类衍生物的溶解度较低,提高温度不仅可增加
底物的溶解度,同时可促进 %&单取代海因的消旋,故
! 收稿日期:!##%&#*&!*
基金项目:国家 $*, 项目(!##,C9*")###)
作者简介:梅艳珍("$*-&),女,博士研究生,研究方向:应用微生物。
联系人:何冰芳,0&K3:E:T:4;<34;67Y 4MSP Z 7IS Z H4,Q7E:#!%&-,%-*,,)
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生 物 加 工 过 程
C6:47O7 [DSJ43E D< 9:DVJDH7OO 04;:477J:4;
第 , 卷第 , 期
!##% 年 - 月
万方数据
热稳定性海因酶的应用研究在工业上日益受到重
视[!,"],本论文重点介绍海因酶热稳定性、海因酶的
底物特异性及应用前景。
图 # 海因酶法制备光学纯氨基酸的催化反应过程
$%& ’# ()*+,%-./ %.0-10)2 %. ,3) 342*.,-%.*/) 56-+)//
! 海因酶的热稳定性
#’# 海因酶在微生物种群中的分布及其产生菌的筛选
早在 #7"8年,9*:*2* 等人[8]设计筛选培养基以
;<=>=甲硫乙基海因为诱导剂,从细菌、放线菌、酵母
菌中等发现了产 ;=海因酶菌种,证实了海因酶的存
在。随后研究者通过改变环境条件中的某些因素,如
碳源、氮源、温度、盐度或加入某些诱导剂等方法从土
壤中筛选到多种海因酶产生菌。?%:*.. 等[7]制备了
海因酶的抗血清,用 @因 酶 产 生 菌,!"#$"%&’(#)" ’*")+(),+ ;?C !"D" 和
;?C!"D>。9-E-F)E% 等 人[#G]筛 选 到 -.’/%&’(#)"0*1
/5 ’BH!7#I,主要用于芳香族 <=氨基酸的制备研究。
表 #中列举了已报导的部分海因酶产生菌,多数为常
温生长菌株,比较耐热的菌株鲜见报导,但海因酶相
对较耐热,一般最适催化温度为DG J >G K。因此进一
步提高酶的耐热性或热稳定性,降低发酵成本["],也
是摆在众多研究者面前的重要课题。
表 # 部分海因酶产生菌及所产氨基酸构型的例子
L*M1) # @N*:51)/ -O :%+6--6&*.%/:/ P%,3 342*.,-%.*/) *+,%0%,4 *.2 ,3) +-.O%&Q6*,%-. -O *:%.- *+%2/ 56-2Q+)2
微生物菌株 生长温度 R K 海因酶构型 氨甲酰水解酶构型 产物氨基酸构型 引文
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“=”为该菌株无或未检测氨甲酰水解酶活性
IGG> 年 8 月 梅艳珍等:海因酶热稳定性及底物特异性研究进展 ·I>·
万方数据
! "# 海因酶的耐热机制
对于耐热性海因酶的研究是从近些年开始的,
只有少数报道。$%&’()*) 等人[#+]报道从嗜热菌
!"#$%%&’ ’()"*+(,)*-+.,$%&’ ,-!!##. 中分离到耐热性
/0海因酶,在 123下,海因酶的半衰期为 #4 567。
896: 等[#4]从嗜热微生物中分离到两种新的耐热性
;0海因酶,这两种酶在 <2 3下可连续使用数 (。
-()*5)等人[!=]筛选到热稳定性的 ;0海因酶菌种
!"#$%%&’ >? .@=,此酶在 <2 3的半衰期为 12 567,在
A2 3保持 + (,活性仅丧失 BBC。
微生物海因酶耐热性的分子基础至今还不十分
清楚,并且一直是研究的热点。绝大多数海因酶是
四聚体或二聚体,寡聚结构对酶的活性是必需的,并
有助于提高酶的热稳定性。酶的高级结构的形成主
要依靠非共价键:即氢键、离子键、疏水相互作用。
酶结构模拟分析表明,热稳定性的酶与普通酶的主
要差别只在于分子内部这些非共价键数量上的不
同,并未发现有特殊的键。在寡聚结构中容易形成
分子间氢键,使其构象得以稳定,进一步稳定了海因
酶的分子结构。增加海因酶亚基间的分子间氢键可
以稳定酶的四级结构,进一步增加酶的稳定性[#A]。
D(%7E 等[!4]报道的 /0海因酶嗜热菌 /)(,"0+#+#1
#&’ " 2"00"’#,$$ 在含有 2 "4 5’: F / 的 8D: 溶液中有较
好的稳定性。超嗜热海因酶的低聚反应依赖于温度
和盐的浓度,这可能有助于酶的稳定。
蛋白质动力学研究耐热机制的常用途径是取代
突变。即在酶蛋白的某个位点改变氨基酸种类来改
变蛋白质工程的高级结构,再筛选出热稳定性增加
的突变株,然后进行蛋白质工程的结构分析。其中
被精氨酸、赖氨酸或大的疏水氨基酸替代,则耐热性
可明显提高。若被天冬氨酸、谷氨酸或一些中性的
氨基酸替代,则耐热性就下降。一般说来,对蛋白质
表面疏水性氨基酸的代替不适宜于热稳定性的提
高[#<]。D(%7E等从超嗜热海因酶产生菌 /)(,"0+#+#1
#&’ " 2"00"’#,$$ 克隆了海因酶基因,与 .’)&3+-+0"’ >?
