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Construction of a reporter plasmid to identify the secretion and translocation of the type Ⅲ effectors in Xanthomonas campestris pv. campestris

一个用于鉴定十字花科黑腐病菌Ⅲ型效应物分泌与转运的报告质粒的构建



全 文 :植物病理学报
ACTA PHYTOPATHOLOGICA SINICA  44(3): 232 ̄238(2014)
收稿日期: 2013 ̄08 ̄25ꎻ 修回日期: 2014 ̄02 ̄14
基金项目: 国家自然科学基金资助项目(31060017)ꎻ 广西自然科学基金资助项目(2010GXNSFB013020)
通讯作者: 姜伯乐ꎬ研究员ꎬ主要从事植物病原物分子相互作用研究ꎻ Tel:0771 ̄3239255ꎬ E ̄mail: jbl1971@gxu.edu.cn
第一作者: 成春燕ꎬ女ꎬ广西南宁人ꎬ硕士研究生ꎬ主要从事植物病原物分子相互作用研究ꎻ E ̄mail: shendihaiyang@163.comꎮ
一个用于鉴定十字花科黑腐病菌Ⅲ型效应物
分泌与转运的报告质粒的构建
成春燕1ꎬ 杨 威1ꎬ 甘永亮1ꎬ 蒋国凤2ꎬ3ꎬ 杨丽超1ꎬ 阳丽艳1ꎬ 姜伯乐1ꎬ2∗
( 1广西大学生命科学与技术学院ꎬ 南宁 530004ꎻ 2 亚热带农业生物资源保护与
利用国家重点实验室ꎬ 南宁 530004ꎻ 3 广西大学林学院ꎬ 南宁 530004)
摘要:通过免疫检测的方法鉴定十字花科黑腐病菌(Xcc)Ⅲ型效应物的分泌和转运ꎬ将 cyaA 基因克隆至带有 3×FLAG 的
pJXG载体上ꎬ构建带有 3×FLAG和 cyaA基因的报告质粒 pJAAꎬ并用已鉴定为Ⅲ型效应物的 XC_1553启动子区信号区验
证该报告质粒ꎮ 将 pJAA1553三亲导入 Xcc 8004∗和 8004∗ΔhrcVꎬ然后通过Western blotting免疫检测 XC_1553的分泌ꎬ结
果在 8004∗ / pJAA1553的胞外蛋白中检测到了 XC_1553 的分泌ꎬ而在 8004∗ΔhrcV / pJAA1553 的胞外蛋白中没有检测到
XC_1553的分泌ꎮ 通过免疫反应定量检测 8004∗ / pJAA1553和 8004∗ΔhrcV / pJAA1553侵染后植物体内的 cAMP 含量ꎬ结
果发现 8004∗ / pJAA1553侵染后植物体内的 cAMP含量比 8004∗ΔhrcV / pJAA1553侵染后植物体内的 cAMP含量高 15倍ꎮ
结果表明ꎬ报告质粒 pJAA能够应用于鉴定十字花科黑腐病菌的Ⅲ型效应物ꎮ
关键词:十字花科黑腐病菌ꎻ Ⅲ型效应物ꎻ cyaAꎻ 3×FLAGꎻ pJAA
Construction of a reporter plasmid to identify the secretion and translocation of the
type Ⅲ effectors in Xanthomonas campestris pv. campestris  CHENG Chun ̄yan1ꎬ YANG
Wei1ꎬ GAN Yong ̄liang1ꎬ JIANG Guo ̄feng2ꎬ3ꎬ YANG Li ̄chao1ꎬ YANG Li ̄yan1ꎬ JIANG Bo ̄le1ꎬ2   ( 1 College
of Life Science and Technologyꎬ Guangxi Universityꎬ Nanning 530004ꎬ Chinaꎻ 2 State Key Laboratory for Conservation and
Utilization of Subtropical Agro ̄bioresourcesꎬ Nanning 530004ꎬ Chinaꎻ 3 College of Forestryꎬ Guangxi Universityꎬ Nanning
530004ꎬChina)
Abstract: To identify the secretion and translocation of the type Ⅲ effectors in Xanthomonas campestris pv.
