全 文 :第19卷 第6期
Vol.19 No.6
草 地 学 报
ACTA AGRESTIA SINICA
2011年 11月
Nov. 2011
光周期与温度对紫花苜蓿phyA
和phyB mRNA表达的影响
樊文娜,严学兵,史莹华,王成章*
(河南农业大学牧医工程学院,河南 郑州450002)
摘要:通过探讨不同温度和不同光周期对紫花苜蓿(Medicago sativa L.)phyA和phyB mRNA含量的影响,以期为
揭示调控苜蓿秋眠性的分子机理提供科学依据。试验采用FQ-PCR SYBR-Green I方法,测定了每天8,12和16h
光照处理条件下3种秋眠类型苜蓿 WL-232(秋眠型,FD2)、ArcherⅡ(半秋眠型,FD5)、WL-525(非秋眠型,FD8)
的phyA和phyB mRNA表达水平;采用半定量RT-PCR,测定了5℃,15℃,25℃和35℃条件下秋眠型苜蓿Vernal
(FD2)的phyA和phyB mRNA表达水平。结果表明:苜蓿存在光周期效应,短日照条件下秋眠型苜蓿phyB mR-
NA表达量最大,相同光照条件下不同秋眠型苜蓿的表达规律为秋眠型>半秋眠型>非秋眠型,且相对于phyA,在
紫花苜蓿绿叶中phyB对光周期的变化反应更敏感。在不同温度条件下秋眠型苜蓿 Vernal的phyA和phyB合成
规律不一致,低温条件下,phyB表达量较高,phyA表达量较低;高温条件下,phyA表达量较高,phyB表达量较低。
上述结果表明phyB在调控苜蓿秋眠中发挥了更重要的作用。
关键词:光周期;温度;苜蓿;phyA;phyB;mRNA表达
中图分类号:Q945.43;S541.9 文献标识码:A 文章编号:1007-0435(2011)06-0975-08
Effects of Photoperiod and Temperature on phyA
and phyB mRNA Expression of Alfalfa
FAN Wen-Na,YAN Xue-Bing,SHI Ying-Hua,WANG Cheng-Zhang*
(Colege of Animal Science and Veterinary Medicine,Henan Agricultural University,Zhengzhou,Henan Province 450002,China)
Abstract:The effects of photoperiod and temperature on fal dormancy of alfalfa were investigated by
measuring phyA and phyB mRNA contents.The mRNA contents of phyA and phyB were observed in
three alfalfa varieties:fal-dormant variety WL-232(FD2);semi-dormant ArcherⅡ(FD5);and non-fal-
dormant WL-525(FD8)under three different day lengths,(8,12and 16h)by FQ-PCR using SYBR-Green
I.The mRNA contents of phyA and phyB in Vernal variety(FD2)under four different temperatures(5,
15,25and 35℃)were measured by semi-quantitative RT-PCR,respectively.Results showed that WL-232
had the highest mRNA expression of phyA and phyB at 8hday length.The mRNA content of WL-232va-
riety was significantly higher than that of ArcherⅡand WL-525.The synthesis of phyA and phyB varied
for different temperatures.The phyB expression was higher than phyA under low temperature conditions
while opposite under high temperature conditions indicating that phyB played a more important role than
phyA in the regulation of alfalfa dormancy.