的海因酶氨基酸序列比较发现,有 + 个保守的组氨
酸残基,在酶的催化过程中扮演重要角色。 !"#$%%&’
’()"*+(,)*-+.,$%&’ 的 ;0海因酶基因通过定点突变,将
+个组氨酸残基换成天冬氨酸后,导致酶的活性及
耐热性丧失,证实了组氨酸残基的重要性[#1]。
虽然通过对嗜热海因酶产生菌和常温海因酶产
生菌蛋白质氨基酸组成的比较表明,有 1=C以上的
同源性[#=],但并不能由此认为通过改变几个特定氨
基酸就可以使热不稳定酶变为高温下的耐热酶。也
不能认为通过耐热菌与常温菌蛋白质的同源性比
较,可以看出这些改变,并由此建立热稳定性的普遍
机制,能应用于对常温酶的改造。要解释某个酶的
稳定性机制,需要有三维结构信息。利用生物信息
学方法,对酶的基本理论研究以及酶催化相互作用
的分子模拟,探究其序列、结构、热稳定性的关系,已
经成为十分重要的研究手段[B2,B!]。李家璜[B#]对来
自栖热菌 (,)*-&’ ’. 的海因酶在不同温度下的单亚
基和二聚体进行分子动力学模拟发现,海因酶双亚
基界面上还有许多极性和带电荷的氨基酸残基,可
以形成分子间氢键和盐键,稳定了酶的结构。相关
理论可为海因酶的热稳定性改造提供重要的依
据[BB]。
! 海因酶的底物特异性
# "! 海因酶的对映体选择性分类
根据海因酶立体选择性差异可将海因酶分为两
大类:;0海因酶系和 /0海因酶系。已报道的海因酶
产生菌中 ;型海因酶居多,两种酶系在作用机制和
特性等方面存在一定的差异。在组成海因酶系的两
种酶中,有些情况下可能仅是一种具有立体选择性,
而有些情况下则是两种水解酶均具有立体选择性。
但尚未发现海因酶系作用后的最终产物为外消旋体
的报道。从已报道文献中发现,/0海因酶系中只有
一个酶具有立体选择性,而 ;0海因酶往往是两种酶
均具有立体选择性。两种立体选择性的海因酶在微
生物种群中的分布不同。从上述表 ! 中可看出,/0
海因酶一般分布在节杆菌、黄杆菌、棒杆菌等属,;0
型海因酶则多分布在假单胞菌和土壤杆菌等属。
# "# 海因酶底物特异性催化机理
也有报道称某些海因酶的立体选择性与底物 40
位侧 链 结 构 有 关。 $)G 等[B+]研 究 4*(,*+5"#()*
"&*)’#)0’ ;-$B<+4 的海因酶时,给出一种模型,如图
#所示分别为苯海因、甲硫乙基海因、苄基海因的底
物作用模型图。
该模型根据观察到的底物谱来解释对映体选择
性的底物依赖性。无甲叉基取代的底物,如苯海因,
其疏水区不能与酶的疏水区之间相互作用,因而不
能作为底物。对于甲硫乙基海因,其两种对映体在
空间上处于同一位置,因此酶对于甲硫乙基海因是
无选择性的。对于吲哚甲基海因或苄基海因而言,
其两种对映异构体在空间结构上具有差别较大的侧
链,与酶的活性中心疏水作用差别较大,所以具有高
·#A· 生物加工过程 第 B 卷第 B 期
万方数据
度选择性。但是这种模型只能解释一部分现象,而
不能解释假单胞菌属 !"#$% 和嗜热脂肪芽胞杆菌
!"%%&&’产生的海因酶转化 ()*甲硫乙基海因得到
)*蛋氨酸的现象。
图 & !"#$"%&’(#)" ’*")+(),+ ("+ ,$-. 所产海因酶的立体选择
性催化机制模型[,-]
/01 2& 34565789 :8;<=>07: 5? 7@848578A8;@0B0@C ?54 @<8 @50>=78
?45: !"#$"%&’(#)" ’*")+(),+ ("+ ,$-.[,-]
二氢嘧啶酶催化底物的结构要求有所不同[,.],
它选择性水解 .D*单取代海因,此酶既不需要甲叉基
连接基团,也不需要与底物之间的疏水相互作用。
海因酶对不同底物的对映体选择性差异,以及对于
五元环、六元环底物的不同的作用方式,还需要更深
层地从酶的结构等方面研究。’E8>945@< 等[&#]通过
结构比较发现,来自不同菌种的海因酶有较高的同
源性,但是其选择性差别却很大,并且给出了分别来
