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Evaluation of Acting Domain and Strength Mediating the Protein Self-interactions of SVP and FLC in Brassica juncea

芥菜开花负调因子SVP 及FLC 同源互作域筛选和作用强度分析



全 文 :园 艺 学 报 2013,40(4):675–684 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com
收稿日期:2012–12–01;修回日期:2013–03–11
基金项目:重庆市自然科学基金项目(2011BA1002);国家自然科学基金项目(31000908);中央高校基本科研业务费专项(XDJK2012B020);
国家重点基础研究发展计划(973 计划)项目(2012CB113900)
* 共同第一作者
** 通信作者 Author for correspondence(E-mail:swausongm@yahoo.com.cn;swutql@163.com)
芥菜开花负调因子 SVP及FLC同源互作域筛选
和作用强度分析
汤青林,丁 宁*,李念祖,王志敏,宋 明**
(西南大学园艺园林学院,南方山地园艺学教育部重点实验室,重庆市蔬菜学重点实验室,重庆 400715)
摘 要:为探明芥菜开花负调因子 SVP、FLC 自身聚合的分子机制及其蛋白作用模式,利用酵母双
杂交体系,分别对 SVP、FLC 蛋白自身聚合及其作用强度进行研究。结果表明:酵母菌 Y187 转化子
Y187-pGADT7SVP 和Y187-pGADT7SVP2 ~ 5 均能与酵母菌 Y2HGold 转化子 Y2HGold-pGBKT7SVP 融合,
并可在选择性固体培养基 QDO/X/A 上长出蓝色菌落,而 Y187-pGADT7SVP1 × Y2HGold-pGBKT7SVP 不
能在 QDO/X/A 生长。说明 SVP 蛋白能自身聚合,且与截短体 SVP2 ~ 5 同源结合,SVP 蛋白自身聚合需
要核心作用域 K 域参与。尽管 MI 域不能单独介导 SVP 自身聚合,但它的存在却能使 SVP 自身聚合作用
增强,C 域有可能会削弱该作用。同时,Y2HGold-pGBKT7FLC 和 Y2HGold-pGBKT7FLC2 ~ 5 也能与
Y187-pGADT7FLC 融合,同时激活报告基因 AUR1-C、HIS3、ADE2、MEL1,FLC 能与截短体 FLC2 ~ 5
同源互作。K 域是 FLC 蛋白自身聚合必须的,I 域会增强这一作用。SVP 和 FLC 的核心作用域 K 域均由
K1、K2 和 K3 亚域组成,形成 3 个经典的 α 螺旋,K 域有 9 个高度保守的氨基酸位点及蛋白互作的结构
模体(亮氨酸拉链)。
关键词:芥菜;截短体;SVP;FLC;酵母双杂交
中图分类号:S 637.1 文献标志码:A 文章编号:0513-353X(2013)04-0675-10

Evaluation of Acting Domain and Strength Mediating the Protein
Self-interactions of SVP and FLC in Brassica juncea
TANG Qing-lin,DING Ning*,LI Nian-zu,WANG Zhi-min,and SONG Ming**
(College of Horticulture and Landscape Architecture,Southwest University;Key Laboratory of Horticulture Science for
Southern Mountainous Regions,Ministry of Education;Key Laboratory of Olericulture,Chongqing 400715,China)
Abstract:For further study on the molecular mechanism and interaction model of SVP and FLC
protein homologous dimerization in flowering control in Brassica juncea Coss.(mustard),the self-
interactions of SVP and FLC were detected by the yeast two-hybrid system. The yeast stains of
pGADT7SVP or pGADT7SVP2–5 could mate with pGBKT7SVP,which grew on selective agar plates
QDO/X/A(SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-Gal/AbA)with blue stains. However,Y187-pGADT7SVP1 and
Y2HGold-pGBKT7SVP could not mate into zygote diploids to grow on selective plates DO/X/A. The

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results showed that SVP or SVP2–5 truncated forms could act with SVP itself to combine and form
homodimers. K domain of SVP was the key amino acid region to independently mediate and determine the
homologous dimerization. MI-domain of SVP alone could not induce the self-interactions of SVP,but
enhance the strength of homologous interactions. However,C-domain of SVP could weaken the protein
self-interaction strength. The yeast stains of pGBKT7FLC2–5 and pGADT7FLC could mate into zygotes
and grew on selective agar plates QDO/X/A with blue stains. The DNA-BD and AD were brought into
proximity to activate transcription of four independent reporter genes(AUR1-C,HIS3,ADE2,MEL1).
FLC2–5 truncated forms and FLC protein could act with each other to form homodimers. It also indicated
that K domain of FLC may play an important role in mediating the FLC homodimers. However,I-domain
of FLC could strengthen the protein self-interactions. Alignment analysis of K domain sequence showed
that K domain was consist of three subdomains(K1,K2 and K3)and formed three  helixes. Nine high
conservative amino acids existed in K domain. Leucine zippers,protein interaction motifs,lied in K
domain.
Key words:Brassica juncea;truncated forms;SVP;FLC;yeast two-hybrid system

