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Optimization of fermentation and nitrilase production conditions of engineered Escherichia coli for expression of psn gene

腈水解酶psn基因工程菌的发酵及产酶条件优化



全 文 :第 12卷第 5期
2014年 9月
生  物  加  工  过  程
Chinese Journal of Bioprocess Engineering
Vol􀆰 12 No􀆰 5
Sep􀆰 2014
doi:10􀆰 3969 / j􀆰 issn􀆰 1672-3678􀆰 2014􀆰 05􀆰 002
收稿日期:2014-01-17
基金项目:国家自然科学基金(21206055) ;江苏省自然科学基金(BK2012127)
作者简介:熊  雷(1988—),男,湖北武汉人,硕士研究生,研究方向:生物催化;史劲松(联系人),教授, E⁃mail:shijs@ 163􀆰 com
腈水解酶 psn基因工程菌的发酵及产酶条件优化
熊  雷,李  恒,龚劲松,杨  涛,朱小燕,许正宏,史劲松
(江南大学 药学院,无锡 214122)
摘  要:来自恶臭假单胞菌的腈水解酶具有高效催化 3 氰基吡啶产烟酸的能力,对表达该酶的基因 psn 进行发酵
和产酶条件优化,通过对 C源、N源、磷酸盐、金属离子、温度、诱导剂浓度和诱导时间进行单因素考察,获得最适培
养基条件(g / L):葡萄糖 5、蛋白胨 15、酵母粉 5、(NH4) 2SO4 5、K2HPO4 24􀆰 5、KH2PO4 5􀆰 76、MgSO4 0􀆰 48;最佳诱导
条件:培养 2􀆰 5 h后添加 IPTG诱导,浓度 0􀆰 2 mmol / L,诱导温度 30 ℃。 在该条件下培养,重组大肠杆菌的腈水解酶
比酶活可达到 45􀆰 67 U / mL,比优化前提高了 2􀆰 26倍。 在此基础上,于 5 L发酵罐上进行 C、N源的补料研究,获得
最适分批补料策略,发现其腈水解酶活力可达到 75􀆰 40 U / mL,是优化前的 3􀆰 74倍。
关键词:腈水解酶;烟酸;发酵;分批补料培养
中图分类号:Q78        文献标志码:A        文章编号:1672-3678(2014)05-0007-07
Optimization of fermentation and nitrilase production conditions of
engineered Escherichia coli for expression of psn gene
XIONG Lei,LI Heng,GONG Jinsong,YANG Tao,ZHU Xiaoyan,XU Zhenghong,SHI Jinsong
(School of Pharmaceutical Science,Jiangnan University,Wuxi 214122,China)
Abstract:Nitrilase from Pseudomonas putida exhibited high specificity toward 3⁃cyanopyridine and could
be used for generating nicotinic acid􀆰 In order to optimize the fermentation conditions of recombination
Escherichia coli for expression of psn gene, the influences of carbon source,nitrogen source,phosphorus,
metal ions,temperature,IPTG concentration,time for induction of recombinant E􀆰 coli for expression of psn