Key words:Photoperiod;Temperature;Alfalfa;phyA;phyB;mRNA expression
光照和温度是调节植物生长的主要环境因素。
紫花苜蓿(Medicago sativa)是长日照植物,秋冬短
日照下休眠,说明其秋眠(fal dormanacy,FD)存在
着光周期效应[1,2]。已经证明不同苜蓿品种对低温
和短日照的反应有差异,据此可将其分为秋眠型
(fal dormanacy,1~3级)、半秋眠型(semi-fal dor-
mancy,4~6级)和非秋眠型(non-fal dormancy,7
~9级)3种类型[3]。Butler[4]等1959年研究发现,
植物感受和测量日照长短是通过叶片中的光敏色素
完成的,双子叶植物中至少存在5种不同的光敏色
收稿日期:2011-07-07;修回日期:2011-08-23
基金项目:国家牧草产业技术体系建设项目(CARS-35)资助
作者简介:樊文娜(1981-),女,河南许昌人,助研,硕士,主要从事牧草栽培生理研究,E-mail:chou0516@163.com;*通信作者 Author for
correspondence,E-mail:wangchengzhang@263.net
草 地 学 报 第19卷
素基因,即phytochrome A(phyA),phytochrome B
(phyB),phyC,phyD和phyE。研究拟南芥(Arabi-
dopsis thaliana)中光敏色素家族基因功能的结果
表明:phyA和phyB是在正常光照条件下表现最突
出的2种光敏色素基因[5],而phyD与phyE,phyC
与phyB在功能上有重叠[6,7]。研究发现,日照长度
的变化通过phyA的表达来实现调控植物的开花和
休眠[8],phyB作为绿色植物主要光受体通过光周
期调控或参与苜蓿的秋眠[9],且光反应通过光敏色
素影响了温度反应[10~12],温度反应通过FT基因直
接影响phyB来调控开花时间[11]。光敏色素与光
照、温度之间存在着复杂的反应,为研究苜蓿的秋眠
性和光周期、温度的关系,本试验测定了不同光周期
和不同温度条件下苜蓿的phyA,phyB mRNA表达
水平,为揭示其对苜蓿秋眠性的调控机理提供科学
依据。
1 材料与方法
1.1 试验设计
光周期试验:采用2因子3水平设计,采用荧光
定量PCR来测定phyA,phyB mRNA表达量,参试
的3种秋眠类型紫花苜蓿品种为:秋眠型品种 WL-
232(FD2),半秋眠型品种ArcherⅡ(FD5),非秋眠
型品种 WL-525(FD8)。盆栽,25℃,设每天8h
(short day,SD)、12h (middle day,MD)和16h
(long day,LD)3个不同的光照时间处理。试验期
30d,每处理重复3次,每重复1盆,每盆6株。
温度试验:采用 RT-PCR来测定phyA,phyB
mRNA表达量,实验室盆栽,参试苜蓿品种为 Ver-
nal(FD2),每天8h光照,设5℃,15℃,25℃,35℃
共4个温度梯度。试验期30d,每处理重复3次,每
重复1盆,4×1试验设计。
1.2 试验材料及试剂
光周期试验:所用材料为大田生长4个月的植
株,移栽入花盆后直接放入EPQ人工气候箱进行处
理,温度为25℃,光照强度5000lx,湿度50%~
60%,定时浇水。植株在光周期处理30d时,随机
摘取各植株的顶芽和上部叶片,液氮中研磨后,
-80℃冰箱中保存待用。
温度试验:采用大田生长期为4个月的秋眠型
苜蓿Vernal植株,除温度设为不同处理外,仪器、试
验条件及取样同上。
1.3 phyA和phyB引物设计
光周期试验中,通过荧光PCR试验测定 mR-
NA表达量3个基因的引物,参考本实验室[13]提供
的肌动蛋白基因Actin和phyA,phyB 的基因全
长[14,15],设 计 引 物 如 下:引 物 Actin:5′-GC-
CGACCTCGTCATACTGGT-3′,5′-TCTTTTGGAT-
TGGGCTTCGT-3′,扩增产物的长度为80bp;引物
A:5′-TGACAAACTACCAAACCCCAAAG-3′,5′-
ATGACAGCGATGAAGATGGAGA-3′,扩增产物
的长度为 82bp;引 物 B:5′-GCTTGTGCAGC-
CAGTTTGTTT-3′,5′-CAATCCCAACACCATCT-
TCATC-3′,扩增产物的长度为146bp。
温度试验:Actin引物使用参考[13],引物 Ac-