开花负调因子 SVP 属 MADS 盒蛋白,是一个重要的开花抑制子(Hartmann et al.,2000),在开
花网络中具有核心调节作用。SVP 蛋白能在茎尖分生组织和叶片中直接抑制 SOC1 基因的转录,从
而抑制开花(Li et al.,2008)。此外,表达于叶片并长距离运输到茎顶端分生组织的成花信号 FT,
也会受到 SVP 的调节(Lee et al.,2007)。SVP 蛋白能结合到 SOC1 和 FT 基因的启动子上,抑制其
转录表达,该结合区域同时也是另一个开花路径核心调节子 FLC 蛋白的绑定位点(Abe et al.,2005;
Wigge et al.,2005;Searle et al.,2006;Corbesier et al.,2007),SVP 能与 FLC 相互作用,延缓开
花(Li et al.,2008;Sumire et al.,2008;Jung & Müller,2009)。目前利用 pET 原核表达系统和酵
母双杂交系统已分别证实了芥菜 SVP 与 FLC 能够相互作用,形成稳定的异源蛋白复合物(汤青林
等,2011,2012a)。
但是,两个 MADS 盒蛋白之间的相互作用,往往并非只形成单纯的异源二聚体。酵母双杂表明,
拟南芥中许多 MADS 盒蛋白除了能形成异源二聚体外,还能够形成同源二聚体,最终为同源异源四
聚体(de Folter et al.,2005)。很可能这些同源异源四聚体才是真正行使功能的蛋白复合体(Immink
et al.,2002;Yang & Jack,2004;Nougalli et al.,2006)。
有关 FLC 蛋白同源二聚体的研究已有报道。例如,Chris 等(2006)构建了 FLC-FLAG 标签蛋
白载体(gFLC-FLAG),并转到 FLC 内源表达量高的植物中。利用 anti-FLAG M2 对 FLC-FLAG 蛋
白免疫沉淀,发现 FLC-FLAG 和内源 FLC 共存于蛋白复合物中,由此表明 FLC 能够形成同源二聚
体。但是,有关 FLC 自身聚合的研究均集中于模式植物拟南芥,FLC 是否也能在芥菜中发生自身聚
合,目前还未见报道。此外,SVP 蛋白是否也能够自身聚合,形成同源二聚体,目前还缺乏直接的
分子证据。为了检测 SVP、FLC 蛋白的自身聚合及其作用域,作者构建了 SVP、FLC 的多个截短体,
并进行了酵母双杂交试验,对揭示 SVP 与 FLC 互作模型及其开花调控的分子机理具有重要意义。
1 材料与方法
1.1 试验材料
酵母双杂交系统(Matchmaker Gold Yeast Two-Hybrid System)、Aureobasidin A(以下简称 AbA)、
4 期 汤青林等:芥菜开花负调因子 SVP 及 FLC 同源互作域筛选和作用强度分析 677

X--Gal、YPD、YPDA 及各种酵母缺陷型培养基均购自 Clontech 公司。β–半乳糖苷酶活性测定试
剂盒(Yeast β-Galactosidase Assay Kit)购自 Thermo 公司。芥菜 SVP、FLC 及相应截短体 SVP1 ~ 5、
FLC1 ~ 5 均由本实验室提供(汤青林 等,2012b),编码氨基酸以及结构域见表 1 和图 1。

表 1 SVP、FLC 及其截短体
Table 1 SVP,FLC and its truncated forms
截短体名称
Truncated name
编码氨基酸数
Number of amino acids
编码蛋白的结构域
Protein domain
SVP 241 MIKC
SVP1 95 MI
SVP2 173 MIK
SVP3 78 K
SVP4 179 IKC
SVP5 146 KC
FLC 197 MIKC
FLC1 110 MI
FLC2 168 MIK
FLC3 54 K
FLC4 148 IKC
FLC5 92 KC
注:SVP、FLC 表示蛋白全长;SVP1 ~ 5、FLC1 ~ 5 表示相应的蛋白截短体;MIKC、MI、MIK、K、IKC 和 KC 分别由蛋白质 M、I、
K、C 结构域中的若干个结构域组合而成(例如,MIKC 由 M、I、K 和 C 域构成;MI 由 M 和 I 域构成)。
Note:SVP and FLC represented full length proteins. And SVP1–5,FLC1–5 represented truncated forms of corresponding proteins. MIKC,
MI,MIK,K,IKC and KC respectively represented corresponding combination proteins of M,I,K or C domains.


图 1 芥菜 SVP(A)、FLC(B)蛋白结构域
MADS、I、K 和 C 表示 MIKC 型蛋白的结构域。
Fig. 1 Domain structure of SVP(A)and FLC(B)in Brassica juncea Coss.
MADS,I,K and C represented structure domains of proteins.