were optimized by single factor test􀆰 The optimum culture conditions for the production of nitrilase are as
follows:glucose 5 g / L, tryptone 15 g / L,yeast extract 5 g / L,(NH4) 2 SO4 5 g / L,K2 HPO4 24􀆰 5 g / L,
KH2PO4 5􀆰 76 g / L,MgSO4 0􀆰 48 g / L􀆰 The optimal time point, concentration, temperature for induction
with IPTG were at 2􀆰 5 h after inoculation,0􀆰 2 mmol / L and 30 ℃,respectively􀆰 The activity of nitrilase
expressed in E􀆰 coli under the optimal fermentation conditions reached up to 45􀆰 67 U / mL,which was
2􀆰 26 times higher than the initial level􀆰 And the fed⁃batch fermentation strategy for producing nitrilase
from recombination E􀆰 coli in 5 L fermentor was optimized􀆰 Under the optimized conditions of fed⁃batch
fermentation,the specific activity reached 75􀆰 40 U / mL,which was 3􀆰 74 times higher than the initial
level􀆰
Key words:nitrilase; nicotinic acid; fermentation; fed⁃batch
    腈水解酶(EC 3􀆰 5􀆰 5􀆰 1)是一类能够将腈化合
物水解生成羧酸和氨的催化剂,其立体选择性可用
于解决化学工艺中手性催化效率低的问题[1-2]。 腈
水解酶具有来源广泛、反应条件温和、特异性高和
选择性强的特点,在有机合成领域具有很好的潜在
应用价值[3-5]。 目前已有较多的研究是围绕腈类化
合物的生物转化展开,并已有多种腈水解酶应用于
工业生产,然而仍然存在着诸如比酶活低、稳定性
差和底物谱窄等问题[6]。 因此,筛选发掘新功能的
腈水解酶并通过异源表达提高其产酶水平,是目前
生物转化腈化合物的重要任务。
烟酸又名维生素 B3,被广泛用作药物中间体和
食品添加剂[7],是人体和动物体不可缺少的营养组
分,目前全球市场需求量在 3􀆰 5 万 t 左右。 烟酸的
传统生产工艺是以吡啶为原料,通常需要强酸(或
强碱)、高温和高压等反应条件,存在副产物多、产
量低和环境污染严重等缺点[8-9]。 目前,生物法直
接水解 3 氰基吡啶生成烟酸已成为新的工艺研究
热点,而腈水解酶活性是影响其工艺效益的关键。
Sharma等[10-11]报道了以 3 氰基吡啶为原料,在微
生物腈水解酶的作用下转化生成烟酸的工艺,所获
产品的纯度大大提高,但其腈水解酶活力偏低,仅
为 6􀆰 67 U / mg (以细胞干质量计);同样, Prasad
等[12]从 Rhodococcus sp􀆰 NDB 1165 中获得的腈水解
酶活力也仅为 2􀆰 39 U / mg (以细胞干质量计),导致
最终合成烟酸产量不高而影响其工业应用。
笔者所在课题组朱小燕等[13]筛选到 1 株产腈
水解 酶 的 恶 臭 假 单 胞 菌 ( Pseudomonas putida
CGMCC3830),并已成功扩增获得腈水解酶基因 psn,
再将该 psn克隆到大肠杆菌中,发现其重组菌在腈化
合物的生物转化中表现出良好的应用前景[14]。 在此
基础上,笔者通过对重组工程菌产酶条件的优化,以
期实现腈水解酶工程菌的高菌体浓度和高酶活发酵,
为将来烟酸的生物法生产创造有利条件。