tin:5′-GGCTGGATTTGCTGGAGATGATGC-3′,
5′-CAATTTCTCGCTCTGCTGAGGTGG-3′,扩增
片段的长度为572bp。phyA和phyB引物使用本
实验室克隆基因片段设计的引物[14,15],其中:引物
A:5′-TTGGGGTTTGGTAGTTTGCCAT-3′,5′-
AGCCTTGAATGATGATCTTGGATGC-3′,扩增
产物 的 长 度 为 549bp;引 物 B:5′-AGCAACA
TATCACACAACAGAGTC-3′,5′-TTGGTTTG-
CATTATCCTGCTACTG-3′,扩增产物的长度为
475bp。3个基因的PCR产物均已进行过克隆测
序、鉴定[13~15]。
管家基因在各种组织中恒定表达,因此可作为
标准参照物比较样本来源不同的目的基因表达量的
差异。Actin是管家基因之一,可以作为内标参照,
研究其他基因mRNA丰度变化,本试验采用内参基
因进行phyA和phyB mRNA表达量的测定。
1.4 光周期试验Actin,phyA,phyB片段克隆测序
与FQ-PCR检测
提取苜蓿中总RNA,以此为模板进行RT-PCR
扩增,扩增产物用1%琼脂糖凝胶电泳鉴定。对目
的片段进行切胶、纯化回收,将3个基因分别与载体
pMD19-T连接,转化TG1感受态细胞,蓝白菌落进
行初步筛选,随机挑取白色菌落进行菌液培养,然后
将含pGM-T-Actin,phyA,phyB质粒的菌液送宝生
物工程(大连)有限公司进行测序鉴定。
1.5 总RNA提取与检测
试验样品总RNA的提取按照RNAiso Plus说
明书进行,提取的 RNA质量由 OD260/OD280比值
或1.0%普通琼脂糖凝胶电泳鉴定。反转录反应
679
第6期 樊文娜等:光周期与温度对紫花苜蓿phyA和phyB mRNA表达的影响
前,将所有试验样品提取的 RNA浓度调为基本
一致。
1.6 Actin,phyA,phyB反应条件的优化
光周期试验中,反转录反应液的配制及其反应
条件如下:25mmol·L-1 MgSO42μL,2×Bca 1st
Buffer 5μL,RNase Free dH2O 0.75μL,dNTP
Mixture(各10mmol·L-1)0.5μL,RNase Inhibi-
tor(40U·μL
-1)0.25μL,BcaBEST Polymerase
(22U·μL
-1)0.5μL,Random 9mers 0.5μL,
Positive Control RNA 0.5μL,10μL 反应体系
SYBR Premix Ex TaqTM(2×)10.0μL,PCR For-
ward Primer(10μmol·L
-1)0.4μL,PCR Reverse
Primer(10μmol·L
-1)0.4μL,ROX Reference
Dye(50×)0.4μL,DNA模板2.0μL,RNase Free
dH2O 6.8μL,20μL反应体系。反应参数为94℃
预变性2min,94℃变性10s,60℃退火15s,72℃延
伸30s;40个循环,荧光信号收集设在72℃(每循环
第3步反应时);溶解度曲线程序设置默认为:95℃,
2min;72℃,1min;95℃,30s;进步0.5℃·s-1,
30℃,1min。在运行之前,调节增益使荧光本底值
≤20,也可根据试剂的实际情况调整;仪器检测通道
选择设定为F1(SYBR GreenⅠ)通道。在每份样
品中检测phyA,phyB和Actin基因的CT值,并进
行3次PCR重复,取3次PCR ET值的平均值,根
据标准曲线计算定量结果,计算校正值。
温度试验:反转录反应同上,PCR反应条件为:
25mmol·L-1 MgSO43μL,5×Bca 2nd Buffer 8
μL,上下游引物各0.5μL,dH2O 27.75μL,50μL
反应体系;3个基因PCR反应温度均设为94℃预变
性5min;94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸
45s,30个循环;72℃终延伸5min。
1.7 试验结果计算
光周期试验:测定phyA和phyB mRNA表达
量,选用管家基因Actin为内参,结果以2-△Ct表示,
其中,△Ct为:Ct目的基因-Ct参比基因[16]。
温度试验:分别取phyA和phyB PCR产物和
Actin PCR产物,DNA marker 5μL,用2.5%琼脂
糖凝胶电泳检查,在凝胶成像分析系统(AlphaIm-