campestris (Xcc) by immunological detection methodꎬ the cyaA gene was cloned to pJXG harboring 3×FLAGꎬ
yielding the reporter plasmid pJAA carrying 3×FLAG and cyaA simultaneously. The reporter plasmid was verified
with the promoter and signal region of XC_1553ꎬ a known type Ⅲ effector in Xcc. The plasmid pJAA1553 was
transferred into Xcc 8004∗ and 8004∗ΔhrcV. The secretion of XC_1553 was investigated by Western blotting. As
a resultꎬ the secretion of XC_1553 was detected in extracellular protein of 8004∗ / pJAA1553ꎬ but not in 8004∗
ΔhrcV / pJAA1553. For the translocation of XC_1553ꎬ the cAMP levels in plants inoculated with Xcc strains were
determined. The concentration of cAMP in plants inoculated with 8004∗ / pJAA1553 was 15 times higher than
that inoculated with 8004∗ΔhrcV / pJAA1553. To sum upꎬ the reporter plasmid pJAA can be applied to identify
the type Ⅲ effectors of Xanthomonas campestris pv. campestris.
Key words: Xanthomonas campestris pv. campestrisꎻ type Ⅲ effectorꎻ cyaAꎻ 3×FLAGꎻ pJAA
中图分类号: Q782          文献标识码: A          文章编号: 0412 ̄0914(2014)03 ̄0232 ̄07
 
  3期 成春燕ꎬ等:一个用于鉴定十字花科黑腐病菌Ⅲ型效应物分泌与转运的报告质粒的构建
    十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris
pv. campestrisꎬ简称 Xcc)是一种重要的植物病原
菌ꎬ能在全球范围内侵染所有的十字花科植
物[1ꎬ2]ꎮ 作为 Xcc致病因子之一ꎬⅢ型效应物通过
T3SS直接注入到寄主细胞内ꎬ通过干扰或调节寄
主的正常生理活动ꎬ从而引起寄主局部或系统抗性
反应[3ꎬ4]ꎮ
效应物的检测方法分为体内( in vivo)和体外
( in vitro)2 种ꎮ 体内检测是利用病原菌在非寄主
或抗性寄主的植物组织上诱发过敏反应(HR 反
应)或者是利用免疫化学标记方法鉴定效应物的
转运ꎮ 据报道ꎬ无毒蛋白结构域 AvrBs159~444在含
有抗性基因 Bs1 的辣椒 ECW ̄10R 上引起特异、快
速的 HR反应[5]ꎬ到目前为止ꎬ在 Xcc 8004 中利用
AvrBs159~444作为报告蛋白ꎬ总共鉴定了 12 个Ⅲ型
效应物ꎬ它们的编码基因为 XC _ 0052[6]、 XC _
0241[7]、XC _ 1553[8]、XC _ 2004、XC _ 2081、XC _
2602[9]、XC_2994、XC_2995、XC_3160、XC_3177、
XC_3802以及 XC_4273[10]ꎮ 通过 HR反应并不能
定量检测Ⅲ型效应物ꎬ并且无法确定控制的序列定