1  材料与方法
1􀆰 1  实验材料
1􀆰 1􀆰 1  菌株与质粒
恶臭假单胞菌腈水解酶基因 psn 由本实验室成
功扩增获得,并在宿主 Escherichia coli Rosetta gami
(DE3)中进行表达,构建了腈水解酶基因工程菌株
E􀆰 coli Rosetta gami (DE3) / pET 28a (+) psn。
1􀆰 1􀆰 2  主要试剂
3 氰基吡啶、烟酸(纯度≥98%),Sigma 公司;氯
霉素、卡那霉素、异丙基 β D 硫代半乳糖苷
(IPTG),上海生工生物工程有限公司;酵母粉和葡萄
糖(生化等级试剂),购于国药集团化学试剂有限
公司。
1􀆰 1􀆰 3  主要仪器
DHZ DA型恒温摇床,太仓市实验设备厂;电
子天平,美国 Sartorius 公司;高效液相色谱仪,美国
Dionex公司;5 L 发酵罐,上海保兴生物设备工程有
限公司;立式冷冻高速离心机,日本日立公司。
1􀆰 1􀆰 4  培养基
种子培养基( g / L):蛋白胨 10、酵母粉 5、NaCl
10;pH 7􀆰 2。
发酵培养基(g / L):葡萄糖 5、蛋白胨 15、酵母
粉 5、(NH4 ) 2 SO4 5、K2 HPO4 24􀆰 5、KH2 PO4 5􀆰 76、
MgSO4 0􀆰 48;pH 7􀆰 2。
C源补料培养基:配制一定体积 100 和 200 g / L
葡萄糖溶液。
N源补料培养基Ⅰ:蛋白胨 15 g,酵母粉 5 g,
(NH4) 2SO4 5 g;定容到 300 mL。
N源补料培养基Ⅱ:蛋白胨 30 g,酵母粉 10 g,
(NH4) 2SO4 10 g;定容到 300 mL。
1􀆰 2  实验方法
1􀆰 2􀆰 1  摇瓶培养
取-80 ℃保存的菌株甘油管,摇瓶活化(37 ℃、
200 r / min、10 h)后,涂布于平板,37 ℃培养 12 h。
挑取单菌落于 50 mL摇瓶培养基中,37 ℃、200
r / min培养 10 h。
以 1%接种量将种子液接入到 250 mL 摇瓶中,
37 ℃、200 r / min振荡培养,于适当时间加入诱导剂
IPTG,诱导产酶。
1􀆰 2􀆰 2  5 L发酵罐培养
取上述种子液,按 1%接种量接入 5 L 发酵罐
中,37 ℃培养,搅拌转速 400 r / min,待适当时间,加
入 IPTG诱导产酶。
1􀆰 2􀆰 3  流加方法
发酵 6 h开始补加,流速控制在 0􀆰 5 mL / min,发
8 生  物  加  工  过  程    第 12卷 
酵 14 h停止补料。
1􀆰 3  检测方法
菌体浓度的测定:菌液稀释适当倍数后,在 600
nm下测定吸光值,OD600 =吸光值×稀释倍数。
菌体干质量的测定:取菌液离心,用生理盐水
洗涤,稀释不同的倍数,放入 105 ℃烘箱中烘干至恒
质量,称质量,绘制出菌体浓度与菌体干质量的标
准曲线,即细胞干质量= 0􀆰 395OD600。
残糖的测定方法:以 BA 40D型生物传感器测
定残糖浓度。
HPLC检测条件:采用戴安 HPLC (Ultimate
3000), C18柱(Waters,4􀆰 6 mm×150 mm,5 μm),流
动相为乙腈和 0􀆰 025%(体积分数)H3PO4混合缓冲
溶液,体积比 3 ∶ 2,流速 1 mL / min,柱温 30 ℃,进样
量 10 μL,检测波长 268 nm。
酶活定义:每分钟产生 1 μmol烟酸所需的酶量
定义为 1个酶活单位(U);每毫克菌体干质量所含
的酶活单位为 1 DCW;每毫升菌液所含酶活单位定
义为 1 U / mL。
取 100 μL菌液,10 000 r / min 离心 2 min,弃上
清,加入 100 mmol / L PBS 缓冲液洗涤菌体,10 000
r / min离心 2 min,弃上清,最后加入 750 μL PBS 缓
冲液,200 mmol / L 3 氰基吡啶(终浓度 50 mmol / L)
250 μL 进行反应,30 ℃下反应 10 min 后,加入 2
mol / L盐酸 200 μL 终止反应,取上清稀释 10 倍后