ager)上摄像并 对 电 泳 条 带 进 行 灰 度 分 析,以
phyA,phyB PCR产物与相应的 Actin PCR产物的
IOD的比值来表示phyA和phyB mRNA的表达
量[17]。
2 结果与分析
2.1 Actin,phyA,phyB片段克隆测序与FQ-PCR
检测结果
使用设计的引物得到与预期扩增长度相符的片
段,扩增得到的产物为特异条带,单一清晰,符合荧
光PCR对引物长度、特异性的要求,大小与预期80
bp,82bp和146bp的目的片段相符(图1)。
RT-PCR琼脂糖凝胶电泳:通过测序分析,其结
果与设计引物所用模板序列一致,NCBI中BLAST
的结 果 与 蒺 藜 苜 蓿 (Medicago truncatula)的
MTYF9_FA_FB_FC1G-O-4基因、紫花苜蓿品种
WL-525HQ 的 phyA、紫花苜蓿品种 Vernal的
phyB基因序列一致,说明由引物得到的 Actin,
phyA,phyB的RT-PCR产物与目的基因相符。测
序结果NCBI序列比对表明,序列已正确插入到质
粒载体中(图2~4)。
图1 紫花苜蓿phyA,phyB与Actin 基因片段
RT-PCR琼脂糖凝胶电泳检测图
Fig.1 RT-PCR products of Actin,phyA and phyB
in alfalfa(agarose gel electrophoresis)
荧光定量PCR扩增曲线:由图5和图6可知,
phyA,phyB与Actin荧光定量PCR扩增曲线的峰
型正常,可用于phyA和phyB的相对定量。
2.2 光周期对不同秋眠类型紫花苜蓿品种phyA
和phyB mRNA表达量的影响
由表1可知,不同的光周期处理对同一个紫花
苜蓿品种phyA mRNA相对含量的影响程度有差
异,但无明显的规律性。秋眠2级品种8h和16h
的phyA mRNA相对含量接近,差异不显著,但二
者均显著高于12h光照处理(P<0.05);秋眠5级
品种以12h光照处理phyA mRNA相对含量最高,
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草 地 学 报 第19卷
8h次之,8h和12h间差异不显著但均显著高于
16h光照处理(P<0.05);秋眠8级品种8h光照
处理phyA mRNA相对含量显著高于12h和16h
光照处理(P<0.05),后二者差异不显著。由此可
知,尽管3个秋眠类型苜蓿品种不同光周期之间
phyAmRNA均无明显的规律性,但他们都有在短
879
第6期 樊文娜等:光周期与温度对紫花苜蓿phyA和phyB mRNA表达的影响
表1 不同光周期和秋眠类型对紫花苜蓿phyA mRNA的表达量
Table 1 Effects of photoperiod and FD variety on phyA mRNA relative contents
苜蓿品种Varieties 8h 12h 16h
秋眠2级 WL-232(FD2) 0.00382±0.00036Aa 0.00198±0.00042Bb 0.00372±0.00023Aa
秋眠5级ArcherⅡ(FD5) 0.00360±0.00092Aa 0.00430±0.00038Aa 0.00022±0.00005Cb
秋眠8级 WL-525(FD8) 0.00439±0.00085Aa 0.00095±0.00025Cb 0.00080±0.00034Bb
注:同行肩标小写字母不同表示光周期差异显著(P<0.05),同列肩标大写字母不同表示秋眠型差异极显著(P<0.01);下同
Notes:Different smal letters in the same line mean significant difference between different photoperiods(P<0.05),different capital let-
ters in the same column mean significant difference between different FD varieties(P<0.01);the same as below
表2 不同光周期和秋眠类型对紫花苜蓿phyB mRNA表达量的影响
Table 2 Effects of photoperiod and FD variety on phyB mRNA relative contents
苜蓿品种varieties 8h 12h 16h