位(胞内和胞外)在哪里ꎮ 另一种体内检测Ⅲ型效
应物的方法是利用百日咳博德特氏菌(Bordetella
pertussis)依赖于钙调素的腺苷酸环化酶(CyaA)
结构域作为报告信号[11]ꎬ这种体内检测手段更方
便、灵敏、且能定量检测ꎬ2002 年 Catharina Casper ̄
Lindley等[12]在黄单胞菌中首次利用该蛋白成功
鉴定出新的Ⅲ型效应物ꎮ 随后ꎬ这个报告系统广泛
应用于研究植物病原菌的Ⅲ型效应物的转运与分
泌ꎮ 目前在 X. oryzae pv. oryzae、 Ralstonia so ̄
lanacearum GMI1000 和 Pseudomonas syringae 中ꎬ
利用这个报告系统已经鉴定出一批效应物[13~15]ꎮ
体外检测方法鉴定Ⅲ型效应物分泌[16]ꎬ就是将候
选效应物基因克隆到表达载体上ꎬ表达的蛋白为融
合蛋白ꎬ带有一个很小的标签(epitope tag)比如 3×
FLAGꎬ在离体培养的条件下ꎬ利用Western blotting
检测培养物中目标蛋白的存在ꎮ 大多数Ⅲ型效应
物的体外分泌量很低[17]ꎬ利用 Western blotting 体
外检测Ⅲ型效应物可以减少受这种信号检测的限
制ꎮ 对比以上 3 种效应物检测方法的特点ꎬ更快
捷、灵敏度更高的是以 CyaA和 3×FLAG作为报告
蛋白的检测方法ꎮ 迄今为止ꎬ未见同时利用 CyaA
和 3×FLAG作为报告蛋白检测 Xcc Ⅲ型效应物分
泌和转运的报道ꎮ 由于 3×FLAG 只能用于检测效
应物分泌ꎬCyaA 只能用于检测效应物转运ꎬ因此
需耦合这 2 种方法鉴定Ⅲ型效应物分泌和转运ꎮ
本文将 cyaA 基因克隆至带有 3×FLAG 标签的报
告质粒 pJXG上ꎬ构建了一个可用于体内体外鉴定
Ⅲ型效应物转运的报告质粒ꎬ用已确定为Ⅲ型效应
物的 XC_1553 的启动子信号区验证该报告质粒ꎬ
确认其工作正常ꎬ可用于体内体外鉴定 Xcc 8004
的Ⅲ型效应物ꎮ
1  材料与方法
1.1  菌株、质粒及培养条件
    所用菌株、质粒见表 1ꎮ 大肠杆菌(Escherichia
coli) 培养基 LB ( Lysogeny Broth )ꎬ培养温度
37℃ [18]ꎻ十字花科黑腐病菌培养基 NYG(Nutrient
Yeast Glycerol)ꎬ培养温度 28℃ [19]ꎮ 抗生素利福
平(RifampicinꎬRif) 50 mg / Lꎬ氨苄青霉素(Ampi ̄
cillinꎬAmp) 100 mg / Lꎬ四环素(TetracyclineꎬTc)
E. coli 15 mg / Lꎬ Xcc 5 mg / Lꎬ卡那霉素(Kanamy ̄
cinꎬKan)25 μg / mLꎮ
1.2  引物和试剂条件
    Taq DNA 聚合酶购自 TaKaRa 公司(中国大
连)ꎬT4 DNA连接酶、限制性内切酶购自 Promega
公司(中国上海)ꎬPCR 产物纯化、质粒纯化试剂盒
和 DNA 片段凝胶回收试剂盒均购自华舜公司(中
国上海)ꎬ 3 × FLAG、一抗辣根过氧化物酶标记
山羊抗小鼠 IgG (H+L)和 BeyoECL Plus 均购自
Beyotime公司(中国上海)ꎮ 根据 NCBI 上提供的
百日咳杆菌腺苷酸环化酶基因的核苷酸序列ꎬ按照
实验需要设计出引物 Primer1和 Primer2ꎬ加入酶切
位点 (下划线)及保护碱基ꎬ引物序列:Primer1:
5′ ̄gggtctagacagcaatcgcatcaggctggt ̄3′ ꎻ Primer 2 :
5′ ̄gggctgcaggtcatagccggaatcctggcg ̄3′ꎮ
1.3  分子遗传操作
标准的分子与遗传操作方法按照文献[21]进行ꎮ
以质粒 pMS107为模板ꎬ以 Primer1 和 Primer2
为引物对ꎬPCR 反应扩增出 cyaA 基因片段(对应
4 ̄1 215 bp基因片段)ꎬ经 Xba Ⅰ和 Pst Ⅰ双酶切ꎬ
克隆至测序载体 pK18mob 上ꎬ获得重组质粒
pKcyaA ꎬ送华大基因公司测序ꎮ测序无误后ꎬ将