用 HPLC检测 3 氰基吡啶和烟酸的含量。
2  结果与讨论
2􀆰 1  发酵培养基的优化
2􀆰 1􀆰 1  C源及其质量浓度对产酶的影响
以 LB培养基为起始培养基进行 C 源种类的优
化。 在 LB培养基中分别添加 5 g / L葡萄糖、甘油、蔗
糖、麦芽糖和可溶性淀粉作为 C 源进行单因素实验,
结果见图 1。 由图 1 可知,以葡萄糖为 C 源,菌体生
长最好,酶活最大,因此选择葡萄糖为最佳 C 源。 进
一步设定葡萄糖质量浓度为 1、5、10、15、20和 25 g / L
6个水平,考察不同葡萄糖质量浓度对菌体和酶活的
影响,结果如图 2 所示。 由图 2 可知:最适宜的葡萄
糖质量浓度为 5 g / L时,比酶活达到 38􀆰 22 U / mL,而
继续增加葡萄糖质量浓度至 15 g / L,菌体生物量增
加,但酶活几乎不变,而且葡萄糖浓度过高,会抑制菌
体生长和酶的表达。 从生产成本和酶活角度考虑,最
终将葡萄糖质量浓度选定为 5 g / L。
图 1  C源对重组菌生长及产酶的影响
Fig􀆰 1  Effects of different carbon sources on
E􀆰 coli growth and nitrilase production
图 2  葡萄糖质量浓度对重组菌生长及产酶的影响
Fig􀆰 2  Effects of different concentrations of glucose
on E􀆰 coli growth and nitrilase production
2􀆰 1􀆰 2  N源及其质量浓度对产酶的影响
通过改变 LB培养基中不同 N 源来考察对菌体
和产酶的影响,主要比较了不同有机 N 源及无机 N
源对产酶的影响,结果见表 1和表 2。
表 1  有机 N源对重组菌生长及产酶的影响
Table 1  Effects of organic nitrogen sources on
E􀆰 coli growth and nitrilase production
有机 N源 ρ /(g·L-1)
ρ(DCW) /
(g·L-1)
比酶活 /
(U·mL-1)
蛋白胨 10 1􀆰 3±0􀆰 15 5􀆰 0±2􀆰 01
酵母粉 10 2􀆰 0±0􀆰 13 12􀆰 0±1􀆰 42
牛肉膏 10 2􀆰 4±0􀆰 14 21􀆰 1±2􀆰 24
酵母粉+蛋白胨 5+5 4􀆰 2±0􀆰 17 37􀆰 7±2􀆰 04
牛肉膏+蛋白胨 5+5 2􀆰 5±0􀆰 15 22􀆰 2±1􀆰 17
9  第 5期 熊  雷等:腈水解酶 psn基因工程菌的发酵及产酶条件优化
表 2  无机 N源对重组菌生长及产酶的影响
Table 2  Effects of inorganic nitrogen sources on
E􀆰 coli growth and nitrilase production
无机 N源 ρ /(g·L-1)
ρ(DCW) /
(g·L-1)
比酶活 /
(U·mL-1)
NH4Cl 2 4􀆰 7±0􀆰 23 43􀆰 4±2􀆰 04
(NH4) 2SO4 2 4􀆰 4±0􀆰 26 39􀆰 3±2􀆰 25
NH4NO3 2 4􀆰 1±0􀆰 47 32􀆰 4±2􀆰 15
尿素 2 5􀆰 0±0􀆰 32 41􀆰 7±2􀆰 82
由表 1可知:蛋白胨和酵母粉复合 N 源能有效
促进酶的表达;进而优化复合 N 源的浓度,结果见
图 3 和图 4。 当蛋白胨质量浓度为 15 g / L,比酶活
达到 41􀆰 2 U / mL,当蛋白胨质量浓度继续提高至 20
g / L时,菌体生物量仅有微弱的提升,而酶活无显著
变化,因此最终仍选定蛋白胨质量浓度为 15 g / L。
当酵母粉质量浓度为 5 g / L 时,产酶及比酶活达到
最高,为 42􀆰 46 U / mL(图 3和图 4)。 在此基础上考
察(NH4) 2SO4、NH4Cl、NH4NO3和尿素等无机 N 源
的影响,发现再添加(NH4) 2SO4为 5 g / L 时,菌体比
酶活达到 44􀆰 7 U / mL(图 5)。
图 3  蛋白胨质量浓度对菌体生长和产酶的影响