秋眠2级 WL-232(FD2) 0.98019±0.04755Aa 0.97172±0.08411Aa 0.27251±0.02632Ab
秋眠5级ArcherⅡ(FD5) 0.26167±0.05589Bb 0.43837±0.00912Ba 0.00800±0.00148Cc
秋眠8级 WL-525(FD8) 0.02687±0.00542Cb 0.02810±0.00240Cb 0.03825±0.00211Ba
日照下合成更高量的phyA mRNA的趋势。由表1
可知,同一光周期处理对不同秋眠类型品种phyA
mRNA相对含量的影响也无明显规律性。在8h
光照处理时,3个秋眠类型苜蓿品种phyA mRNA
相对含量无显著差异;就12h光照处理时phyA
mRNA相对含量来说,秋眠5级品种>秋眠2级品
种>秋眠8级品种,且三者之间均差异显著(P<
0.05);在16h光照处理时,秋眠2级品种phyA
mRNA的相对含量最高,依次为秋眠8级品种和秋
眠5级品种,3个品种之间差异显著(P<0.05)。
由表2可知,不同的光周期处理对同一紫花苜
蓿品种的phyB mRNA相对含量的影响程度不同。
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草 地 学 报 第19卷
秋眠2级品种8h和12h光照处理phyB mRNA的
相对含量显著高于16h光照处理(P<0.05);秋眠
5级品种12h光照处理phyB mRNA相对含量最
高,8h光照处理次之,16h光照处理phyB mRNA
相对含量最低,三者之间差异显著(P<0.05);秋眠
8级品种16h光照处理phyB mRNA相对含量显著
高于8h和12h光照处理(P<0.05)。由以上结果
可知,秋眠2级品种表现为较短光照时间能合成更
高的phyB mRNA,秋眠5级品种在中短日照条件
下比长日照能合成较高的phyB mRNA,秋眠8级
品种均表现为较长光照时间能合成高含量的phyB
mRNA。由表2还可看出,在同一光周期条件下,不
同品种的phyB mRNA相对含量变化规律趋势明
显。8h和12h光照处理phyB mRNA相对含量均
表现为:秋眠2级品种>秋眠5级品种>秋眠8级
品种,且品种之间均差异显著(P<0.05);16h光照
处理时,秋眠2级品种的phyB mRNA相对含量显
著高于秋眠5级和秋眠8级品种(P<0.05)。
2.3 不同温度对秋眠型紫花苜蓿phyA,phyB mR-
NA表达量的影响
由于采用凝胶成像分析系统上摄像并对电泳条
带进行灰度分析,受影响因素较多,不能精确得出
mRNA的相对含量,但能分析出不同温度条件下
phyA,phyB mRNA的表达趋势(图7)。
图7 phyA和phyB RT-PCR产物凝胶电泳分析
Fig.7 Gel electrophoresis analysis of phyA,phyB RT-PCR products
从Vernal在不同温度条件下phyA mRNA的
表达量来看,在25℃和35℃条件下较高,在5℃和
15℃条件下mRNA表达量相对较少,说明高温有利
于phyA mRNA的表达;由图8可知,5℃和15℃低
温条件下,phyB mRNA表达量较高,25℃和35℃
条件下 mRNA表达量相对较少,说明低温有利于
phyB mRNA的表达。
图8 紫花苜蓿phyA和phyB mRNA表达相对含量
Fig.8 mRNA relative contents of phyA and phyB in alfalfa
3 讨论
在光周期试验中要特别注意对最适引物的筛
选,由于SYBR Green I荧光染料为双链DNA特异
性染色,它不仅和靶基因的扩增产物结合,也会同非
特异性PCR产物结合,从而影响结果判断,故引物
设计及PCR条件优化显得尤为重要,要求务必确保
PCR扩增产物的条带清晰且单一。荧光定量产物
长度为80~150bp最好,最长不要超过300bp,试
验中3个基因引物的扩增片段均在80~150bp之
间,凝胶电泳条带清晰且单一,测序结果也很理想;
其扩增出来的3个基因的熔解曲线非常标准,没有
杂峰和引物二聚体的出现,可以进行下一步荧光定
量试验。
秋眠是一种特殊的休眠方式,即内生性休眠。
由于苜蓿的秋眠性与其抗寒性正相关,故多年来有
关苜蓿秋眠性的调控机理研究多集中在不同秋眠类
型苜蓿与抗寒性有关的物质代谢上[18~20],从光周期
尤其是从分子水平研究苜蓿秋眠性调控机理的研究
很少。David研究认为,昼夜节律循环(生物钟)、日
照长度、温度通过调控phyA和phyB含量、开花相