1.2 酵母表达载体构建及其毒性、自激活检测
SVP、FLC 质粒经 EcoRⅠ/BamHⅠ双酶切后分别连接到酵母质粒 pGBKT7、pGADT7,构建诱饵
质粒 pGBKT7SVP、pGBKT7FLC 和猎物质粒 pGADT7SVP、pGADT7FLC,并分别转化酵母菌 Y2HGold
和 Y187。截短体 SVP1 ~ 5、FLC1 ~ 5 质粒分别酶切后连接到酵母质粒 pGBKT7、pGADT7,构建酵
母质粒 pGBKT7FLC1 ~ 5、pGADT7SVP1 ~ 5,并分别转化酵母菌 Y2HGold 和 Y187。
酵母转化子 Y2HGold-pGBKT7SVP、Y187-pGADT7SVP、Y187-pGADT7SVP1 ~ 5、Y2HGold-
pGBKT7FLC、Y2HGold-pGBKT7FLC1 ~ 5 、Y187-pGADT7FLC 自身均不能激活报告基因,且对酵
母无毒性,可用于后续的酵母双杂交研究(汤青林 等,2012b)。
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1.3 酵母双杂交及其作用域筛选
分别挑取 SD/-Trp、SD/-Leu 平板上的菌落,将 SVP 全长转化子 Y187-pGADT7SVP1 及 SVP1 ~
5 片段转化子 Y187-pGADT7SVP1 ~ 5 分别与 Y2HGold-pGBKT7SVP 转化菌落两两组合,同时接种
于 500 μL 的 2× YPDA 液体培养基中,30 ℃振荡培养 20 ~ 24 h,在 40 倍显微镜下检测 Y2HGold 与
Y187 交配形成二倍体接合型的情况。然后将融合菌液涂布到 SD/-Trp/-Leu(DDO)、SD/-Trp/-Leu/AbA
(DDO/AbA)平板上,30 ℃培养 3 ~ 5 d;最后将 DDO/AbA 平板上的克隆菌株划线至 SD/-Trp/-Leu/-
Ade/-His(QDO)和 SD/-Trp/-Leu/-Ade/-His/x-α-Gal/AbA(QDO/X-α-Gal/AbA)平板,同时设阳性和
阴性对照,观察菌落生长情况。
同样将含有FLC全长的Y187-pGADT7FLC转化子与含有不同结构域的Y2HGold-pGBKT7FLC、
Y2HGold-pGBKT7FLC1 ~ 5 两两融合后,分别先后涂布于 DDO、DDO/AbA、QDO 和 QDO/X-α-Gal/
AbA 平板上,检测 FLC 蛋白自身聚合情况,并筛选相应的结构域。
1.4 β–半乳糖苷酶活性测定
采用 Thermo 公司 Yeast β-Galactosidase Assay Kit 试剂盒。
(1)挑取融合菌的单克隆菌落,置于 5 mL YPDA 液体培养基中,30 ℃、200 r · min-1 培养 10 ~
14 h,至指数生长中期(OD660 = 0.5 ~ 1.0),准确记录 OD660 值。
(2)将 2× β–半乳糖苷酶含量测定液置于冰上。
(3)移取 1.0 mL 培养物到 1.5 mL EP 管中,13 000 × g 离心 1 min 移去上清液。同法离心,用
无菌水清洗沉淀两次。依次加入 250 μL 酵母蛋白提取试剂(Y-PER)、250 μL 的 2× β–半乳糖苷酶
含量测定液,放入 37 ℃培养箱,立即计时。
(4)待出现黄色后,加入 200 μL 的 β–半乳糖苷酶反应终止液涡旋 15 s,并停止计时。
(5) 13 000 × g离心30 s去除沉淀,转移上清液,420 nm处测定吸光值。对照采用250 μL Y-PER、
250 μL 的 2× β–半乳糖苷酶含量测定液和 200 μL 的 β–半乳糖苷酶反应终止液。
每样品重复测 3 次,取平均值。β–半乳糖苷酶活性 =(1 000 × A420)/(t × V × OD660)。t 为
反应时间(min),V 为用作检测活性的菌悬液体积(mL),活性单位表示为‘Miller Units’(郜尽 等,
2009)。
2 结果与分析
2.1 SVP 及 FLC 全长自身聚合鉴定
2.1.1 SVP全长自身聚合鉴定
将芥菜 SVP 全长(含有 MIKC 结构域)构建到诱饵质粒 pGBKT7 和猎物质粒 pGADT7,并分
别转化酵母 Y2HGold 和 Y187。酵母转化子 Y2HGold-pGBKT7SVP 与 Y187-pGADT7SVP 融合后的
二倍体酵母记为 H0,Y2HGold-pGBKT7SVP 与空载 Y187-pGADT7 融合、空载 Y2HGold-pGBKT7
与 Y187-pGADT7SVP 融合分别记为 M、C0,酵母试剂盒中自带的阳性和阴性对照分别记为 P、N
(表 2)。
H0 在 DDO 培养基上生长,说明 SVP 与 SVP 自身融合,形成了二倍体酵母;H0 也能在 DDO/AbA
上生长,说明激活了酵母报告基因 AUR1-C;H0 在 QDO 固体培养基上可正常生长,说明激活了酵
母报告基因 HIS3 和 ADE2(表 2)。另外,H0 还能够在 QDO/X-α-Gal/ AbA(SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/
X-α-Gal/AbA)固体培养基上长出蓝色菌落,激活酵母报告基因 MEL1,而阴性对照(M、C0)却不
4 期 汤青林等:芥菜开花负调因子 SVP 及 FLC 同源互作域筛选和作用强度分析 679