Fig􀆰 3  Effects of different concentrations of tryptone
on E􀆰 coli growth and nitrilase production
2􀆰 1􀆰 3  磷酸盐添加量的影响
磷酸盐是微生物生长和维持渗透压的必需物
质,对重组质粒的稳定性、菌体生物量和外源蛋白
的表达有影响。 实验考察了不同浓度磷酸盐对重
组菌生长和产酶的影响,结果见图 6。 由图 6 可知,
磷酸盐浓度在 150 mmol / L 时,酶活达到最高,进一
步增加将不利于菌体生长,产酶能力相应降低。
2􀆰 1􀆰 4  金属离子的影响
为考察金属离子对重组菌生长和产酶的影响,
图 4  酵母粉质量浓度对菌体生长和产酶的影响
Fig􀆰 4  Effects of different concentrations of
yeast extract on E􀆰 coli growth and
nitrilase production
图 5  (NH4) 2SO4 质量浓度对菌体生长和产酶的影响
Fig􀆰 5  Effects of different concentrations of (NH4) 2SO4
on E􀆰 coli growth and nitrilase production
图 6  磷酸盐浓度对重组菌生长及产酶的影响
Fig􀆰 6  Effects of different concentrations of phosphate
on E􀆰 coli growth and nitrilase production
分别在培养基中添加 2􀆰 5 mmol / L金属离子,结果见
图 7。 由图 7可知,Cu2+对菌体生长有一定的抑制作
用,这与 Cu2+对 Rhodococcus rhodochrous J1生长与产
腈水解酶特性基本一致[16]。 Mg2+对菌体产酶有一
定的促进,经浓度优化,得出其适宜的浓度为 4
mmol / L。
01 生  物  加  工  过  程    第 12卷 
图 7  金属离子对重组菌生长及产酶的影响
Fig􀆰 7  Effects of different metallic ions on E􀆰 coli
growth and nitrilase production
2􀆰 2  发酵条件的优化
2􀆰 2􀆰 1  诱导温度的优化
温度是影响菌体生长和外源蛋白表达的重要
因素,实验考察不同诱导温度对重组菌生长和产酶
的影响(图 8)。 由图 8 可知,在较为广泛的温度范
围内(26~37 ℃)进行诱导,均可以获得 4􀆰 0 g / L 以
上的菌体量和较好的产酶水平,其中以 30 ℃相对
较优。
图 8  诱导温度对重组菌生长及产酶的影响
Fig􀆰 8  Effects of temperature on E􀆰 coli growth
and nitrilase production
2􀆰 2􀆰 2  诱导剂浓度和诱导时间对菌体和产酶的
影响
采用 IPTG作为诱导剂,考察不同添加浓度和
不同诱导时机对菌体生长和产酶的影响,结果见
图 9。 由图 9 可知,对本工程菌而言,诱导剂浓度
对菌体生长没有太大影响,其中 IPTG 在 0􀆰 2
mmol / L时酶活相对较高。 诱导时间对酶活和菌
体生长的影响较大,在接种后 2􀆰 5 h 时诱导,菌浓
和比酶活都达到最大值,分别为 5􀆰 14 g / L 和
44􀆰 82 U / mL(图 10)。
图 9  诱导剂浓度对重组菌生长及产酶的影响
Fig􀆰 9  Effects of concentration of IPTG on E􀆰 coli
growth and nitrilase production
图 10  诱导时间对重组菌生长及产酶的影响
Fig􀆰 10  Effects of time of adding IPTG on E􀆰 coli
growth and nitrilase production
2􀆰 2􀆰 3  5 L发酵罐培养过程研究
基于摇瓶培养条件,开展 5 L罐上的发酵研究,
分析培养过程的菌体浓度、残糖、pH和酶活等参数,