332
 
植物病理学报 44卷
Table 1  The Xcc strains and plasmids used in the study
Strain or plasmid Relevant characteristics Source or reference
  Strain
8004 Wild type strainꎬ Rifr [19]
8004∗ hrpG E45K mutant of Xcc 8004ꎬ Rifr Our lab’s collection
8004∗ΔhrcV hrcV mutant of Xcc 8004∗ꎬ Rifrꎬ Kanr Our lab’s collection
8004∗ / pJAA1553 8004∗ harboring pJAA1553ꎬ Rifrꎬ Tcr This work
8004∗ΔhrcV / pJAA1553 8004∗ΔhrcV harboring pJAA1553ꎬ Rifrꎬ Kanrꎬ Tcr This work
  Plasmid
pK18mob Sequencing plasmidꎬ Kanr [20]
pK1553 pKl8mob harboring the promoter and signal region of XC_1553ꎬ Kanr Our lab’s collection
pJXG pLAFRJ harboring 3×FLAGꎬ Tcr Our lab’s collection
pKcyaA pK18mob harboring the 4 ̄1 215 bp fragment of cyaAꎬ Kanr This work
pJAA pJXG harboring the 4 ̄1 215 bp fragment of cyaAꎬ Tcr This work
pJAA1553 pJAA harboring the promoter and signal region of XC_1553ꎬ Tcr This work
pMS107 plC20H harboring the 4 ̄1 215 bp fragment of cyaAꎬ Ampr [11]
cyaA基因片段经 Xba Ⅰ和 Pst Ⅰ双酶切ꎬ胶回收
后克隆至带有 3×FLAG 标签的 pJXG上ꎬ获得报告
质粒 pJAAꎮ
    用 EcoRⅠ和 BamH Ⅰ双酶切 pK1553ꎬ获得
XC_1553 启动子信号区片段ꎬ胶回收后克隆至
pJAA的 EcoRⅠ和 BamH Ⅰ位点上ꎬ获得重组质粒
pJAA1553ꎮ
将重组质粒 pJAA1553通过三亲接合ꎬ分别导
入 Xcc 8004∗和 8004∗ΔhrcV 菌株ꎬ在丰富培养基
上分别以 Rifr+Tcr 和 Rif r+Kanr +Tcr 筛选获得三
亲接合子ꎮ
1.4  腺苷酸环化酶活性的检测
1.4.1  样品的制备  使用培养 25 d 的甘蓝京丰 1
号ꎬ蛋白样品的制备过程:把需要检测的菌株用
NYG在 28℃摇瓶培养 16 hꎬ使 OD600大于 0.5ꎻ把
稀释菌液到 OD600 =0.1ꎬ用去掉针头的注射器压渗
约 10 μL 的菌液到叶片中ꎻ压渗后 24 hꎬ收集 1
cm2 的叶片ꎬ置于液氮中研磨ꎻ等液氮挥发完后ꎬ加
入 323 μL 的 1.1 mol / L HClO4 继续研磨ꎻ等叶片
彻底磨碎后ꎬ15 000 g离心 10 minꎻ取上清 280 μL
加入 37.3 μL 6 mol / L K2CO3ꎬ15 000 g 离心 10
minꎻ取上清 200 μLꎬ用真空冷冻抽干机干燥ꎬ干燥
后置于-80℃保存备用ꎮ
1.4.2  样品的检测   将样品蛋白浓度调成一致ꎬ
按照 Amersham 的 cAMP Biotrak Enzymeimmuno ̄
assay(EIA)System使用说明书检测标准样品和待
测样品中 cAMP的含量ꎬ绘制标准曲线ꎬ并按照标
准曲线算出腺苷酸环化酶的活性ꎮ
1.5  Western blotting检测蛋白分泌