关基因(FT,CEN,AP1等)表达量、CO含量、激素
含量等调控植物的休眠[21];Kuhn N的试验也证明
phyA 和phyB 基因的表达受昼夜节律循环调
089
第6期 樊文娜等:光周期与温度对紫花苜蓿phyA和phyB mRNA表达的影响
控[22],昼夜节律功能似乎在板栗(Castanea mollis-
sima)的生态休眠中停止作用,但其相关基因在内生
性休眠和幼苗中却被启动[23,24]。相似的现象也发
生在日照长度诱导葡萄叶(Vitis spp.)的休眠中,在
这些试验中,phyA和phyB含量在正常生长季节不
稳定,一旦被转移至短日照诱导休眠的条件下,
phyA和phyB不稳定的表达现象都停止,取而代之
的是其表达量均出现增加[22,25];Mazzela和Seo M
[26,27]证明,phyB直接或间接调控了 ABA的合成,
进而影响拟南芥的休眠。
Franklin[28]研究认为,光和温度调节植物生命
循环,在植物生长的过程中具有复杂的互作效应,通
过调节光受体相关基因、激素信号方式来调节生命
体征,以适应自然环境变化。在植物的秋冬季休眠
中,短日照是其主要的调控因子,在杨树(Populud
sp.)、葡萄、狗木(Cornus sericea)中均得到了证
实[29~31],并且phyA表达量的变化可改变其对休眠
诱导光照时间的阈值,在短日照时phyA的超表达
可抑制休眠诱导,改变其日照长度能改变其休眠反
应[30~32]。phyA和phyB的表达在光信号通路中发
挥着重要的作用,拟南芥中96%光诱导的基因是通
过phyA和phyB来调节的[33];Heschel[34]研究发
现,拟南芥在不同温度条件下,发芽需要不同的光敏
色素,在温度较低时,phyE发挥主要作用;在温度较
高时,phyA发挥主要作用;在温度变化较大的情况
下,phyB发挥主要作用。
本试验研究了3个不同秋眠类型苜蓿品种在短
日照(8h)、中日照(12h)和长日照(16h)条件下叶
片中的phyA 与phyB mRNA 的表达量。结果表
明,3个不同秋眠类型苜蓿品种在不同的光周期条
件下phyA mRNA的表达量均无明显的规律性,但
似乎3个品种均是在8h光照下其合成量高;无论
是8h光照,还是12h和16h光照,3个品种之间
的phyA mRNA 含量均无明显变化规律,说明
phyA可能和苜蓿的秋眠性无太大关系。从phyB
mRNA表达量来看,不同光周期之间比较,无论是
秋眠型的2级品种 WL-232还是半秋眠的5级品种
ArcherⅡ均是在8h和12h光照条件下含量高;同
一个光周期条件下的phyB mRNA含量,均呈现出
秋眠2级品种>半秋眠的5级品种>非秋眠的8级
品种的趋势,说明phyB很可能是调控苜蓿秋眠的
主要光受体,在日照较短条件下通过提高秋眠型和
半秋眠型苜蓿品种phyB mRNA的合成量从而调控
了这2类苜蓿的秋眠;而在长日照条件下,phyB
mRNA的合成量小,从而使其秋眠不能表达。phyB
mRNA合成量与其苜蓿叶片中的phyB蛋白表达趋
势一致[9],说明调控苜蓿秋眠在phyB的转录水平
上进行,与 Kuhn N在葡萄中的研究结果相似[22]。
苜蓿为长日照植物,短日照和中日照都为苜蓿生长
创造了较强的逆境效应,苜蓿为应对这种不良的环
境刺激,通过加速phyB合成,诱导苜蓿进入秋眠,
尤其短日照条件下2级品种即秋眠型苜蓿品种
phyB表现最为明显,合成量也最大。
本研究温度试验结果表明,phyA 在25℃和
35℃较高温度条件下合成量大于低温条件下的合成
量,而phyB相反,5℃和15℃较低温度条件下的合
成量高于25℃和35℃较高温度条件下的合成量。
可能phyA和phyB与温度、光周期在调控苜蓿秋眠
性上存在互作效应。
4 结论
4.1 苜蓿的秋眠存在光周期效应,短日照条件下秋
眠型phyB mRNA表达量最大,相同光照条件下不
同秋眠型苜蓿的表达规律:秋眠型>半秋眠型>非
秋眠型,且相对于phyA,在紫花苜蓿绿叶中phyB
对光周期的变化反应更敏感。
4.2 在不同温度条件下秋眠型苜蓿phyA和phyB
合成规律不一致,phyB在调控苜蓿秋眠中发挥了更
重要的作用,可能光敏色素在温度反应中存在互作
效应,具体机理有待于进一步研究。
4.3 温度与光周期都参与了对苜蓿秋眠的调控。
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(责任编辑 李美娟)
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