为小罐发酵的优化提供思路,图 11为未进行流加控
制的重组菌发酵过程。 由图 11可知:随着葡萄糖的
消耗,发酵液 pH从 7􀆰 4 开始逐步下降,至 8 h 葡萄
糖利用完全时,pH 降至 6􀆰 75,之后有所回升(图 11
(a))。 而采用 NH3·H2O流加控制 pH后,菌体浓度
有所提高,菌体量达到 5􀆰 69 g / L(图 11(b))。
发酵 8 h后,葡萄糖大幅度消耗,菌体生长减缓
(图 11(a)和图 11(b)),因此,考虑补充营养物质来
提高菌体浓度。 首先考察葡萄糖的流加,从发酵 6 h
开始补料,分别补加葡萄糖终质量浓度为 1和 2 g / L
(图 12 (a)和图 12(b)),发现补糖 1 g / L 时,菌体量
可以达到 8􀆰 29 g DCW/ L,比酶活达到 50􀆰 78 U / mL;
补糖 2 g / L时,菌体量可达到 12􀆰 46 g DCW/ L,比酶活
达到 57􀆰 21 U / mL。
考虑不同 C、N比对菌体生长和产酶的影响,即
11  第 5期 熊  雷等:腈水解酶 psn基因工程菌的发酵及产酶条件优化
图 11  5 L发酵罐上重组菌的发酵曲线
Fig􀆰 11  Fermentation curve of E􀆰 coli in 5 L fermentor
图 12  葡萄糖补加策略对菌体生长和产酶的影响
Fig􀆰 12  Effects of feeding strategy of glucose on
E􀆰 coli growth and nitrilase production
在补加 C源的同时补加不同浓度的 N源;方案 1 采
用 N源补料培养基Ⅰ,发现菌浓和酶活都有所提高
(图 13 (a));方案 2 采用 N 源补料培养基Ⅱ,发现
菌体浓度在 6~10 h 内快速增长,至 14 h 仍呈增长
趋势,最终可达 15􀆰 36 g / L,且比酶活提高到 75􀆰 40
U / mL(图 13 (b))。
图 13  补加 N源策略对菌体生长和产酶的影响
Fig􀆰 13  Effects of feeding strategy of nitrogen source
on E􀆰 coli growth and nitrilase production
2􀆰 3  SDS PAGE对腈水解酶表达量的分析
为比较不同发酵条件下腈水解酶的表达量,采用
SDS PAGE 对菌体全细胞蛋白进行分析,结果见图
14。 由图 14可知:优化后腈水解酶的表达量显著提升。
M—标准蛋白;1—诱导前的菌体;
2—优化的 LB培养菌体;3—培养基优化后菌体;
4—5 L发酵罐补料优化后菌体
图 14  发酵优化后菌体 SDS PAGE电泳图
Fig􀆰 14  SDS⁃PAGE analysis of cells growth under
different fermentation conditions
21 生  物  加  工  过  程    第 12卷 
3  结  论
对腈水解酶的基因工程大肠杆菌培养基组分
进行研究,考察了 C、N 源、磷酸盐和金属离子对重
组大肠杆菌生长和产酶的影响,确定了最佳培养基
成分,经过浓度优化,得到培养基组分( g / L):葡萄
糖 5、蛋白胨 15、酵母粉 5、(NH4) 2 SO4 5、K2HPO4
24􀆰 5、KH2PO4 5􀆰 76 和 MgSO4 0􀆰 48。 在此条件下在
30 ℃培养 2􀆰 5 h后添加终浓度 0􀆰 2 mmol / L的 IPTG
进行诱导,发现比酶活从初始的 20􀆰 17 U / mL 提高
到 45􀆰 67 U / mL。 随后在 5 L发酵罐进行控制 pH和
进行流加策略的优化,得到最终的产酶水平为
75􀆰 40 U / mL,相比优化前提高了 3􀆰 74 倍,亦为工业
上开展烟酸的生物转化奠定了良好的技术基础。
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(责任编辑  周晓薇)
31  第 5期 熊  雷等:腈水解酶 psn基因工程菌的发酵及产酶条件优化