能在 QDO/X-α-Gal/AbA 固体培养基上生长(表 2)。由此表明:SVP 全长蛋白(含 MIKC 域)确实
能够发生自身聚合,形成同源蛋白复合物,启动酵母的 4 个报告基因 HIS3、AUR1-C、ADE2、MEL1
全部表达。
表 2 SVP 及 FLC 全长自身聚合分析
Table 2 Analysis of the self-interactions of SVP and FLC in yeast
选择性培养基 Selective agar plates 编号
No.
类型 Type
DDO DDO/AbA QDO QDO/X-α-Gal/AbA
H0 Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP + + + ++
M Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7 + – – –
C0 Y2HGold-pGBKT7 × Y187-pGADT7SVP + – – –
F0 Y2HGold-pGBKT7FLC × Y187-pGADT7FLC + + + ++
L Y2HGold-pGBKT7 × Y187-pGADT7FLC + – – –
K0 Y2HGold-pGBKT7FLC × Y187-pGADT7 + – – –
P Y2HGold-pGBKT7-53 × Y187-pGADT-T + + + ++
N Y2HGold-pGBKT7-Lam × Y187-pGADT-T + – – –
注:++、+ 和–分别表示蓝色菌落、白色菌落和无菌落。
Note:++,+ and–respectively represented blue yeast stains,white yeast stains and no stains on the plates.

2.1.2 FLC全长自身聚合鉴定
酵母转化子 Y2HGold-pGBKT7FLC 与 Y187-pGADT7FLC 融合的二倍体酵母 Y2HGold- pGBKT
7FLC × Y187-pGADT7FLC 记为 F0,Y2HGold-pGBKT7FLC 与空载 Y187-pGADT7FLC 融合、空载
Y2HGold-pGBKT7 与 Y187-pGADT7FLC 融合分别记为 L、K0(表 2)。
二倍体酵母 F0在DDO、DDO/AbA和QDO固体培养基上均可正常生长,还能够在QDO/X-α-Gal/
AbA(SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-Gal/AbA)固体培养基上长出蓝色菌落,启动 HIS3、AUR1-C、ADE2、
MEL1 这 4 个报告基因的表达;而阴性对照(N、L、K0)却不能在 QDO/X/A 固体培养基上生长(表
2)。由此表明:芥菜 FLC 也能自身聚合形成同源蛋白复合体。
2.2 SVP 及 FLC 同源互作结构域筛选
2.2.1 SVP全长与截短体互作及结构域筛选
为了进一步筛选 SVP 蛋白自身聚合的结构域,设置 6 个处理 H0、H1、H2、H3、H4、H5 和 9
个对照组 C0、C1、C2、C3、C4、C5、M、P、N(图 2,A)。在 9 个对照中,酵母双杂系统试剂盒
中的阳性对照 Y2HGold-pGBKT7-53 × Y187-pGADT-T(图 2,A 中 P)在 DDO/AbA、QDO 中均能
生长,在 QDO/X-α-Gal/AbA 缺陷型培养基中也能生长,呈蓝色菌落(图 2,A)。其余 8 个对照在这
3 种培养基中都不生长。可见本酵母双杂交系统稳定严谨,可以用于 SVP 蛋白同源互作域的筛选。
在 6 个处理组中,只有 Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP、Y2HGold-pGBKT7SVP ×
Y187-pGADT7SVP2、Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP3、Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-
pGADT7SVP4、Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP5 这 5 个(图 2,A 中 H0、H2 ~ 5)能
够在缺陷型培养基 DDO/AbA、QDO 上长出白色菌落,且在 QDO/X-α-Gal/AbA 培养基中呈现蓝色
菌落(图 2,A),能够激活酵母双杂系统的 ADE2、AUR1-C、HIS3 和 MEL1 报告基因,发生蛋白相
互作用。Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP1 处理不能在 DDO/AbA、QDO 和 QDO/X-α-Gal/
AbA 培养基上生长,不能发生蛋白互作(图 2,A 中 H1)。
截短体蛋白 SVP2(含 MIK 域)、SVP3(含 K 域)、SVP4(含 IKC 域)、SVP5(含 KC 域)均
含有 K 域,且分别能够与 SVP 全长结合,但 SVP1(只有 MI 域,不含 K 域)不能与 SVP 全长结合。
说明 K 域可以介导 SVP 蛋白的自身二聚化,是 SVP 蛋白同源互作的关键结构域。
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图 2 酵母中 SVP(A)、FLC(B)自身聚合分析
Fig. 2 Analysis of the self-interactions of SVP and FLC in yeast on the plate QDO/X-α-Gal/AbA
H0:Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP;H1:Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP1;
H2:Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP2;H3:Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP3;
H4:Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP4;H5:Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7SVP5;
P:Y2HGold-pGBKT7-53 × Y187-pGADT-T;N:Y2HGold-pGBKT7-Lam × Y187-pGADT-T;
M:Y2HGold-pGBKT7SVP × Y187-pGADT7;C0:Y2HGold-pGBKT7 × Y187-pGADT7SVP;
C1:Y2HGold-pGBKT7 × Y187-pGADT7SVP1;C2:Y2HGold-pGBKT7 × Y187-pGADT7SVP2;
C3:Y2HGold-pGBKT7 × Y187-pGADT7SVP3;C4:Y2HGold-pGBKT7 × Y187-pGADT7SVP4;
C5:Y2HGold-pGBKT7 × Y187-pGADT7SVP5.
F0:Y2HGold-pGBKT7FLC × Y187-pGADT7FLC;F1:Y2HGold-pGBKT7FLC1 × Y187-pGADT7FLC;
F2:Y2HGold-pGBKT7FLC2 × Y187-pGADT7FLC;F3:Y2HGold-pGBKT7FLC3 × Y187-pGADT7FLC;
F4:Y2HGold-pGBKT7FLC4 × Y187-pGADT7FLC;F5:Y2HGold-pGBKT7FLC5 × Y187-pGADT7FLC;
P:Y2HGold-pGBKT7-53 × Y187-pGADT-T;N:Y2HGold-pGBKT7-Lam × Y187-pGADT-T;
L:Y2HGold-pGBKT7 × Y187-pGADT7FLC;K0:Y2HGold-pGBKT7FLC × Y187-pGADT7;
K1:Y2HGold-pGBKT7FLC1 × Y187-pGADT7;K2:Y2HGold-pGBKT7FLC2 × Y187-pGADT7;
K3:Y2HGold-pGBKT7FLC3 × Y187-pGADT7;K4:Y2HGold-pGBKT7FLC4 × Y187-pGADT7;
K5:Y2HGold-pGBKT7FLC5 × Y187-pGADT7.