细菌胞外蛋白提取方法参见文献[22]ꎮ 细菌
总蛋白的提取过程:取少量提取胞外蛋白时离心下
来的菌体ꎬ重悬于 1 mL ddH2O 中ꎬ使用细胞破碎
仪破胞 3 minꎬ注意冰上操作ꎬ并设置运行 10 s 间
歇 10 sꎬ以保证蛋白质的活性ꎮ 破胞结束后 12 000
rpm离心吸取上清液待用ꎮ 将细菌胞外蛋白和总
蛋白进行 SDS ̄PAGE凝胶电泳ꎬ电泳后电转至 NC
膜上ꎬ用含有 50 g / L 脱脂奶粉的 TBST 缓冲液室
温下封闭 1 hꎮ 吸净封闭液ꎬTBST 洗膜 3 次ꎬ每次
15 minꎮ 加入 1 ∶ 1 000稀释的 3×FLAG一抗 4℃孵
育过夜ꎮ TBST 洗膜 3 次ꎬ每次 15 minꎮ 再加入
1 ∶ 1 000稀释的辣根过氧化物酶标记山羊抗小鼠 IgG
(H+L)ꎬ室温反应 1 hꎮ TBST洗膜 3次ꎬ每次15 minꎮ
加入 BeyoECL Plus的工作液进行显色反应ꎮ
2  结果与分析
2.1  报告质粒的构建
以质粒 pMS107为模板ꎬ以 Primer1 和 Primer2
为引物对ꎬPCR 反应扩增出 cyaA 基因ꎬ产物预期
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  3期 成春燕ꎬ等:一个用于鉴定十字花科黑腐病菌Ⅲ型效应物分泌与转运的报告质粒的构建
大小为 1 212 bpꎬ结果如图 1 ̄A 的泳道 1ꎮ 将扩增
出的 cyaA基因克隆至 pK18mob上ꎬ获得重组质粒
pKcyaA酶切验证图谱如图 1 ̄B 的泳道 2ꎬ3ꎮ 将
pKcyaA送华大基因公司测序ꎬ测序结果完全正确
(结果未显示)ꎮ 实验室已构建了带有 3×FLAG 的
pJXG 载体ꎬ胶回收 1 212 bp cyaA 片段ꎬ克隆至
pJXG 的 Xba Ⅰ和 Pst Ⅰ位点上ꎬ获得重组质粒
pJAAꎬ酶切图谱如图 1 ̄C的泳道 4ꎬ5ꎮ
2.2  报告质粒的验证
用 EcoR Ⅰ和 BamH Ⅰ双酶切 pK1553ꎬ获得
XC_1553启动子信号区片段ꎬ产物预期大小为 894
bpꎬ酶切图谱如图 2 ̄A的泳道 1ꎮ 胶回收 XC_1553
启动子区片段ꎬ将其克隆至报告质粒 pJAA 上ꎬ获
得重组质粒 pJAA1553ꎬ用 EcoR Ⅰ和 Pst Ⅰ双酶
切ꎬ产物预期大小为 2 106 bpꎬ酶切图谱如图 2 ̄B
的泳道 2ꎮ 将重组质粒 pJAA1553 通过三亲接合ꎬ
分别导入 8004∗和 8004∗ΔhrcVꎬ在丰富培养基上
分别以 Rifr+Tcr 和 Rifr +Kanr +Tcr 筛选三亲接合
子ꎬ三亲接合子的 PCR 验证和酶切验证图谱如图
2 ̄C的泳道 3ꎬ4ꎮ
Fig. 1  PCR amplication products of cyaA fragment (A)ꎬ Enzyme ̄digested confirmation
of recombinant plasmid pKcyaA (B) and reporter plasmid pJAA (C)
Lane M: 100 bp DNA ladderꎻ Lane 2ꎬ3: Recombinant plasmid pKcyaAꎻ Lane 4ꎬ5: Reporter plasmid pJAA.
Fig. 2  Enzyme ̄digested confirmation of recombinant plasmid pK1553 (A) and
pJAA1553 (B)ꎬ and PCR verification of transconjugants (C)
Lane M: 100 bp DNA ladderꎻ Lane 1: Recombinant plasmid pK1553ꎻ
Lane 2: Recombinant plasmid pJAA1553ꎻ Lane 3: Transconjugant of 8004∗ / pJAA1553ꎻ
Lane 4: Transconjugant of 8004∗ΔhrcV / pJAA1553.