自 !"#$"%&’(#)" ’*")+(),+ 的 )*海因酶与来自 -$)".*+
76的三维结构图,如图 ,。它们同属一个折叠类型,
海因酶的活性中心处在一个共同的、保守的(!F")G
桶结构域,海因酶分子的催化中心由 & 个 H>& I、
J;K%.L(羧基化的赖氨酸)、M07#L、M07#&、M07%G,、
M07&,N、’76,%& 组成。酶分子在结构上的差别主要
体现在富含"折叠片的结构域的大小不同。
研究预测,海因酶分子的底物结合部位包括两
部分,一部分识别和结合海因基团,另外一部分识别
底物侧链基团,识别海因基团以氢键为主,识别底物
侧链以疏水作用为主。与 (*海因酶相比,)*海因酶
活性部位的空间比较大,海因酶结构底物结合部位
大部分残基分布在 .N O $,,N% O %LL,%-N O %.N,,%L
O ,%. 等折叠股上,这些残基决定了酶的催化底物。
从性质上看,这些残基是疏水性为主。将不同的底
物放入酶的活性部分,侧链与酶分子有空间抵触而
不能作为底物。从模型上看,这可能是导致 )*海因
酶和 (*海因酶催化不同构型底物的主要原因。利
用同源模建技术,来预测不同海因酶结构和底物选
择性的催化机理,也将成为实验设计的重要依
据[,#]。
=:)*@50>=78 @8@4=:84 E:(*@50>=78 @8@4=:84
图 , )*海因酶与 (*海因酶的四级结构
/01 2, P8@4=:84 5? )*@50>=78 =>9 (*@50>=78
! 海因酶的应用及发展[!"]
海因的生物转化有多种海因水解酶和 !*氨甲
酰氨基酸酰胺水解酶的参与。这些酶的合用或单酶
与化学偶联法提供了制备光学纯氨基酸的许多有吸
引力的途径,将海因酶分别与立体专一的 (*氨甲酰
水解酶或 )*氨甲酰水解酶合用可将一个海因消旋
体 %LLQ地转化为光学纯的对映体。例如 (*对羟基
苯甘氨酸、(*苯甘氨酸、)*苯丙氨酸、)*色氨酸、)*对
氯苯基丙氨酸、对三甲硅苯基丙氨酸、)*萘基丙氨酸
和"*萘基丙氨酸等。P=R=<=7<0 等还描述了海因酶的
另一个有趣的应用[,G],将 (*海因酶用于逆反应的催
化,即从!,!*双取代*!*氨甲酰氨基酸的消旋混合物
选择性地合成 (*海因。作为一种天然氨基酸的新
型拮抗,.,.*双取代海因和!,!*双取代氨基酸将会
受到更多的关注。海因酶生物转化法已在光学纯氨
基酸及其衍生物的合成中展现出多方面的作用。
国外学者已对海因酶基因的克隆、测序、重组表
达、酶晶体结构解析以及产酶菌筛选和酶的分离纯
化、固定化、反应动力学等方面做了很多的研究。国
内有部分产酶菌的研究,对海因酶的基础性研究相
对较少。目前海因酶的报道趋向于热稳定性海因酶
产生菌的分离、重组表达及高效海因酶基因改造等
方面。对海因酶进行重组表达的主要作用在于降低
其催化剂的成本,提高催化效率。海因酶的研究正
向细分的方向发展,其中以酶结构和功能的相关研
究最为活跃,可以进一步开展酶的蛋白质设计和分
&LL. 年 G 月 梅艳珍等:海因酶热稳定性及底物特异性研究进展 ·&$·
万方数据
子模拟。对于海因酶的生理功能及相关海因酶热稳
定性、底物特异性以及酶与底物相互作用的详细机
制将是人们关注的焦点[!!,!"]。
在海因酶法氨基酸制备工艺中提升温度将提高
底物的溶解度和海因的自消旋速度,同时有可能发
展海因酶系双相催化的潜力,所以提高酶的稳定性
及其相关酶系固定化技术的发展是该工艺走向产业
化的瓶颈。同时还可开发新的非天然氨基酸产物,
海因酶转化法将是多姿多彩的微生物世界中酶应用
的一个范例。
参考文献:
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·&C· 生物加工过程 第 ! 卷第 ! 期
万方数据
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