2.2.2 FLC全长与截短体互作及结构域筛选
由酵母双杂交结果可知(图 2,B),截短体蛋白 FLC2(缺少 C 域)、FLC3(只含有 K 域)、FLC4
(缺少 M 域)、FLC5(缺少 M 域和 I 域)分别能够与 FLC 全长蛋白融合,并均能在 QDO/X-α-Gal/
AbA 固体培养基上生长,菌落呈现不同程度的蓝色(图 2,B 中编号 F2、F3、F4、F5),证明激活
了酵母的 4 个报告基因 AUR1-C、HIS3、ADE2、MEL1。但是 FLC1(只含有 M 域和 I 域)不能与
FLC 全长发生蛋白互作(图 2,B 中编号 F1)。
由此表明:FLC 蛋白自身聚合作用既不由 C 域决定,也不由 M 域和 I 域决定,而是由核心结构
域 K 域所决定。
2.3 SVP 及 FLC 自身聚合的作用强度分析
2.3.1 SVP自身聚合强度分析
为了进一步检测 SVP 蛋白自身聚合的作用强度,采用 Thermo 公司 Yeast β-Galactosidase Assay
Kit 试剂盒测定了 β–半乳糖苷酶活性。由于酵母 Y187 含有 LacZ 启动子,酵母 Y187 单转化子不能
在 QDO/X-α-Gal/AbA 培养基上生长(LacZ 启动子不能激活),但是 Y187 转化子与 Y2HGold 转化子
融合并产生相互作用后则可在 QDO/X-α-Gal/AbA 培养基上生长,激活 LacZ 启动子。因此可用 β–
半乳糖苷酶活性检测 LacZ 启动子,从而推测蛋白相互作用强度。
4 期 汤青林等:芥菜开花负调因子 SVP 及 FLC 同源互作域筛选和作用强度分析 681

方差分析表明,SVP 全长与 SVP 截短体的互作强度差异达到极显著水平(表 3),其中 SVP2(含
K 域,也含 MI 域)与 SVP 作用的酶活性 16.65 极显著高于 SVP3(只含 K 域)与 SVP 杂交组合(酶
活性为 10.34),也极显著高于其余杂交组合。由此可见 K 域是引发 SVP 自身聚合的核心结构域。
尽管 MI 域单独不会引发 SVP 自身聚合,但 MI 域的存在会使 SVP 自身聚合强度显著增加。不含 C
域的蛋白截短体组合(SVP2 × SVP、SVP3 × SVP)的作用强度均极显著高于含 C 域的截短体组合
(SVP × SVP、SVP4 × SVP、SVP5 × SVP),由此推测,C 域可能会干扰(削弱)SVP 自身聚合。