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植物病理学报 44卷
2.3  腺苷酸环化酶活性检测
2.3.1  标准曲线的绘制  参照 cAMP Biotrak Enz ̄
ymeimmunoassay(EIA) System 试剂盒说明书ꎬ检
测 cAMP标准品的 OD450吸光值(表 2)ꎬ按得到的
数据绘制 cAMP标准曲线(图 3)ꎮ
2.3.2  腺苷酸环化酶活性检测  检测各样品相应
的 cAMP含量(表 3)ꎮ 结果发现 8004∗ / pJAA1553
压渗后植物体内 cAMP 含量是 8004∗ ΔhrcV /
pJAA1553压渗后植物体内 cAMP 含量的 15 倍ꎮ
证明 pJAA报告系统中的 CyaA报告蛋白是可以正
常工作的ꎮ
2.4  Western blotting
    使用 Bradford法定量后ꎬ各取 45 μg蛋白质样
品上样ꎬSDS ̄PAGE电泳后ꎬ18 mA转膜过夜ꎬ杂交
Table 2   The data of cAMP standard curve
assay
The concentration of cAMP standard
sample ( fmol / well)
OD450
0.0 1.834
12.5 1.633
25.0 1.482
50.0 1.265
100.0 1.019
200.0 0.918
400.0 0.645
800.0 0.531
1600.0 0.290
3200.0 0.195
Fig. 3  The standard curve for cAMP
determination
显影后ꎬ结果如图 4 所示ꎮ 8004∗ / pJAA1553 的总
蛋白和胞外蛋白都能检测到分泌信号ꎬ而负对照
8004∗ΔhrcV / pJAA1553 只在总蛋白中检测到分
泌ꎬ胞外蛋白中未检测到分泌ꎬ证明报告质粒 pJAA
中的 3×FLAG标签能正常工作ꎮ
Table 3  The cAMP levels in planta 24 h post
infiltration
Strain
The concentration of cAMP in planta
(nmol / mg total proteins)
8004∗ 0.016±0.0006
8004∗ / pJAA1553 0.271±0.0046
8004∗ΔhrcV 0.018±0.0009
8004∗ΔhrcV / pJAA1553 0.019±0.0023
Fig. 4  Detection of the secretion of XC_1553
by Western blotting
Lane 1: Total protein of 8004∗ / pJAA1553ꎻ Lane 2: Total
protein of 8004∗ △hrcV / pJAA1553ꎻ Lane 3: Extracellular
protein of 8004∗ / pJAA1553ꎻ Lane 4: Extracellular protein of
8004∗△hrcV / pJAA1553.
3  讨论
2002 年到 2009 年ꎬ前人利用能引起辣椒
ECW ̄10R HR反应的 AvrBs1 为报告蛋白ꎬ鉴定出
了十字花科黑腐病菌中的 12 个Ⅲ型效应物ꎮ 近 3
年没有发现关于通过 HR检测Ⅲ型效应物的报道ꎬ
原因有可能是Ⅲ型效应物的分泌量低[17]ꎬ以此方
法的灵敏度ꎬ不足以鉴定出新的Ⅲ型效应物ꎮ 本文
以 3×FLAG 和 cyaA 作为报告基因ꎬ3×FLAG 可用
于检测候选效应物的分泌ꎬCyaA 可用于检测候选
效应物的转运ꎬ通过 Western blotting 和免疫检测
cAMP含量的方法体外体内鉴定 Xcc Ⅲ型效应物ꎬ
这 2种方法灵敏度极高ꎬ可以少受信号弱、难检测
的限制ꎬ使新的Ⅲ型效应物鉴定成为可能ꎮ
全基因组筛选鉴定Ⅲ型效应物的研究ꎬ对于揭
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  3期 成春燕ꎬ等:一个用于鉴定十字花科黑腐病菌Ⅲ型效应物分泌与转运的报告质粒的构建
示植物病原菌的致病机理具有重要意义ꎮ 由于效
应物具有分泌量低、在基因组中多数冗余、保守性
不强等特点ꎬ在基因组时代前期鉴定效应物具有一
定的难度[23]ꎮ 而进入基因组时代后ꎬ越来越多的
植物病原菌被全基因组测序ꎬ使全基因组鉴定Ⅲ型
效应物成为可能ꎮ 目前 Xcc 的 3 个菌株 8004、
ATCC 33913和 B100都相继被测序[1ꎬ24ꎬ25]ꎬ使全基
因组筛选鉴定迫在眉睫ꎮ 本文构建的报告质粒
pJAAꎬ为进一步全基因组筛选鉴定 Xcc 8004 的
Ⅲ型效应物提供了有效的工具ꎮ 目前本实验室已
经利用该质粒进行 Xcc 8004 的Ⅲ型效应物的全基
因组鉴定ꎬ期望找出更多新的Ⅲ型效应物ꎮ
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植物病理学报 44卷
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责任编辑:于金枝
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