表 3 酵母中SVP自身聚合强度分析
Table 3 Analysis of the self-interaction strength of SVP in yeast
选择性培养基 Selective agar plates SVP杂交组合
Hybrid
combinations
BD AD
截短体结构域
Protein domain
of truncated
forms
DDO DDO/AbA QDO
QDO/X-α-Gal/
AbA
相互作用
Interactio
ns
酶活性/Miller
Units
β-galactosidase
activity
SVP SVP2 MIK 白色 White 白色 White 白色 White 蓝色 Blue 有 Yes 16.65 A
SVP SVP3 K 白色 White 白色 White 白色 White 蓝色 Blue 有 Yes 10.34 B
SVP SVP4 IKC 白色 White 白色 White 白色 White 蓝色 Blue 有 Yes 2.49 C
SVP SVP MIKC 白色 White 白色 White 白色 White 蓝色 Blue 有 Yes 2.19 C
SVP SVP5 KC 白色 White 白色 White 白色 White 蓝色 Blue 有 Yes 1.58 C
SVP SVP1 MI 白色 White 无 No 无 No 无 No 无 No 0.03 D

2.3.2 FLC自身聚合强度分析
FLC 蛋白自身聚合的酶活性分析也表明,不同结构域与 FLC 全长的作用强度不同(表 4)。FLC4
(含有 K 域,也含 I 和 C 域)与 FLC 作用强度(18.49)极显著高于 FLC3(只含 K 域)与 FLC 杂
交组合(9.08),也极显著高于 FLC5(含 K 域,也含 C 域)与 FLC 杂交组合。由此可见,K 域是
FLC 蛋白自身聚合必须的,C 域不会增强这一作用,但 I 域会增强 FLC 自身聚合。FLC 分别与 FLC
(含 IKC 域,也含 M 域)、FLC2(含 IK 域,也含 M 域)杂交,其作用强度均极显著低于杂交组合
(SVP × SVP4、SVP × SVP3),可见 M 域的存在会干扰(削弱)FLC 自身聚合。
以上分析表明,SVP 以及 FLC 蛋白自身聚合均需要核心结构域 K 域参与,I 域的存在会增加它
们的作用强度。
表 4 酵母中 FLC 自身聚合强度分析
Table 4 Analysis of the self-interaction strength of FLC in yeast
选择性培养基 Selective agar plates FLC杂交组合
Hybrid
combinations
BD AD
截短体结构域
Protein domain
of truncated
forms
DDO DDO/AbA QDO
QDO/X-α-Gal/
AbA
相互作用
Interactions
酶活性/Miller
Units
β-galactosidase
activity
FLC4 FLC IKC 白色 White 白色 White 白色 White 蓝色 Blue 有 Yes 18.49 A
FLC3 FLC K 白色 White 白色 White 白色 White 蓝色 Blue 有 Yes 9.08 B
FLC FLC MIKC 白色 White 白色 White 白色 White 蓝色 Blue 有 Yes 2.05 C
FLC2 FLC MIK 白色 White 白色 White 白色 White 蓝色 Blue 有 Yes 1.76 C
FLC5 FLC KC 白色 White 白色 White 白色 White 蓝色 Blue 有 Yes 0.94 D
FLC1 FLC MI 白色 White 无 No 无 No 无 No 无 No 0.05 E
2.4 核心作用域 K 域氨基酸序列分析
K 域氨基酸序列分析表明:与其他作物(白菜、甘蓝、拟南芥、大豆、葡萄和猕猴桃)开花调
控因子 SVP、FLC、AP1、CAL 蛋白 K 域一样,芥菜 SVP(BjSVP)和 FLC(BjFLC)的 K 域也由
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K1、K2 和 K3 亚域组成,每个亚域均有七价(abcdefg)n 重复区(图 3),其中,a 和 d 位置几乎全
为疏水氨基酸,使得 K 域形成了 3 个经典的 α 螺旋,这与在线 α螺旋分析(http://www.ch.embnet.org/
software/COILS_form.html)的结果一致。
芥菜 SVP 蛋白 K 域的第 1 个 α 螺旋(K1 亚域)在第 1 到 19 位氨基酸内(图 3,Ⅰ);第 2 个
α螺旋(K2 亚域)在 K 域第 32 到 46 位氨基酸内(图 3,Ⅱ);第 3 个 α 螺旋(K3 亚域)在 K 域第
54 到 75 位氨基酸内(图 3,Ⅲ)。而 FLC 蛋白 K 域的第 1 个 α 螺旋(K1 亚域)在第 4 到 18 位氨
基酸内(图 3,Ⅱ),第 2 个 α螺旋(K2 亚域)在 K 域第 26 到 47 位氨基酸内(图 3,Ⅲ);第 3 个
α螺旋(K3 亚域)则从 K 域第 51 位氨基酸一直延伸到 C 域(图 3,Ⅳ,FLC 蛋白的 C 域未列出)。
SVP 蛋白的 K1 与 K2 亚域之间(或者 FLC 蛋白 I 域与 K1 亚域之间),有两个保守性较强的疏
水氨基酸位点(图 3 中用 h 标注),它们并不影响这两个结构域的 α 螺旋。SVP 蛋白的 K2 与 K3 亚
域之间(或者 FLC 蛋白的 K1 亚域与 K2 亚域之间)有一个高度保守的碱性氨基酸 Lys,它位于 SVP
蛋白 K 域第 50 位(或 FLC 蛋白 K 域第 22 位),也不会影响 α螺旋。
SVP 蛋白 K2 亚域内(或 FLC 蛋白 K1 亚域)有 5 个高度保守的氨基酸位点(图 3 双下划线所
示),除了 1 个位点为酸性氨基酸 Glu,其它 4 个均为疏水氨基酸 Leu。SVP 蛋白 K3 亚域(或 FLC
蛋白 K2 亚域)有 3 个高度保守的氨基酸位点,分别为 Leu、Lys 和 Asn(图 3)。此外,在 SVP 蛋
白 K2 和 K3 亚域(或者 FLC 蛋白 K1 亚域和 K2 亚域)均存在蛋白互作的结构模体(motif),即亮
氨酸拉链(leucine zipper)。
上述保守的氨基酸位点以及亮氨酸拉链,有可能对 SVP 或 FLC 蛋白自身聚合起着重要作用。

1 10 20 30 40 50 60 70 80
| | | | | | | | |
BjSVP DHALLSKEIAEKSHRLRQMRGEELQGLNIEELQQLEKALESGLTRVIETKSEKIMNEISYLQRKGMQLMDEN----KRLRQQ
BrSVP DHALLSKEIAEKSHRLRQMRGEELQGLNIEELQQLEKALESGLTRVIETKSEKIMNEISYLQRKGMQLMDEN----KRLRQQ
BoSVP DHALLSKEIAGKSHRLRQMRGEELQGLNIEELQQLEKALESGLTRVIETKSEKIMNEISYLQRKGMQLMDVN----KRLRQQ
AtSVP DHARMSKEIADKSHRLRQMRGEELQGLDIEELQQLEKALETGLTRVIETKSDKIMSEISELQKKGMQLMDEN----KRLRQQ
GmSVP NCSRLSKEVAEKSHQLRQLRGEDLQGLNIEELQQLERSLETGLGRVIEKKGEKIMSEITDLQRKGMLLMEEN----ERLKRH
VvSVP NHSRLSKEVADKSHKLRQMRGEELQGLNIEDLQQLEKSLEAGLSRVIQKKGERIMKEITDLQSKGVQLMEEN----ERLRQQ
AdSVP NLVKLGKDVSEKTTQLRQMRGEDLQGLNINELQHLEKMLEAGLSRVLETKGERIMNEIATLQRKGAELVEEN----QRLKQK
AtFLC SHYELLELVDSK------LVGSNVKNVSIDALVQLEEHLETALSVTRAKKTELMLKLVENLKEKEKMLKEEN----QVLASQ
BjFLC SHDELLELVESK------LVESNLD-VSVESLVQLEDHLETSLSVTRARKTELMLKLVDSLKEKEKLLKEEN----QGLTSQME
AtAP1 EYNRLKAKIELLERNQRHYLGEDLQAMSPKELQNLEQQLDTALKHIRTRKNQLMYESINELQKKEKAIQEQNSMLSKQIKER
BoAP1 EYNRLKAKIELLERNQRHYLGEDLQAMSPKELQNLEQQLDTALKHIRSRKNQLMYDSVNELQRKEKAIQEQNSMLSKQIKER
BrCAL EYSRLKAKIELLERNQRHYLGEDLESISIKELQNLEQQLDTSLKHIRSRKNQLMHESLNHLQRKEKEILEENSMLTKQIKER
AtCAL EYSRLKAKIELLERNQRHYLGEELEPMSLKDLQNLEQQLETALKHIRSRKNQLMNESLNHLQRKEKEIQEENSMLTKQIKER
gabcdefgabcdefgabcd h h abcdefgabcdefga defgabcdefgabcdefgabcdefga bcde
Ⅰ Ⅱ Ⅲ Ⅳ

图 3 K 域序列同源性比对
Br:白菜;Bo:甘蓝;At:拟南芥;Ad:猕猴桃;Gm:大豆;Vv:葡萄;Bj:芥菜。
单下划线表示 K 域,双下划线表示保守氨基酸位点。
Fig. 3 K domain sequence alignment
Br:Brassica campestris;Bo:Brassica oleracea;At:Arabidopsis thaliana;Ad:Actinidia deliciosa;Gm:Glycine max;Vv:Vitis vinifera;
Bj:Brassica juncea. The GenBank numbers of BrSVP,BoSVP,AtSVP,GmSVP,VvSVP,AdSVP,AtFLC,AtAP1,BoAP1,
BrCAL and AtCAL are ABI96182,CAD48304,NP_179840,NP_001240951,XP_002269295,AFA37965,
NP_196576,Z16424,U67451,AY514048 and G26310,respectively.
K domains were single underlined. The conserved amino
acids were double underlined.
4 期 汤青林等:芥菜开花负调因子 SVP 及 FLC 同源互作域筛选和作用强度分析 683

3 讨论
本研究中利用酵母双杂交发现 pGBKT7SVP 与 pGADT7SVP、pGBKT7FLC 与 pGADT7FLC 能
够聚合,从而证明芥菜开花负调因子 SVP 及 FLC 全长蛋白均能够自身聚合,形成同源二聚体(表 2)。
同时通过构建的截短体 SVP1 ~ 5、FLC1 ~ 5 筛选 SVP、FLC 同源互作域。截短体 SVP2 ~ 5 与 SVP、
FLC2 ~ 5 与 FLC 能融合,均能在 QDO/X-α-Gal/ AbA(SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-Gal/AbA)固体
培养基上生长,且为蓝色,激活了酵母的 4 个报告基因 AUR1-C、HIS3、ADE2、MEL1(图 2)。SVP2
或 FLC2(缺少 C 域)能与 SVP(或 FLC)相互作用暗示这一同源二聚化并不由 C 域决定;SVP4
或 FLC4(缺少 M 域)能与 SVP 蛋白(或 FLC)互作暗示这一同源二聚化也不由 M 域决定;SVP5
或 FLC5(缺少 M 域和 I 域)能与 SVP(或 FLC)互作暗示 I 域同样不会决定这一相互作用,SVP1
或 FLC1(只含有 M 域和 I 域)不能与 SVP(或 FLC)互作也证实 M 域和 I 域确实不能决定这一同
源二聚化。因此,无论 M 域、I 域还是 C 域,都不能介导 SVP(或 FLC)自身聚合,很可能是 K
域介导了 SVP 同源二聚化。而 SVP3 或 FLC3(只含有 K 域)与 SVP(或 FLC)相互作用证实了这
一结论,即 K 域可决定并能独立介导了 SVP 或 FLC 自身聚合。
本研究中通过测定 β–半乳糖苷酶活性分析了 SVP 蛋白自身聚合强度,从而发现:尽管 M 域、
I 域或 C 域单独均不能引发 SVP 自身聚合,但却能对这一蛋白互作起到调节作用。推测 MI 域可以
增强这一作用,而 C 域有可能会削弱该作用(表 3)。同时,FLC 自身聚合强度分析发现:K 域是
FLC 蛋白自身聚合必须的,C 域不会增强这一作用,但 I 域会增强 FLC 自身聚合(表 4)。已有研究
发现芥菜 SVP 能与 FLC 相互作用形成异源二聚体 FLC · SVP(汤青林 等,2011,2012a),而本试
验证实了 SVP 能够自身聚合形成同源二聚体(SVP)2,FLC 也可形成蛋白同源二聚体(FLC)2。
由此推测:芥菜开花负调因子 SVP 与 FLC 分子作用模型为同源异源四聚体(FLC)2(SVP)2,但
仍需进行芥菜植株体内蛋白相互作用验证。
本试验得到 K 域是 SVP 或 FLC 同源二聚化的关键结构域。它包含具有两亲媒性的 α 螺旋,具
有 3 个七价重复原子(abcdefg)n,疏水氨基酸主要位于 a 和 d 的位置。含有七价重复区域的子域分
别为 K1、K2 和 K3(Fan et al.,1997;Yang et al.,2003)。但在 K 域的亚域(K1、K2、K3)上有
较小的不同,同源比对发现 K1、K2 和 K3 亚域的保守性存在差异,而且有亮氨酸拉链存在。这可
能暗示,K1、K2 和 K3 亚域对 SVP、FLC 蛋白自身聚合的贡献并非相等。在模式植物拟南芥中,
通过凝胶阻滞和酵母双杂实验也证实了 MIKC 型蛋白 K 域的亚域对蛋白互作的贡献存在差异(Yang
et al.,2003)。此外,既然亮氨酸拉链能使具有 α 螺旋的蛋白相互靠近,促使蛋白相互作用,那么在
SVP 及 FLC 蛋白同源二聚化中,K 域中的这些亮氨酸拉链是否也行使了这样的功能,有待进一步研
究。另外,在 SVP 及 FLC 蛋白 K 域的 K1 与 K2 之间,以及 K2、K3 内部,存在高度保守的多个疏
水氨基酸位点(图 3)。在小麦和拟南芥中利用反向酵母双杂交已表明,K 域调节 MIKC 型蛋白的异
源互作主要通过疏水残基和控制残基起作用(Moon et al.,1999;Yang et al.,2003)。那么介导 SVP
及 FLC 蛋白同源二聚化是否会依靠 K 域这些保守的疏水氨基酸位点以及其他控制性氨基酸残基,
还有待进一步研究。

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